Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E5R5D6

Protein Details
Accession E5R5D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-173GGEGDGEPRKKKKKKKAGDGGGDDASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-164KMGRPKKVAEPGAGGEGDGEPRKKKKKKKA
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MPVAPLPRVPLKRTHNSASEALLTPSSVEAFLLAFGDNDYPLPETVRVLDEIITDYIIETCHEAASVAHHARRAKIKLDDFKFMLRRDTGKLGRVSEMLETDKELKRKRKAFDTDEGAVMADKGDGANGAEGGTKMGRPKKVAEPGAGGEGDGEPRKKKKKKKAGDGGGDDASTTLVALVEFYTSPISADRGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.58
3 0.58
4 0.57
5 0.5
6 0.46
7 0.38
8 0.32
9 0.26
10 0.21
11 0.17
12 0.15
13 0.13
14 0.08
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.08
28 0.08
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.1
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.08
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.18
57 0.19
58 0.22
59 0.29
60 0.29
61 0.28
62 0.33
63 0.39
64 0.44
65 0.46
66 0.47
67 0.42
68 0.44
69 0.44
70 0.38
71 0.34
72 0.27
73 0.26
74 0.24
75 0.3
76 0.27
77 0.27
78 0.29
79 0.27
80 0.27
81 0.25
82 0.23
83 0.17
84 0.16
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.13
89 0.15
90 0.2
91 0.25
92 0.32
93 0.39
94 0.46
95 0.49
96 0.54
97 0.59
98 0.59
99 0.61
100 0.59
101 0.52
102 0.46
103 0.43
104 0.33
105 0.25
106 0.2
107 0.12
108 0.05
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.12
123 0.17
124 0.2
125 0.21
126 0.26
127 0.33
128 0.42
129 0.44
130 0.41
131 0.4
132 0.38
133 0.39
134 0.34
135 0.25
136 0.17
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.18
142 0.27
143 0.38
144 0.46
145 0.56
146 0.65
147 0.73
148 0.82
149 0.88
150 0.91
151 0.91
152 0.92
153 0.88
154 0.81
155 0.72
156 0.6
157 0.49
158 0.38
159 0.27
160 0.17
161 0.11
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.1