FuNGI

A0A139AM47

Protein Details

Accession

A0A139AM47

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
231-251	LEKRGSRRPKNLRQHALKKYD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
234-240	RGSRRPK

Subcellular Location(s)

cyto 13, cyto_nucl 12.5, nucl 10, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040045 DYNC2LI1 IPR022780 Dynein_light_int_chain IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005929 C:cilium GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005868 C:cytoplasmic dynein complex GO:0005874 C:microtubule GO:0005815 C:microtubule organizing center GO:0035721 P:intraciliary retrograde transport GO:0035735 P:intraciliary transport involved in cilium assembly
Pfam	View protein in Pfam PF05783 DLIC

Amino Acid Sequences

MLSSPTAPSSAPPEPPNPTAPDDSDRFPPIPRHIFEAFAAFRLDEDAEPIQVPLFVPPKDIPPIPPEGEPRVKKDLWEFLKERAAERKKTEEGGITVGGSVPRAIDALTGGTHPTERIETTLMFLGQRGAGKTSIILKFLNRTDTPQKTIALDYTYGRRTRGSVKDIVHIYELARGTSLIRGIDIAVKERNLHTTSFALVVDLSDPHTLLSTILPLLDRARQRVTSLAEGLEKRGSRRPKNLRQHALKKYDGHEDKSLVTPLLVPLIILGNKYDQFSQMEASHRRLITHTLRHLAHTNGAVLCYMTLRDDQVASRCRHLLSHFSFKTPPPKGETMEDGKALYVLPGTDSYTSIGLPQSAGLAGLGDASSSLAKDPSAVWGRWRAEFERVFPPKIGVIRSAIPGEQWANDVLSTELELLPPPPPLPTKDKEAFRKFLRGEGPPGPWATGKGVSSSESGRSGMEYSRARAAGMGVLGKQW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.43
3	0.46
4	0.43
5	0.43
6	0.42
7	0.42
8	0.43
9	0.41
10	0.4
11	0.41
12	0.41
13	0.37
14	0.37
15	0.39
16	0.42
17	0.47
18	0.45
19	0.46
20	0.43
21	0.44
22	0.41
23	0.43
24	0.34
25	0.28
26	0.27
27	0.2
28	0.19
29	0.19
30	0.19
31	0.11
32	0.15
33	0.14
34	0.14
35	0.14
36	0.14
37	0.13
38	0.12
39	0.12
40	0.13
41	0.17
42	0.16
43	0.2
44	0.21
45	0.25
46	0.29
47	0.3
48	0.28
49	0.27
50	0.34
51	0.32
52	0.35
53	0.35
54	0.38
55	0.47
56	0.47
57	0.49
58	0.5
59	0.48
60	0.47
61	0.48
62	0.5
63	0.46
64	0.51
65	0.47
66	0.44
67	0.51
68	0.49
69	0.47
70	0.47
71	0.49
72	0.47
73	0.5
74	0.53
75	0.49
76	0.51
77	0.5
78	0.43
79	0.38
80	0.35
81	0.3
82	0.23
83	0.19
84	0.18
85	0.16
86	0.11
87	0.1
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.05
93	0.05
94	0.06
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.11
105	0.12
106	0.12
107	0.14
108	0.15
109	0.14
110	0.13
111	0.12
112	0.12
113	0.12
114	0.13
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.13
120	0.19
121	0.18
122	0.19
123	0.18
124	0.18
125	0.23
126	0.25
127	0.29
128	0.23
129	0.27
130	0.34
131	0.38
132	0.41
133	0.38
134	0.37
135	0.33
136	0.34
137	0.29
138	0.23
139	0.2
140	0.17
141	0.2
142	0.23
143	0.23
144	0.23
145	0.22
146	0.22
147	0.29
148	0.34
149	0.34
150	0.36
151	0.36
152	0.42
153	0.42
154	0.41
155	0.33
156	0.27
157	0.22
158	0.21
159	0.19
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.1
164	0.11
165	0.12
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.13
176	0.14
177	0.18
178	0.16
179	0.16
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.1
186	0.09
187	0.08
188	0.07
189	0.06
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.11
205	0.12
206	0.14
207	0.17
208	0.17
209	0.17
210	0.21
211	0.22
212	0.19
213	0.19
214	0.17
215	0.18
216	0.17
217	0.18
218	0.18
219	0.16
220	0.16
221	0.21
222	0.29
223	0.31
224	0.41
225	0.5
226	0.57
227	0.68
228	0.75
229	0.78
230	0.79
231	0.84
232	0.82
233	0.78
234	0.71
235	0.63
236	0.56
237	0.56
238	0.49
239	0.43
240	0.37
241	0.32
242	0.3
243	0.28
244	0.26
245	0.17
246	0.14
247	0.11
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.13
265	0.13
266	0.19
267	0.21
268	0.24
269	0.27
270	0.26
271	0.26
272	0.25
273	0.29
274	0.3
275	0.34
276	0.33
277	0.34
278	0.35
279	0.36
280	0.38
281	0.32
282	0.28
283	0.22
284	0.21
285	0.15
286	0.15
287	0.13
288	0.1
289	0.09
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.08
297	0.09
298	0.15
299	0.22
300	0.22
301	0.24
302	0.25
303	0.25
304	0.26
305	0.27
306	0.3
307	0.29
308	0.38
309	0.36
310	0.37
311	0.4
312	0.41
313	0.49
314	0.43
315	0.4
316	0.36
317	0.38
318	0.38
319	0.39
320	0.41
321	0.37
322	0.36
323	0.33
324	0.27
325	0.24
326	0.21
327	0.18
328	0.13
329	0.08
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.07
362	0.14
363	0.19
364	0.19
365	0.22
366	0.3
367	0.32
368	0.35
369	0.38
370	0.33
371	0.36
372	0.38
373	0.39
374	0.41
375	0.43
376	0.42
377	0.39
378	0.38
379	0.34
380	0.35
381	0.33
382	0.24
383	0.23
384	0.24
385	0.26
386	0.25
387	0.22
388	0.18
389	0.19
390	0.19
391	0.16
392	0.15
393	0.13
394	0.12
395	0.12
396	0.13
397	0.1
398	0.09
399	0.09
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.13
409	0.15
410	0.2
411	0.27
412	0.3
413	0.38
414	0.44
415	0.53
416	0.6
417	0.65
418	0.68
419	0.65
420	0.71
421	0.63
422	0.62
423	0.59
424	0.53
425	0.52
426	0.5
427	0.49
428	0.43
429	0.43
430	0.38
431	0.33
432	0.31
433	0.28
434	0.27
435	0.24
436	0.23
437	0.23
438	0.23
439	0.24
440	0.24
441	0.23
442	0.21
443	0.21
444	0.19
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.25
449	0.25
450	0.26
451	0.32
452	0.31
453	0.3
454	0.29
455	0.27
456	0.23
457	0.22
458	0.21

A0A139AM47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer