Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JFF7

Protein Details
Accession A0A136JFF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-376IDDSVKPKNKPRKEVAEKAGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-238RHARPPQRPGPTPKPPAHRD
360-402KPKNKPRKEVAEKAGGRGGPRGRGRGRGRGGGGRGGGGFRGRP
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 7, mito 5, plas 4, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR013945  Pkr1  
IPR047575  Sm  
IPR034102  Sm_D1  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
GO:0070072  P:vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF08636  Pkr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01724  Sm_D1  
Amino Acid Sequences MASFFEQLWESIFTPGPTPTLLIATNATFAALQLVFFVLLVATYSIHFVILSFLCGGLWWAINWFAVELKAAQLKEEQEKALADRETRRATDDSDTEVEALTQAVEPKKASGSSEVEVTKRAGELKHRGDTGAGIKSGVSTEDEWEKVWDFHIVGEGWWWSFSLAIDYGPPCGFGDAATDGLGSSTAKLHSLNGIPRRHNPHSIATSRSAHVIVGFRNRHARPPQRPGPTPKPPAHRDAGTREHRAPTLHRPKTETTQHIVFCARSDHSTQTGAMKLVRFLMKCANETVTIELKNGTIVHGTITSVSPQMNTALKTVKMTSRGQDPITLDTMNIRGSMIRYFILPDSLPLDTLLIDDSVKPKNKPRKEVAEKAGGRGGPRGRGRGRGRGGGGRGGGGFRGRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.15
5 0.16
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.14
14 0.14
15 0.11
16 0.1
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.09
25 0.04
26 0.04
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.1
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.17
61 0.2
62 0.25
63 0.27
64 0.25
65 0.22
66 0.24
67 0.24
68 0.27
69 0.25
70 0.23
71 0.26
72 0.32
73 0.34
74 0.34
75 0.36
76 0.32
77 0.33
78 0.35
79 0.31
80 0.29
81 0.27
82 0.27
83 0.23
84 0.21
85 0.18
86 0.13
87 0.11
88 0.07
89 0.06
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.2
100 0.19
101 0.24
102 0.24
103 0.23
104 0.24
105 0.23
106 0.18
107 0.15
108 0.17
109 0.14
110 0.19
111 0.28
112 0.32
113 0.36
114 0.36
115 0.35
116 0.33
117 0.34
118 0.31
119 0.25
120 0.19
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.07
128 0.09
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.09
178 0.11
179 0.16
180 0.23
181 0.27
182 0.29
183 0.34
184 0.42
185 0.42
186 0.44
187 0.42
188 0.4
189 0.41
190 0.42
191 0.39
192 0.35
193 0.34
194 0.3
195 0.28
196 0.22
197 0.16
198 0.16
199 0.14
200 0.13
201 0.19
202 0.19
203 0.19
204 0.27
205 0.27
206 0.32
207 0.39
208 0.47
209 0.47
210 0.55
211 0.62
212 0.62
213 0.67
214 0.69
215 0.7
216 0.7
217 0.7
218 0.66
219 0.67
220 0.63
221 0.62
222 0.57
223 0.51
224 0.46
225 0.44
226 0.48
227 0.45
228 0.47
229 0.44
230 0.42
231 0.4
232 0.38
233 0.36
234 0.38
235 0.43
236 0.43
237 0.43
238 0.45
239 0.47
240 0.53
241 0.57
242 0.5
243 0.44
244 0.44
245 0.43
246 0.4
247 0.38
248 0.31
249 0.24
250 0.22
251 0.18
252 0.15
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.2
260 0.19
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.18
265 0.21
266 0.18
267 0.18
268 0.24
269 0.25
270 0.25
271 0.27
272 0.25
273 0.22
274 0.23
275 0.25
276 0.21
277 0.19
278 0.19
279 0.17
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.12
284 0.09
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.18
301 0.19
302 0.2
303 0.23
304 0.23
305 0.26
306 0.28
307 0.29
308 0.33
309 0.36
310 0.35
311 0.37
312 0.35
313 0.33
314 0.33
315 0.29
316 0.22
317 0.2
318 0.21
319 0.17
320 0.15
321 0.12
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.11
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.13
337 0.13
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.12
345 0.2
346 0.25
347 0.28
348 0.37
349 0.47
350 0.56
351 0.64
352 0.69
353 0.73
354 0.78
355 0.85
356 0.82
357 0.82
358 0.75
359 0.69
360 0.65
361 0.55
362 0.46
363 0.43
364 0.4
365 0.38
366 0.41
367 0.46
368 0.45
369 0.54
370 0.59
371 0.62
372 0.64
373 0.63
374 0.63
375 0.61
376 0.61
377 0.56
378 0.51
379 0.42
380 0.37
381 0.31
382 0.27