Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139A1Q1

Protein Details
Accession A0A139A1Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
495-517GKGRARERSTRHRSNANDRRRRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
494-517MGKGRARERSTRHRSNANDRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 13, cysk 11, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR006595  CTLH_C  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR006594  LisH  
IPR045184  SMU1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PF17814  LisH_TPL  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50897  CTLH  
PS50896  LISH  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MTSLEIESSDVIRLIEQFLKENNLLRTLRTLQEESTIHLNTVDSVESFSSSILSGDWESVLKTTTQLTLPPKKLVDLYEQIVLELVEMRETAAARSLLRQTEPMQVLKDNQPERYLHLEHLLSKTFFDEREAYGEDSSKQRRRQLIAQALSTEVTVVPPARLLTLLGQSLKWQYAQGLIPPETAYDLFRGTAPTQRAEEDAVPGLCYNSIKFPRKQHPESIAFSPDGQYLVTGGVDGIIEVYNYMTGKLRKDLQYQLEGNLMLMDDAVLSLGFSRDGEHLASGSQDGRIKVWRVSTGACVRRFSPAHSQGVTAVGFHRDGGEVLSGSFDGSVRIHGIKSGKLLRDFRGHTSFVNDALFSHDGTRVMSGSSDGTFRIWDAKSTALLHTLHLHEGGLAGAGVSAPTVARIVQVPRNAEQVVVVNRSGWCYLVSVKGTLIRSFHPPPTAGAPTPDFVTAVLSPRGELLQNSQRFLSLDDGRSTGPRMHVRFPPGMGMGKGRARERSTRHRSNANDRRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.17
3 0.17
4 0.19
5 0.21
6 0.26
7 0.27
8 0.32
9 0.31
10 0.34
11 0.34
12 0.32
13 0.36
14 0.35
15 0.38
16 0.38
17 0.38
18 0.31
19 0.38
20 0.37
21 0.34
22 0.35
23 0.31
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.17
28 0.18
29 0.16
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.07
40 0.09
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.13
52 0.13
53 0.19
54 0.27
55 0.36
56 0.39
57 0.43
58 0.42
59 0.41
60 0.43
61 0.4
62 0.38
63 0.34
64 0.32
65 0.32
66 0.31
67 0.29
68 0.27
69 0.24
70 0.16
71 0.14
72 0.11
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.16
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.24
87 0.22
88 0.3
89 0.32
90 0.31
91 0.29
92 0.28
93 0.32
94 0.35
95 0.41
96 0.35
97 0.34
98 0.35
99 0.34
100 0.37
101 0.39
102 0.35
103 0.28
104 0.3
105 0.29
106 0.29
107 0.31
108 0.3
109 0.24
110 0.22
111 0.23
112 0.2
113 0.18
114 0.19
115 0.18
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.21
122 0.2
123 0.24
124 0.32
125 0.35
126 0.38
127 0.44
128 0.49
129 0.53
130 0.59
131 0.62
132 0.63
133 0.6
134 0.56
135 0.5
136 0.44
137 0.39
138 0.32
139 0.22
140 0.12
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.13
159 0.11
160 0.09
161 0.13
162 0.13
163 0.15
164 0.18
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.15
170 0.15
171 0.12
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.15
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.18
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.12
196 0.2
197 0.25
198 0.3
199 0.38
200 0.47
201 0.56
202 0.59
203 0.59
204 0.6
205 0.6
206 0.59
207 0.54
208 0.46
209 0.37
210 0.34
211 0.28
212 0.2
213 0.15
214 0.11
215 0.08
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.07
233 0.09
234 0.1
235 0.13
236 0.17
237 0.2
238 0.24
239 0.28
240 0.28
241 0.33
242 0.33
243 0.31
244 0.28
245 0.25
246 0.21
247 0.16
248 0.12
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.13
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.17
280 0.16
281 0.17
282 0.21
283 0.27
284 0.32
285 0.32
286 0.31
287 0.3
288 0.35
289 0.35
290 0.33
291 0.35
292 0.34
293 0.36
294 0.36
295 0.35
296 0.3
297 0.31
298 0.28
299 0.18
300 0.13
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.17
326 0.22
327 0.24
328 0.29
329 0.32
330 0.33
331 0.39
332 0.4
333 0.41
334 0.4
335 0.38
336 0.32
337 0.33
338 0.31
339 0.25
340 0.23
341 0.17
342 0.13
343 0.16
344 0.16
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.13
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.17
368 0.19
369 0.19
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.2
374 0.2
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.06
382 0.05
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.08
395 0.12
396 0.17
397 0.21
398 0.24
399 0.26
400 0.3
401 0.29
402 0.26
403 0.23
404 0.24
405 0.24
406 0.23
407 0.22
408 0.2
409 0.2
410 0.22
411 0.21
412 0.16
413 0.12
414 0.12
415 0.14
416 0.17
417 0.18
418 0.17
419 0.18
420 0.22
421 0.24
422 0.24
423 0.24
424 0.21
425 0.27
426 0.31
427 0.33
428 0.31
429 0.3
430 0.31
431 0.35
432 0.38
433 0.32
434 0.32
435 0.3
436 0.28
437 0.29
438 0.26
439 0.2
440 0.15
441 0.18
442 0.15
443 0.16
444 0.18
445 0.16
446 0.16
447 0.17
448 0.18
449 0.16
450 0.15
451 0.19
452 0.26
453 0.29
454 0.31
455 0.3
456 0.3
457 0.3
458 0.31
459 0.31
460 0.27
461 0.28
462 0.29
463 0.3
464 0.3
465 0.31
466 0.31
467 0.28
468 0.29
469 0.34
470 0.36
471 0.4
472 0.45
473 0.5
474 0.51
475 0.49
476 0.46
477 0.41
478 0.4
479 0.35
480 0.33
481 0.33
482 0.33
483 0.37
484 0.36
485 0.41
486 0.42
487 0.5
488 0.55
489 0.6
490 0.66
491 0.71
492 0.74
493 0.76
494 0.79
495 0.82
496 0.84
497 0.83