Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136ITV5

Protein Details
Accession A0A136ITV5    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-100SHSADRPRDSRRRRDSPGRRHDNRDSRGBasic
222-246RNSRSPLPRRRERGGRRPGARREGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-43RRGPRRGGGGGGGGRDRAPRAPRNRERD
80-96RDSRRRRDSPGRRHDNR
219-266GRGRNSRSPLPRRRERGGRRPGARREGGNGNGGEAREPRARAGARPKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MDRSLDEIVAESQHDRRGPRRGGGGGGGGRDRAPRAPRNRERDAYPRDGVRKSTRDDSRDLNSDWVHDKFDDSHSADRPRDSRRRRDSPGRRHDNRDSRGSKIRVENIHYELTEEDLEGLFTKIGPILKLDLLYDRAGRSEGVAYVTYERRDDAEESIRQFDGANAKGQPIRLSIVAGAPRRNPFDNAQMPGRPLSERISRPRSLSPGRDVDRYVPGEGRGRNSRSPLPRRRERGGRRPGARREGGNGNGGEAREPRARAGARPKKTQEELDDEMANYFSGGANGAETQEAGPAGGAAAGAAAAAPAGDDIDMNIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.31
4 0.4
5 0.44
6 0.47
7 0.5
8 0.48
9 0.47
10 0.45
11 0.45
12 0.38
13 0.35
14 0.31
15 0.25
16 0.24
17 0.23
18 0.23
19 0.23
20 0.29
21 0.35
22 0.44
23 0.55
24 0.63
25 0.69
26 0.76
27 0.74
28 0.73
29 0.74
30 0.72
31 0.68
32 0.62
33 0.61
34 0.58
35 0.57
36 0.57
37 0.55
38 0.53
39 0.51
40 0.56
41 0.57
42 0.54
43 0.55
44 0.54
45 0.51
46 0.51
47 0.47
48 0.42
49 0.35
50 0.35
51 0.35
52 0.31
53 0.27
54 0.21
55 0.22
56 0.19
57 0.22
58 0.25
59 0.24
60 0.27
61 0.3
62 0.36
63 0.36
64 0.38
65 0.4
66 0.43
67 0.5
68 0.54
69 0.6
70 0.64
71 0.71
72 0.75
73 0.82
74 0.84
75 0.84
76 0.87
77 0.87
78 0.83
79 0.82
80 0.84
81 0.83
82 0.77
83 0.76
84 0.68
85 0.63
86 0.66
87 0.6
88 0.55
89 0.51
90 0.52
91 0.46
92 0.48
93 0.46
94 0.41
95 0.4
96 0.34
97 0.3
98 0.23
99 0.21
100 0.17
101 0.12
102 0.09
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.16
142 0.18
143 0.19
144 0.2
145 0.19
146 0.18
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.11
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.18
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.24
171 0.22
172 0.29
173 0.32
174 0.32
175 0.32
176 0.3
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.19
181 0.16
182 0.18
183 0.22
184 0.26
185 0.33
186 0.38
187 0.39
188 0.42
189 0.44
190 0.47
191 0.45
192 0.44
193 0.42
194 0.44
195 0.45
196 0.44
197 0.42
198 0.37
199 0.38
200 0.35
201 0.31
202 0.23
203 0.23
204 0.26
205 0.27
206 0.3
207 0.31
208 0.33
209 0.35
210 0.38
211 0.43
212 0.48
213 0.57
214 0.6
215 0.63
216 0.69
217 0.73
218 0.76
219 0.8
220 0.8
221 0.8
222 0.81
223 0.81
224 0.8
225 0.82
226 0.82
227 0.8
228 0.74
229 0.65
230 0.6
231 0.57
232 0.51
233 0.47
234 0.39
235 0.32
236 0.3
237 0.28
238 0.24
239 0.19
240 0.21
241 0.2
242 0.21
243 0.2
244 0.25
245 0.26
246 0.31
247 0.41
248 0.46
249 0.49
250 0.58
251 0.62
252 0.64
253 0.67
254 0.66
255 0.61
256 0.59
257 0.57
258 0.51
259 0.47
260 0.39
261 0.36
262 0.3
263 0.23
264 0.15
265 0.11
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.02
290 0.02
291 0.02
292 0.02
293 0.02
294 0.03
295 0.03
296 0.03