Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JCF5

Protein Details
Accession A0A136JCF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-421EDERQRRSGRRDRSKSRARSQSRPRLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-331RKAREAEKRKADEEKRRWE
399-420QRRSGRRDRSKSRARSQSRPRL
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001715  CH_dom  
IPR036872  CH_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016043  P:cellular component organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00307  CH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50021  CH  
CDD cd21210  CH_SCP1-like  
Amino Acid Sequences MASVSSLDKDLRKMRLDKYTPGAAKEVKTWIESVLGERLQSNDLLEALKDGTSLCALANLAIGPPGVKFKKSAMPFVQMENISQFLRACKSPPLNLHDHDVFLTVDLYEQKDPAQVLQCLGSFSRAAHSANPSVFPAPIGASKPSGVVSPTATGNTTPTRDRGVSNVSNNSSAYGSTRSAAGLSPTRTGDSGSGRWSPTKSPTGERVGSPGVSSWSNRNQEGVTSPAWNIAQYGYMGGASQGNLGIVYGTGRRQITSSSPKVPSFAEKERRRKEQEAEAEAQRLQMEEQERKRRQEEEQAQLEEERRWEEESRKAREAEKRKADEEKRRWEEEERQWRLTEEKRRKDEEAAEARMAEERRATKASSDASADGYKDRIKQLEDELERARQRETEYEDERQRRSGRRDRSKSRARSQSRPRLAERTPSRQDSWRTGEREILQTQWDNYQQDQHLQQPPQAAQPSRPLPQPTTAPKPAIPAPIKTHRTGENLPTPPIKTHRTGEKLPTPPVKPQRTGESRPLPVPGRSQNQTPSGYQPSPLSQSNSRPLPEPTTPATAPLEAAPPAYASRTDRFLASNPAPAQQAPQPTYSRELGFTAEQDTEDRRRAQSQTKTKASGWAGKSLLEREMEMERQRQREWEEAQAETAKAVRSGDGVEGIGGGVGGRWDVGQWAGYTGGDNQNKGSQGIGSGRRQIVGPRPLPGRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.59
3 0.61
4 0.61
5 0.61
6 0.64
7 0.59
8 0.56
9 0.55
10 0.48
11 0.46
12 0.43
13 0.43
14 0.35
15 0.34
16 0.32
17 0.27
18 0.26
19 0.25
20 0.23
21 0.24
22 0.22
23 0.21
24 0.22
25 0.22
26 0.21
27 0.2
28 0.18
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.16
53 0.17
54 0.18
55 0.19
56 0.23
57 0.32
58 0.35
59 0.43
60 0.39
61 0.45
62 0.46
63 0.47
64 0.49
65 0.41
66 0.39
67 0.32
68 0.3
69 0.22
70 0.22
71 0.2
72 0.16
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.26
77 0.31
78 0.36
79 0.42
80 0.45
81 0.48
82 0.49
83 0.53
84 0.46
85 0.42
86 0.36
87 0.31
88 0.24
89 0.19
90 0.17
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.15
99 0.16
100 0.18
101 0.21
102 0.19
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.13
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.17
115 0.22
116 0.24
117 0.25
118 0.26
119 0.25
120 0.23
121 0.22
122 0.19
123 0.15
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.13
141 0.15
142 0.18
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.23
147 0.24
148 0.25
149 0.25
150 0.29
151 0.33
152 0.36
153 0.4
154 0.37
155 0.37
156 0.37
157 0.34
158 0.26
159 0.21
160 0.18
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.15
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.2
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.2
180 0.23
181 0.23
182 0.25
183 0.26
184 0.26
185 0.28
186 0.32
187 0.31
188 0.33
189 0.38
190 0.42
191 0.43
192 0.4
193 0.38
194 0.33
195 0.3
196 0.26
197 0.2
198 0.16
199 0.15
200 0.16
201 0.17
202 0.23
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.25
207 0.25
208 0.26
209 0.24
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.16
215 0.15
216 0.13
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.19
243 0.26
244 0.3
245 0.33
246 0.36
247 0.36
248 0.37
249 0.36
250 0.35
251 0.32
252 0.37
253 0.41
254 0.46
255 0.57
256 0.62
257 0.7
258 0.72
259 0.7
260 0.67
261 0.65
262 0.65
263 0.6
264 0.57
265 0.5
266 0.45
267 0.39
268 0.35
269 0.26
270 0.18
271 0.12
272 0.11
273 0.14
274 0.19
275 0.27
276 0.37
277 0.41
278 0.44
279 0.47
280 0.47
281 0.46
282 0.5
283 0.5
284 0.48
285 0.49
286 0.47
287 0.45
288 0.43
289 0.41
290 0.31
291 0.24
292 0.17
293 0.12
294 0.13
295 0.15
296 0.17
297 0.25
298 0.32
299 0.37
300 0.38
301 0.39
302 0.41
303 0.48
304 0.54
305 0.55
306 0.56
307 0.53
308 0.53
309 0.6
310 0.63
311 0.65
312 0.64
313 0.66
314 0.62
315 0.61
316 0.6
317 0.56
318 0.57
319 0.56
320 0.59
321 0.53
322 0.49
323 0.47
324 0.46
325 0.46
326 0.44
327 0.44
328 0.43
329 0.47
330 0.51
331 0.54
332 0.56
333 0.55
334 0.52
335 0.51
336 0.47
337 0.41
338 0.35
339 0.32
340 0.3
341 0.3
342 0.26
343 0.17
344 0.13
345 0.12
346 0.14
347 0.16
348 0.16
349 0.13
350 0.16
351 0.17
352 0.15
353 0.15
354 0.13
355 0.14
356 0.15
357 0.14
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.15
366 0.18
367 0.25
368 0.24
369 0.25
370 0.25
371 0.28
372 0.29
373 0.28
374 0.25
375 0.19
376 0.19
377 0.2
378 0.24
379 0.26
380 0.29
381 0.34
382 0.41
383 0.43
384 0.43
385 0.44
386 0.43
387 0.42
388 0.48
389 0.51
390 0.54
391 0.61
392 0.7
393 0.73
394 0.78
395 0.82
396 0.82
397 0.82
398 0.82
399 0.77
400 0.78
401 0.8
402 0.81
403 0.79
404 0.75
405 0.7
406 0.66
407 0.61
408 0.61
409 0.57
410 0.55
411 0.53
412 0.51
413 0.5
414 0.49
415 0.51
416 0.48
417 0.49
418 0.46
419 0.44
420 0.41
421 0.43
422 0.39
423 0.4
424 0.34
425 0.29
426 0.24
427 0.22
428 0.22
429 0.2
430 0.22
431 0.19
432 0.18
433 0.22
434 0.21
435 0.23
436 0.24
437 0.27
438 0.3
439 0.3
440 0.31
441 0.3
442 0.3
443 0.32
444 0.34
445 0.29
446 0.24
447 0.31
448 0.33
449 0.32
450 0.35
451 0.33
452 0.31
453 0.34
454 0.38
455 0.37
456 0.41
457 0.42
458 0.4
459 0.38
460 0.39
461 0.39
462 0.41
463 0.36
464 0.32
465 0.36
466 0.43
467 0.46
468 0.44
469 0.44
470 0.4
471 0.44
472 0.43
473 0.42
474 0.42
475 0.41
476 0.42
477 0.41
478 0.38
479 0.35
480 0.38
481 0.35
482 0.3
483 0.32
484 0.39
485 0.42
486 0.45
487 0.49
488 0.53
489 0.53
490 0.56
491 0.58
492 0.52
493 0.55
494 0.61
495 0.6
496 0.55
497 0.54
498 0.57
499 0.59
500 0.61
501 0.62
502 0.6
503 0.57
504 0.54
505 0.55
506 0.48
507 0.42
508 0.43
509 0.41
510 0.39
511 0.39
512 0.41
513 0.41
514 0.44
515 0.44
516 0.4
517 0.38
518 0.38
519 0.37
520 0.35
521 0.31
522 0.29
523 0.31
524 0.32
525 0.31
526 0.28
527 0.34
528 0.39
529 0.42
530 0.39
531 0.38
532 0.38
533 0.39
534 0.37
535 0.36
536 0.32
537 0.34
538 0.33
539 0.33
540 0.32
541 0.26
542 0.24
543 0.21
544 0.19
545 0.13
546 0.14
547 0.11
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.12
552 0.14
553 0.16
554 0.2
555 0.2
556 0.21
557 0.22
558 0.24
559 0.29
560 0.27
561 0.32
562 0.3
563 0.31
564 0.31
565 0.29
566 0.3
567 0.26
568 0.32
569 0.26
570 0.3
571 0.3
572 0.31
573 0.36
574 0.35
575 0.32
576 0.26
577 0.25
578 0.24
579 0.23
580 0.21
581 0.19
582 0.17
583 0.16
584 0.16
585 0.2
586 0.22
587 0.25
588 0.27
589 0.27
590 0.32
591 0.36
592 0.44
593 0.5
594 0.56
595 0.61
596 0.65
597 0.67
598 0.63
599 0.66
600 0.61
601 0.6
602 0.51
603 0.49
604 0.42
605 0.41
606 0.43
607 0.37
608 0.35
609 0.27
610 0.25
611 0.2
612 0.24
613 0.26
614 0.27
615 0.33
616 0.36
617 0.4
618 0.41
619 0.44
620 0.44
621 0.47
622 0.47
623 0.48
624 0.45
625 0.41
626 0.44
627 0.41
628 0.36
629 0.29
630 0.27
631 0.19
632 0.17
633 0.16
634 0.13
635 0.12
636 0.14
637 0.14
638 0.13
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.1
643 0.08
644 0.07
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.05
653 0.06
654 0.08
655 0.08
656 0.1
657 0.1
658 0.1
659 0.12
660 0.15
661 0.23
662 0.25
663 0.25
664 0.26
665 0.3
666 0.31
667 0.3
668 0.27
669 0.18
670 0.19
671 0.27
672 0.32
673 0.32
674 0.38
675 0.39
676 0.39
677 0.39
678 0.41
679 0.43
680 0.45
681 0.44
682 0.43