Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139AFA1

Protein Details
Accession A0A139AFA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-195LPATHSQKKKKYIKPGETREGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-188KKKKYIKP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.165, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR005825  Ribosomal_L24/26_CS  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS01108  RIBOSOMAL_L24  
Amino Acid Sequences MASGAPRTHELKYGLQRVDSSTEVAGEELISGQRSEDQETSLLGGRARAATSMSADELAAAQIIAEADGTAVPSLDQSLTLQVPIIQQNAVPGLDALATEEEKYRHDVSLRPDEPKLEDYDGVPVELFGSALLRGMGWKEGQAIGKNKKNALIRPIEYVPRPALLGLGAKPDELPATHSQKKKKYIKPGETREGSKREYKPIVTDDGRVRHYREVGAPEDDRLRESSSGLKRGDAIVVVLGKHRGRTGTVEDIRKRKGRDTELSVELDDSRERKIFFEDEVERRRGDSASRTSERAEHAFNKRKSRSTSPGGSKSDEGEDGLPKRTDADKGLTIYTEEPTWVHAHTRVRVISEAVGTLHYRKKCLVLDTPTPSSATIQTDRGEIIENVSQRHLETIVPSVGQKVLVVGRVGNSARRWYGHIGLILEKKRDTEQVVVEMEDGEVDKFSYDNVCEYVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.47
4 0.45
5 0.45
6 0.37
7 0.3
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.18
12 0.14
13 0.1
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.13
21 0.15
22 0.19
23 0.19
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.15
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.08
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.05
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.14
71 0.16
72 0.16
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.16
77 0.14
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.17
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.23
95 0.28
96 0.38
97 0.39
98 0.38
99 0.37
100 0.38
101 0.39
102 0.37
103 0.33
104 0.25
105 0.23
106 0.2
107 0.24
108 0.22
109 0.19
110 0.17
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.04
116 0.05
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.11
128 0.14
129 0.18
130 0.25
131 0.32
132 0.38
133 0.4
134 0.4
135 0.43
136 0.45
137 0.44
138 0.43
139 0.43
140 0.38
141 0.4
142 0.42
143 0.4
144 0.36
145 0.35
146 0.29
147 0.22
148 0.21
149 0.16
150 0.13
151 0.1
152 0.11
153 0.09
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.12
162 0.15
163 0.22
164 0.29
165 0.34
166 0.41
167 0.48
168 0.58
169 0.64
170 0.65
171 0.69
172 0.73
173 0.78
174 0.82
175 0.83
176 0.81
177 0.75
178 0.72
179 0.67
180 0.62
181 0.54
182 0.52
183 0.46
184 0.44
185 0.43
186 0.4
187 0.37
188 0.35
189 0.38
190 0.31
191 0.33
192 0.31
193 0.32
194 0.34
195 0.31
196 0.31
197 0.27
198 0.27
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.21
203 0.23
204 0.21
205 0.2
206 0.21
207 0.19
208 0.17
209 0.15
210 0.15
211 0.12
212 0.12
213 0.19
214 0.19
215 0.25
216 0.24
217 0.23
218 0.22
219 0.23
220 0.22
221 0.14
222 0.11
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.13
234 0.16
235 0.23
236 0.28
237 0.34
238 0.38
239 0.43
240 0.46
241 0.48
242 0.46
243 0.42
244 0.44
245 0.45
246 0.46
247 0.48
248 0.49
249 0.48
250 0.47
251 0.42
252 0.35
253 0.28
254 0.23
255 0.17
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.15
262 0.16
263 0.15
264 0.2
265 0.24
266 0.29
267 0.33
268 0.34
269 0.31
270 0.31
271 0.31
272 0.25
273 0.22
274 0.23
275 0.24
276 0.31
277 0.33
278 0.34
279 0.33
280 0.36
281 0.36
282 0.32
283 0.29
284 0.28
285 0.36
286 0.44
287 0.49
288 0.56
289 0.57
290 0.61
291 0.63
292 0.64
293 0.62
294 0.6
295 0.64
296 0.62
297 0.67
298 0.63
299 0.59
300 0.52
301 0.46
302 0.41
303 0.32
304 0.24
305 0.17
306 0.19
307 0.18
308 0.21
309 0.19
310 0.17
311 0.2
312 0.2
313 0.21
314 0.19
315 0.22
316 0.22
317 0.24
318 0.25
319 0.22
320 0.22
321 0.2
322 0.18
323 0.14
324 0.11
325 0.09
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.16
331 0.21
332 0.24
333 0.29
334 0.28
335 0.29
336 0.29
337 0.28
338 0.25
339 0.21
340 0.18
341 0.13
342 0.14
343 0.13
344 0.16
345 0.21
346 0.21
347 0.22
348 0.23
349 0.28
350 0.29
351 0.34
352 0.38
353 0.38
354 0.45
355 0.5
356 0.52
357 0.47
358 0.45
359 0.4
360 0.34
361 0.3
362 0.27
363 0.23
364 0.22
365 0.22
366 0.23
367 0.22
368 0.21
369 0.21
370 0.16
371 0.16
372 0.18
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.2
377 0.17
378 0.19
379 0.16
380 0.13
381 0.13
382 0.16
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.16
389 0.14
390 0.12
391 0.12
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.19
397 0.2
398 0.22
399 0.23
400 0.26
401 0.28
402 0.29
403 0.31
404 0.31
405 0.35
406 0.34
407 0.35
408 0.32
409 0.36
410 0.42
411 0.42
412 0.41
413 0.37
414 0.35
415 0.35
416 0.37
417 0.35
418 0.33
419 0.32
420 0.36
421 0.36
422 0.35
423 0.32
424 0.28
425 0.24
426 0.18
427 0.15
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.11
435 0.11
436 0.13