FuNGI

A0A139AKQ3

Protein Details

Accession

A0A139AKQ3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-76	QGDPRAKKKRIHDEEFPNAHE	Basic
385-406	KSELRAARRREEQRKKTVRDVE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MSSDDPVAGPSRRRVPRELIEPVDDSDEETSEERRTSSNRKRTTVSEGSDVEEPEQGDPRAKKKRIHDEEFPNAHEYKDGAILKIKVSNFLTYNSAEWRPGPKMNMIIGPNGTGKSTLVCAVVIGLGGNPSILKDQNTLMNFVKHGREKAEVEITLRHSKGNIAIKREFSNAGSGSNWSLNGKKITFDAIKEKVRKLNIQVDNLCQVLPQDRVSHFAGMNSIQLLHETQRAALGEDMVKIQQELASFEKDHKNTEQRLASLRASLADLEAKNADLQAQVARLEERENIIAQIQYWATAVAYMEYKQDHADYKAGRVHFRNLEAEQARLKDEDRPLQQAIEALKSDAEEAHNSAKEARKEYNNIMRDIMTITEARGRLEELADNAKSELRAARRREEQRKKTVRDVEAEIETLRRRASEARAVCEEVGVPLDDNVQPSGKFAELITEVEKLRSAMTEAEFKVNDKESEGEELRRDLNGVRTESADVERRLQMMDDIRVQKYKRIEQWNPQAVRAVEWMKGHRETFSDILDPVGVEISVKDGSDWVLRTVETAIGGNIMAIVLANEEDYHRASRELLDRQNLRITLTAPESNEMSVEEYRRNVPIDRHELRRYGFDGYIIDVLQGPERILQFLCRQNFVHMIPFARPGADPNIDALERYSQIRRYFVGNTSFQINSRHGQSSILTTEMKEPTIFTAGAEDIDARRDLQEAAAHCQSRFAELEKKIAANSQEVRKHRGILEQLTTKRRAILEERAALVEKKNAYRSHVNALYMKESKLRSLEVDATELQQEIARQERKYRKACLDKLESFKNAHHAWQASREIFRKNLVASLRRDQLEEQLRVLKETQKERGDRLANMEALLLEAKEQVEVKKKATVAKNAILQHRQEELGDRWEELKAYLAQEDSKTLEECEVELGTEQGKLDAYQDADPDALNRFRRHEAQIKAKRNEVNQTQADVDTKAQKFDELKGKWYPNVKALCDTINTKFADHMGRIGCAGQVRLHEDQKNFETWGIEILVKFRDSESLQVLSPARQSGGERSVSTILYLMSMQELAIVPFRIVDEINQGMDTRNERLVHSQFVEVSCRDSSSQYFLVTPKLLQDLEYHENARICVVFNGDHLPSRKFTLQGFIERKRQLNASRAARV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.58
3	0.63
4	0.67
5	0.68
6	0.63
7	0.59
8	0.56
9	0.52
10	0.47
11	0.38
12	0.31
13	0.24
14	0.2
15	0.17
16	0.17
17	0.17
18	0.16
19	0.17
20	0.17
21	0.19
22	0.25
23	0.35
24	0.44
25	0.52
26	0.58
27	0.62
28	0.66
29	0.67
30	0.7
31	0.68
32	0.61
33	0.58
34	0.51
35	0.49
36	0.47
37	0.43
38	0.35
39	0.29
40	0.25
41	0.2
42	0.23
43	0.21
44	0.25
45	0.29
46	0.38
47	0.46
48	0.51
49	0.57
50	0.63
51	0.73
52	0.76
53	0.79
54	0.79
55	0.78
56	0.82
57	0.8
58	0.72
59	0.65
60	0.55
61	0.48
62	0.39
63	0.3
64	0.21
65	0.24
66	0.23
67	0.2
68	0.25
69	0.27
70	0.27
71	0.32
72	0.31
73	0.29
74	0.3
75	0.33
76	0.29
77	0.3
78	0.31
79	0.27
80	0.28
81	0.27
82	0.27
83	0.24
84	0.25
85	0.28
86	0.3
87	0.33
88	0.34
89	0.33
90	0.35
91	0.37
92	0.41
93	0.36
94	0.35
95	0.31
96	0.31
97	0.29
98	0.25
99	0.22
100	0.17
101	0.15
102	0.13
103	0.14
104	0.13
105	0.12
106	0.11
107	0.11
108	0.1
109	0.1
110	0.09
111	0.07
112	0.06
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.08
119	0.1
120	0.12
121	0.13
122	0.16
123	0.22
124	0.24
125	0.27
126	0.27
127	0.28
128	0.27
129	0.29
130	0.34
131	0.32
132	0.34
133	0.33
134	0.36
135	0.35
136	0.4
137	0.42
138	0.36
139	0.33
140	0.36
141	0.38
142	0.4
143	0.38
144	0.33
145	0.27
146	0.28
147	0.33
148	0.38
149	0.37
150	0.37
151	0.41
152	0.44
153	0.46
154	0.47
155	0.42
156	0.33
157	0.35
158	0.28
159	0.26
160	0.23
161	0.21
162	0.21
163	0.2
164	0.2
165	0.16
166	0.17
167	0.2
168	0.24
169	0.23
170	0.22
171	0.21
172	0.27
173	0.27
174	0.29
175	0.33
176	0.35
177	0.43
178	0.47
179	0.5
180	0.5
181	0.52
182	0.54
183	0.53
184	0.56
185	0.54
186	0.57
187	0.55
188	0.53
189	0.51
190	0.46
191	0.39
192	0.28
193	0.23
194	0.18
195	0.18
196	0.17
197	0.19
198	0.19
199	0.23
200	0.25
201	0.28
202	0.24
203	0.23
204	0.23
205	0.18
206	0.19
207	0.15
208	0.13
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.15
217	0.15
218	0.16
219	0.15
220	0.15
221	0.13
222	0.13
223	0.14
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.11
231	0.13
232	0.16
233	0.16
234	0.21
235	0.28
236	0.28
237	0.31
238	0.35
239	0.4
240	0.41
241	0.48
242	0.47
243	0.41
244	0.45
245	0.46
246	0.4
247	0.34
248	0.31
249	0.23
250	0.21
251	0.18
252	0.14
253	0.15
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.12
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.13
273	0.13
274	0.13
275	0.13
276	0.13
277	0.11
278	0.13
279	0.11
280	0.1
281	0.09
282	0.09
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.06
287	0.07
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.12
294	0.13
295	0.14
296	0.19
297	0.18
298	0.22
299	0.26
300	0.27
301	0.29
302	0.3
303	0.34
304	0.33
305	0.35
306	0.34
307	0.3
308	0.37
309	0.33
310	0.33
311	0.29
312	0.27
313	0.25
314	0.22
315	0.22
316	0.2
317	0.24
318	0.29
319	0.29
320	0.33
321	0.32
322	0.31
323	0.31
324	0.28
325	0.25
326	0.2
327	0.18
328	0.13
329	0.13
330	0.13
331	0.13
332	0.1
333	0.11
334	0.09
335	0.11
336	0.15
337	0.15
338	0.15
339	0.19
340	0.23
341	0.25
342	0.27
343	0.3
344	0.3
345	0.34
346	0.41
347	0.46
348	0.44
349	0.42
350	0.4
351	0.35
352	0.31
353	0.28
354	0.21
355	0.14
356	0.11
357	0.1
358	0.13
359	0.13
360	0.13
361	0.12
362	0.12
363	0.11
364	0.12
365	0.13
366	0.1
367	0.14
368	0.14
369	0.14
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.13
374	0.15
375	0.18
376	0.26
377	0.29
378	0.35
379	0.43
380	0.53
381	0.63
382	0.7
383	0.72
384	0.76
385	0.82
386	0.81
387	0.8
388	0.79
389	0.71
390	0.65
391	0.6
392	0.52
393	0.43
394	0.39
395	0.3
396	0.24
397	0.21
398	0.18
399	0.14
400	0.1
401	0.11
402	0.14
403	0.18
404	0.24
405	0.25
406	0.29
407	0.31
408	0.32
409	0.3
410	0.27
411	0.22
412	0.14
413	0.12
414	0.08
415	0.06
416	0.05
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.1
438	0.09
439	0.09
440	0.08
441	0.1
442	0.14
443	0.15
444	0.17
445	0.17
446	0.18
447	0.19
448	0.19
449	0.18
450	0.14
451	0.14
452	0.12
453	0.17
454	0.18
455	0.17
456	0.16
457	0.17
458	0.17
459	0.15
460	0.15
461	0.11
462	0.16
463	0.18
464	0.19
465	0.18
466	0.18
467	0.19
468	0.19
469	0.21
470	0.2
471	0.16
472	0.18
473	0.18
474	0.17
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.13
479	0.15
480	0.17
481	0.2
482	0.2
483	0.24
484	0.24
485	0.26
486	0.29
487	0.32
488	0.35
489	0.41
490	0.45
491	0.5
492	0.6
493	0.65
494	0.61
495	0.56
496	0.51
497	0.42
498	0.38
499	0.33
500	0.24
501	0.18
502	0.18
503	0.19
504	0.19
505	0.21
506	0.2
507	0.18
508	0.17
509	0.17
510	0.17
511	0.16
512	0.14
513	0.12
514	0.12
515	0.11
516	0.1
517	0.07
518	0.05
519	0.04
520	0.03
521	0.03
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.04
542	0.04
543	0.03
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.02
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.03
552	0.04
553	0.05
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.07
558	0.1
559	0.15
560	0.19
561	0.21
562	0.26
563	0.27
564	0.28
565	0.3
566	0.28
567	0.24
568	0.19
569	0.18
570	0.14
571	0.16
572	0.16
573	0.13
574	0.14
575	0.13
576	0.12
577	0.11
578	0.09
579	0.09
580	0.08
581	0.1
582	0.1
583	0.11
584	0.12
585	0.13
586	0.14
587	0.13
588	0.15
589	0.2
590	0.28
591	0.31
592	0.36
593	0.37
594	0.38
595	0.37
596	0.37
597	0.32
598	0.26
599	0.22
600	0.17
601	0.15
602	0.14
603	0.14
604	0.11
605	0.1
606	0.07
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.06
611	0.07
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.1
616	0.14
617	0.2
618	0.21
619	0.21
620	0.22
621	0.23
622	0.25
623	0.24
624	0.23
625	0.18
626	0.18
627	0.17
628	0.18
629	0.17
630	0.14
631	0.14
632	0.12
633	0.14
634	0.14
635	0.14
636	0.12
637	0.14
638	0.13
639	0.13
640	0.12
641	0.1
642	0.1
643	0.12
644	0.13
645	0.16
646	0.17
647	0.19
648	0.19
649	0.21
650	0.23
651	0.25
652	0.28
653	0.24
654	0.23
655	0.25
656	0.24
657	0.22
658	0.23
659	0.21
660	0.18
661	0.2
662	0.2
663	0.18
664	0.18
665	0.18
666	0.18
667	0.16
668	0.17
669	0.13
670	0.12
671	0.16
672	0.16
673	0.16
674	0.13
675	0.12
676	0.12
677	0.14
678	0.13
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.08
685	0.06
686	0.07
687	0.08
688	0.06
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.08
693	0.11
694	0.11
695	0.15
696	0.19
697	0.2
698	0.19
699	0.21
700	0.2
701	0.19
702	0.19
703	0.17
704	0.21
705	0.21
706	0.26
707	0.24
708	0.25
709	0.22
710	0.24
711	0.22
712	0.19
713	0.23
714	0.26
715	0.32
716	0.33
717	0.39
718	0.38
719	0.39
720	0.36
721	0.37
722	0.34
723	0.31
724	0.35
725	0.36
726	0.4
727	0.42
728	0.43
729	0.38
730	0.36
731	0.33
732	0.31
733	0.28
734	0.32
735	0.33
736	0.34
737	0.34
738	0.32
739	0.33
740	0.3
741	0.26
742	0.22
743	0.18
744	0.19
745	0.23
746	0.24
747	0.28
748	0.33
749	0.35
750	0.39
751	0.39
752	0.38
753	0.36
754	0.37
755	0.37
756	0.32
757	0.3
758	0.27
759	0.24
760	0.24
761	0.23
762	0.22
763	0.18
764	0.2
765	0.24
766	0.2
767	0.22
768	0.2
769	0.19
770	0.19
771	0.17
772	0.14
773	0.1
774	0.1
775	0.09
776	0.16
777	0.19
778	0.19
779	0.29
780	0.38
781	0.46
782	0.51
783	0.57
784	0.59
785	0.65
786	0.7
787	0.69
788	0.69
789	0.66
790	0.67
791	0.65
792	0.58
793	0.49
794	0.45
795	0.43
796	0.35
797	0.31
798	0.29
799	0.27
800	0.25
801	0.3
802	0.34
803	0.29
804	0.33
805	0.34
806	0.33
807	0.32
808	0.32
809	0.29
810	0.24
811	0.27
812	0.27
813	0.3
814	0.32
815	0.36
816	0.4
817	0.38
818	0.39
819	0.35
820	0.38
821	0.41
822	0.37
823	0.33
824	0.34
825	0.33
826	0.33
827	0.34
828	0.31
829	0.29
830	0.34
831	0.4
832	0.4
833	0.43
834	0.44
835	0.51
836	0.49
837	0.44
838	0.45
839	0.41
840	0.34
841	0.32
842	0.29
843	0.2
844	0.17
845	0.16
846	0.1
847	0.06
848	0.06
849	0.06
850	0.07
851	0.08
852	0.11
853	0.2
854	0.22
855	0.24
856	0.28
857	0.3
858	0.36
859	0.41
860	0.47
861	0.44
862	0.46
863	0.51
864	0.52
865	0.56
866	0.52
867	0.47
868	0.42
869	0.38
870	0.33
871	0.27
872	0.27
873	0.24
874	0.26
875	0.25
876	0.23
877	0.22
878	0.22
879	0.21
880	0.17
881	0.18
882	0.14
883	0.14
884	0.14
885	0.14
886	0.15
887	0.16
888	0.17
889	0.15
890	0.15
891	0.15
892	0.14
893	0.15
894	0.13
895	0.13
896	0.13
897	0.11
898	0.1
899	0.09
900	0.09
901	0.08
902	0.09
903	0.09
904	0.07
905	0.08
906	0.07
907	0.09
908	0.1
909	0.12
910	0.12
911	0.13
912	0.13
913	0.13
914	0.12
915	0.12
916	0.14
917	0.18
918	0.21
919	0.23
920	0.27
921	0.31
922	0.36
923	0.42
924	0.46
925	0.49
926	0.56
927	0.64
928	0.7
929	0.69
930	0.7
931	0.68
932	0.64
933	0.65
934	0.59
935	0.57
936	0.5
937	0.49
938	0.44
939	0.4
940	0.38
941	0.3
942	0.27
943	0.27
944	0.25
945	0.25
946	0.24
947	0.26
948	0.27
949	0.32
950	0.39
951	0.32
952	0.37
953	0.42
954	0.45
955	0.46
956	0.51
957	0.47
958	0.45
959	0.49
960	0.46
961	0.42
962	0.41
963	0.38
964	0.35
965	0.36
966	0.31
967	0.32
968	0.3
969	0.27
970	0.26
971	0.26
972	0.27
973	0.24
974	0.26
975	0.21
976	0.21
977	0.21
978	0.21
979	0.2
980	0.16
981	0.17
982	0.14
983	0.16
984	0.2
985	0.25
986	0.3
987	0.34
988	0.35
989	0.39
990	0.4
991	0.4
992	0.36
993	0.32
994	0.27
995	0.22
996	0.23
997	0.19
998	0.17
999	0.14
1000	0.16
1001	0.17
1002	0.16
1003	0.16
1004	0.14
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.21
1008	0.22
1009	0.22
1010	0.21
1011	0.25
1012	0.26
1013	0.23
1014	0.25
1015	0.22
1016	0.18
1017	0.18
1018	0.2
1019	0.22
1020	0.27
1021	0.28
1022	0.26
1023	0.29
1024	0.3
1025	0.29
1026	0.27
1027	0.21
1028	0.16
1029	0.13
1030	0.13
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.07
1035	0.08
1036	0.09
1037	0.09
1038	0.11
1039	0.11
1040	0.1
1041	0.11
1042	0.12
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.14
1047	0.16
1048	0.17
1049	0.16
1050	0.17
1051	0.17
1052	0.2
1053	0.22
1054	0.2
1055	0.24
1056	0.24
1057	0.25
1058	0.32
1059	0.34
1060	0.36
1061	0.35
1062	0.34
1063	0.32
1064	0.32
1065	0.35
1066	0.28
1067	0.28
1068	0.23
1069	0.23
1070	0.22
1071	0.22
1072	0.23
1073	0.25
1074	0.27
1075	0.24
1076	0.26
1077	0.25
1078	0.29
1079	0.28
1080	0.26
1081	0.22
1082	0.24
1083	0.23
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.25
1087	0.29
1088	0.32
1089	0.31
1090	0.3
1091	0.31
1092	0.31
1093	0.3
1094	0.23
1095	0.2
1096	0.17
1097	0.19
1098	0.16
1099	0.16
1100	0.21
1101	0.2
1102	0.25
1103	0.27
1104	0.28
1105	0.28
1106	0.33
1107	0.35
1108	0.32
1109	0.32
1110	0.36
1111	0.38
1112	0.45
1113	0.52
1114	0.53
1115	0.59
1116	0.62
1117	0.64
1118	0.59
1119	0.61
1120	0.58
1121	0.58
1122	0.61

A0A139AKQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer