Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139AFB3

Protein Details
Accession A0A139AFB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-158ERKTQFSKAKYLKRKEQKFGKIFRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MADDGSSNETVGPDKWVYIEMPSGNSKLAFLKTDSVIKLGKFGSFRASDVIGKPYGLPYEIVENDRACFAGRGSLFDDFEVDEDPDASNKEIFATRDAQKLSNAEIQQMKNETLEGKISSETLIQRVAENNATFERKTQFSKAKYLKRKEQKFGKIFRLFDPTPSLLCQYYLDMNPSKTKDLRPDSLSQMLSFGNVRSGANVAVVDEIGGLLIGAVMERLGSRGTVCAIYDGDTESYECLPYLNWKQKDRDRLHTLPWNRILTNLTDPHASSHKIERVKRRNERYQAYQSARRILEEGGFDCLITASQYSPSSIIQSLSHLIRGSGNLVVYSGYKEPLPPAYSDLRSDTNFVNVQLTETFTREYQAKPGRFHPLMNTNGNSGWLLTAIRVVSKPRPMNGSSSNVVEGADHEQTHRKRQRTDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.17
4 0.17
5 0.17
6 0.21
7 0.18
8 0.21
9 0.23
10 0.24
11 0.23
12 0.23
13 0.22
14 0.21
15 0.22
16 0.21
17 0.2
18 0.23
19 0.25
20 0.31
21 0.3
22 0.29
23 0.29
24 0.27
25 0.3
26 0.26
27 0.27
28 0.22
29 0.23
30 0.26
31 0.25
32 0.26
33 0.24
34 0.26
35 0.25
36 0.26
37 0.3
38 0.23
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.2
43 0.17
44 0.16
45 0.13
46 0.19
47 0.21
48 0.22
49 0.23
50 0.22
51 0.22
52 0.22
53 0.21
54 0.15
55 0.13
56 0.11
57 0.15
58 0.15
59 0.17
60 0.19
61 0.22
62 0.21
63 0.21
64 0.21
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.12
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.21
82 0.22
83 0.27
84 0.29
85 0.28
86 0.28
87 0.28
88 0.29
89 0.3
90 0.28
91 0.27
92 0.31
93 0.31
94 0.32
95 0.33
96 0.29
97 0.23
98 0.23
99 0.19
100 0.15
101 0.16
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.18
119 0.2
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.21
124 0.24
125 0.29
126 0.34
127 0.35
128 0.45
129 0.51
130 0.58
131 0.65
132 0.7
133 0.73
134 0.76
135 0.81
136 0.8
137 0.81
138 0.82
139 0.8
140 0.79
141 0.79
142 0.75
143 0.68
144 0.62
145 0.6
146 0.49
147 0.43
148 0.41
149 0.32
150 0.27
151 0.25
152 0.24
153 0.16
154 0.17
155 0.16
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.17
162 0.2
163 0.21
164 0.23
165 0.23
166 0.25
167 0.3
168 0.34
169 0.37
170 0.37
171 0.39
172 0.39
173 0.42
174 0.4
175 0.31
176 0.27
177 0.22
178 0.19
179 0.16
180 0.12
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.1
229 0.17
230 0.25
231 0.3
232 0.34
233 0.41
234 0.46
235 0.56
236 0.57
237 0.58
238 0.58
239 0.56
240 0.58
241 0.6
242 0.58
243 0.54
244 0.55
245 0.48
246 0.4
247 0.38
248 0.34
249 0.28
250 0.31
251 0.26
252 0.21
253 0.19
254 0.19
255 0.2
256 0.22
257 0.2
258 0.17
259 0.21
260 0.26
261 0.32
262 0.38
263 0.46
264 0.54
265 0.63
266 0.71
267 0.74
268 0.78
269 0.79
270 0.8
271 0.78
272 0.77
273 0.75
274 0.71
275 0.69
276 0.62
277 0.61
278 0.55
279 0.46
280 0.39
281 0.3
282 0.27
283 0.22
284 0.21
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.05
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.12
303 0.14
304 0.16
305 0.16
306 0.17
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.12
313 0.12
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.17
325 0.18
326 0.17
327 0.2
328 0.25
329 0.27
330 0.29
331 0.3
332 0.29
333 0.28
334 0.3
335 0.26
336 0.25
337 0.25
338 0.24
339 0.23
340 0.19
341 0.2
342 0.18
343 0.2
344 0.17
345 0.17
346 0.18
347 0.15
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.25
352 0.33
353 0.37
354 0.39
355 0.44
356 0.51
357 0.51
358 0.51
359 0.49
360 0.48
361 0.49
362 0.52
363 0.48
364 0.41
365 0.4
366 0.39
367 0.31
368 0.23
369 0.17
370 0.12
371 0.11
372 0.08
373 0.11
374 0.1
375 0.12
376 0.13
377 0.18
378 0.23
379 0.33
380 0.37
381 0.38
382 0.44
383 0.44
384 0.49
385 0.5
386 0.51
387 0.44
388 0.42
389 0.39
390 0.33
391 0.31
392 0.24
393 0.2
394 0.19
395 0.19
396 0.17
397 0.18
398 0.27
399 0.31
400 0.42
401 0.49
402 0.51