Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139AMI1

Protein Details
Accession A0A139AMI1    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-61SSKINKFQKHKEEEAAKKKKEBasic
857-881EVERVLEPSKKKRKTIKDDDVDDIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-59AKKK
868-868K
Subcellular Location(s) cyto 12.5, nucl 10, cyto_mito 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR035009  SR140_RRM  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
PS50128  SURP  
CDD cd12223  RRM_SR140  
Amino Acid Sequences MSGKEDQKGAPILPWGLQATKEGSIKTLTSSKVQAFTIGGSSKINKFQKHKEEEAAKKKKEAEDAAKVYADFIASFESDETPANHTPGSVPSAAPIHRAATRSWVRGGTVQQGDPKTVEPKAVISARDAFKQDDDDVADSKAGLGAGIGAQRGLAPSTSTPNSGFTNVSSGEIYRPQSRFVKASPFVKAGSVIGGDSIKIEKDESQPKVVPATRQSSQVSHSALPLDASSSNTTTSGKKRALDSFRDELRREQAARDERLRQKGHPKGEGIVLKAAFEDRVGSYDTGDPETTNLYVGNLNPQSTTEDALARQFAVYGPIASVKVMWPRTQEEKERGRLSGFVSFMKRDDAAKALREMDGREIGGMPVRVGWGKRIVVPDKPIFILGQHSIAAGLPAAASNLTTGESPFGAQLVAPRPAAFPPGAALPPPRLEVLVNRPSDSEVVARIHRMIERVVKYGEPFEREVMDREAENCGDGQGDWGFLFRHDSPEHIYYRWKLFSVLQGDPKGRWRSEPFQMFDEGPFWVPPEIPFDDDGNESDVSNADSLSSLSSVTDEEDTNRRRAVTLHTRPLPIEARRRLTRLLRKITLIRLDIGRAMLVCIDNAESADEVSQLLCTSLTLQSTPIWPTKIARLFLLSDVLHNSSCAAPNAWRYRAAFEGRLAPVMGHLGRVWKSIAARLKAEQFRRAVTKCIEVWENWSVFGPETIEGLKSAFYSVEKSGERSGTPETGDAEFAQAQAQSALDHQLQPTDSNIDDDDVDGVPLDLSSPINRWEPLSAGSAPPTTDRHSSKSSWKGLDNRGNLEPTVLQTPVAEDDDDIDGVPLNAPPVVRVVQPAPMDVDDDDIDGVPLNIPQKPTEVERVLEPSKKKRKTIKDDDVDDIFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.23
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.21
7 0.25
8 0.26
9 0.23
10 0.23
11 0.24
12 0.24
13 0.26
14 0.28
15 0.25
16 0.27
17 0.32
18 0.33
19 0.35
20 0.34
21 0.32
22 0.27
23 0.26
24 0.28
25 0.23
26 0.21
27 0.2
28 0.23
29 0.25
30 0.34
31 0.39
32 0.42
33 0.48
34 0.58
35 0.66
36 0.7
37 0.72
38 0.72
39 0.76
40 0.79
41 0.82
42 0.82
43 0.75
44 0.72
45 0.73
46 0.69
47 0.67
48 0.65
49 0.62
50 0.62
51 0.63
52 0.6
53 0.55
54 0.5
55 0.42
56 0.34
57 0.26
58 0.15
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.14
68 0.17
69 0.19
70 0.2
71 0.19
72 0.18
73 0.18
74 0.2
75 0.22
76 0.18
77 0.16
78 0.17
79 0.22
80 0.22
81 0.23
82 0.21
83 0.2
84 0.22
85 0.24
86 0.22
87 0.28
88 0.34
89 0.34
90 0.36
91 0.34
92 0.33
93 0.36
94 0.38
95 0.37
96 0.35
97 0.34
98 0.37
99 0.37
100 0.37
101 0.33
102 0.33
103 0.29
104 0.26
105 0.25
106 0.2
107 0.2
108 0.25
109 0.27
110 0.25
111 0.24
112 0.31
113 0.31
114 0.34
115 0.35
116 0.3
117 0.28
118 0.31
119 0.28
120 0.23
121 0.23
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.18
126 0.14
127 0.14
128 0.12
129 0.09
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.15
145 0.17
146 0.18
147 0.19
148 0.21
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.17
153 0.19
154 0.18
155 0.19
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.19
160 0.22
161 0.25
162 0.25
163 0.28
164 0.33
165 0.35
166 0.36
167 0.34
168 0.41
169 0.39
170 0.43
171 0.43
172 0.4
173 0.37
174 0.34
175 0.33
176 0.23
177 0.19
178 0.15
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.11
189 0.18
190 0.26
191 0.29
192 0.33
193 0.35
194 0.35
195 0.41
196 0.4
197 0.38
198 0.35
199 0.38
200 0.34
201 0.38
202 0.39
203 0.34
204 0.34
205 0.34
206 0.31
207 0.26
208 0.25
209 0.21
210 0.19
211 0.18
212 0.15
213 0.13
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.17
222 0.22
223 0.27
224 0.28
225 0.3
226 0.34
227 0.42
228 0.46
229 0.48
230 0.5
231 0.49
232 0.52
233 0.54
234 0.52
235 0.47
236 0.45
237 0.44
238 0.39
239 0.34
240 0.36
241 0.38
242 0.42
243 0.43
244 0.47
245 0.49
246 0.56
247 0.57
248 0.53
249 0.57
250 0.59
251 0.61
252 0.57
253 0.52
254 0.45
255 0.49
256 0.46
257 0.38
258 0.34
259 0.28
260 0.23
261 0.21
262 0.2
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.06
267 0.08
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.17
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.11
298 0.1
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.13
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.21
315 0.29
316 0.33
317 0.37
318 0.39
319 0.45
320 0.5
321 0.49
322 0.46
323 0.4
324 0.37
325 0.33
326 0.3
327 0.24
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.2
332 0.19
333 0.18
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.18
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.13
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.1
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.11
359 0.12
360 0.15
361 0.2
362 0.21
363 0.23
364 0.28
365 0.28
366 0.25
367 0.25
368 0.23
369 0.18
370 0.16
371 0.16
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.05
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.07
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.11
407 0.08
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.1
415 0.11
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.12
420 0.19
421 0.24
422 0.24
423 0.23
424 0.23
425 0.23
426 0.23
427 0.21
428 0.14
429 0.09
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.11
438 0.16
439 0.17
440 0.19
441 0.19
442 0.18
443 0.18
444 0.21
445 0.21
446 0.17
447 0.17
448 0.15
449 0.16
450 0.16
451 0.18
452 0.16
453 0.15
454 0.12
455 0.12
456 0.13
457 0.11
458 0.11
459 0.09
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.09
471 0.08
472 0.13
473 0.12
474 0.14
475 0.17
476 0.21
477 0.23
478 0.2
479 0.23
480 0.21
481 0.25
482 0.25
483 0.21
484 0.18
485 0.18
486 0.23
487 0.25
488 0.25
489 0.26
490 0.28
491 0.28
492 0.28
493 0.34
494 0.33
495 0.28
496 0.29
497 0.31
498 0.33
499 0.4
500 0.46
501 0.41
502 0.38
503 0.4
504 0.36
505 0.31
506 0.26
507 0.19
508 0.13
509 0.11
510 0.1
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.13
523 0.12
524 0.11
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.08
529 0.07
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.04
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.09
543 0.16
544 0.19
545 0.2
546 0.21
547 0.2
548 0.2
549 0.21
550 0.27
551 0.31
552 0.37
553 0.43
554 0.46
555 0.47
556 0.47
557 0.49
558 0.47
559 0.41
560 0.43
561 0.4
562 0.44
563 0.46
564 0.49
565 0.49
566 0.53
567 0.57
568 0.57
569 0.59
570 0.54
571 0.55
572 0.56
573 0.56
574 0.52
575 0.43
576 0.36
577 0.29
578 0.27
579 0.24
580 0.21
581 0.16
582 0.1
583 0.09
584 0.08
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.04
600 0.05
601 0.04
602 0.04
603 0.06
604 0.07
605 0.08
606 0.08
607 0.09
608 0.1
609 0.12
610 0.15
611 0.16
612 0.16
613 0.16
614 0.18
615 0.25
616 0.29
617 0.28
618 0.26
619 0.26
620 0.26
621 0.25
622 0.28
623 0.2
624 0.16
625 0.17
626 0.17
627 0.15
628 0.13
629 0.14
630 0.11
631 0.13
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.21
636 0.27
637 0.28
638 0.3
639 0.29
640 0.31
641 0.35
642 0.37
643 0.31
644 0.27
645 0.31
646 0.29
647 0.28
648 0.25
649 0.2
650 0.17
651 0.18
652 0.16
653 0.1
654 0.1
655 0.13
656 0.14
657 0.15
658 0.16
659 0.15
660 0.16
661 0.21
662 0.28
663 0.26
664 0.28
665 0.3
666 0.38
667 0.43
668 0.46
669 0.45
670 0.4
671 0.41
672 0.46
673 0.45
674 0.42
675 0.38
676 0.39
677 0.34
678 0.36
679 0.34
680 0.27
681 0.31
682 0.31
683 0.29
684 0.24
685 0.23
686 0.2
687 0.18
688 0.18
689 0.15
690 0.09
691 0.1
692 0.1
693 0.1
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.11
702 0.12
703 0.18
704 0.18
705 0.2
706 0.24
707 0.25
708 0.24
709 0.23
710 0.26
711 0.22
712 0.22
713 0.21
714 0.2
715 0.19
716 0.2
717 0.17
718 0.16
719 0.14
720 0.14
721 0.13
722 0.11
723 0.1
724 0.09
725 0.09
726 0.07
727 0.08
728 0.11
729 0.11
730 0.13
731 0.13
732 0.15
733 0.16
734 0.16
735 0.17
736 0.17
737 0.16
738 0.16
739 0.17
740 0.15
741 0.14
742 0.14
743 0.13
744 0.1
745 0.1
746 0.08
747 0.08
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.07
753 0.08
754 0.1
755 0.13
756 0.16
757 0.17
758 0.18
759 0.18
760 0.19
761 0.2
762 0.23
763 0.21
764 0.19
765 0.21
766 0.21
767 0.2
768 0.21
769 0.22
770 0.22
771 0.28
772 0.3
773 0.34
774 0.38
775 0.41
776 0.48
777 0.54
778 0.58
779 0.55
780 0.58
781 0.61
782 0.66
783 0.71
784 0.66
785 0.61
786 0.58
787 0.55
788 0.48
789 0.42
790 0.33
791 0.26
792 0.25
793 0.2
794 0.16
795 0.14
796 0.16
797 0.17
798 0.17
799 0.15
800 0.11
801 0.14
802 0.15
803 0.15
804 0.13
805 0.1
806 0.09
807 0.09
808 0.1
809 0.08
810 0.07
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.12
815 0.13
816 0.13
817 0.16
818 0.17
819 0.22
820 0.23
821 0.24
822 0.24
823 0.22
824 0.23
825 0.2
826 0.22
827 0.15
828 0.15
829 0.15
830 0.12
831 0.11
832 0.1
833 0.1
834 0.07
835 0.09
836 0.11
837 0.13
838 0.15
839 0.16
840 0.19
841 0.22
842 0.26
843 0.33
844 0.33
845 0.32
846 0.35
847 0.41
848 0.43
849 0.46
850 0.49
851 0.51
852 0.59
853 0.65
854 0.7
855 0.73
856 0.79
857 0.84
858 0.88
859 0.88
860 0.88
861 0.85
862 0.82