Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JB13

Protein Details
Accession A0A136JB13    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
337-362PTGSHNSTRSRKPPRGEKKEIARSGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-361RSRKPPRGEKKEIARSG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.833, cyto_mito 8.666, mito 8.5, nucl 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
Amino Acid Sequences MSLPYQVPINGTYQKRIPPGSQTNLYYILLSNLPWQTSWQQLKDHVRVVCPVERVEVFNESTTGWVSVRGRDNFDAAFELLNGGIFNGRPLFADGKNATDPVMIKEPVDVADVHKHALSVSKHTRRSSPPTPHYRDVTPAVAFPVRPVHDQWLYNVHPTANNFQIDPNMHETMCAYNNDPAFHHMLDDRGFKTHRNQSTLSLRPIDYASQISCHPVRPLQSVPHQDGRLLGFGDRAQSANSRTTSSSGYEEAAGIRVVIRHIAPHVTYGEFLSLLRRKLGHDADSIVRLDLPVSDSYDSNIGFAVATFCSEHAAFRTVRKFHGLRFESRVLKAEVTPTGSHNSTRSRKPPRGEKKEIARSGSHHDNSKKSREPQEGSVIIANGSSSTRKPFQKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.46
4 0.44
5 0.46
6 0.53
7 0.55
8 0.57
9 0.54
10 0.51
11 0.51
12 0.48
13 0.39
14 0.3
15 0.25
16 0.19
17 0.17
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.2
23 0.21
24 0.3
25 0.36
26 0.34
27 0.36
28 0.44
29 0.53
30 0.55
31 0.58
32 0.5
33 0.46
34 0.46
35 0.48
36 0.44
37 0.37
38 0.33
39 0.31
40 0.3
41 0.3
42 0.28
43 0.27
44 0.23
45 0.21
46 0.21
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.14
51 0.1
52 0.14
53 0.15
54 0.2
55 0.28
56 0.3
57 0.34
58 0.34
59 0.36
60 0.31
61 0.31
62 0.27
63 0.19
64 0.17
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.05
71 0.06
72 0.05
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.11
78 0.14
79 0.14
80 0.21
81 0.21
82 0.24
83 0.25
84 0.24
85 0.22
86 0.2
87 0.2
88 0.17
89 0.21
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.13
97 0.11
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.21
105 0.2
106 0.22
107 0.32
108 0.39
109 0.44
110 0.46
111 0.52
112 0.52
113 0.6
114 0.6
115 0.61
116 0.62
117 0.68
118 0.73
119 0.72
120 0.69
121 0.61
122 0.56
123 0.49
124 0.42
125 0.33
126 0.25
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.16
131 0.18
132 0.17
133 0.18
134 0.19
135 0.21
136 0.24
137 0.25
138 0.25
139 0.27
140 0.26
141 0.26
142 0.26
143 0.21
144 0.19
145 0.2
146 0.23
147 0.19
148 0.18
149 0.17
150 0.17
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.16
160 0.17
161 0.15
162 0.12
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.22
180 0.28
181 0.3
182 0.32
183 0.32
184 0.35
185 0.43
186 0.46
187 0.41
188 0.36
189 0.32
190 0.29
191 0.28
192 0.23
193 0.16
194 0.13
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.16
204 0.18
205 0.2
206 0.21
207 0.27
208 0.31
209 0.34
210 0.38
211 0.35
212 0.32
213 0.31
214 0.28
215 0.23
216 0.19
217 0.15
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.13
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.26
266 0.3
267 0.26
268 0.24
269 0.27
270 0.27
271 0.29
272 0.28
273 0.21
274 0.17
275 0.14
276 0.13
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.15
285 0.14
286 0.12
287 0.11
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.15
301 0.15
302 0.21
303 0.29
304 0.28
305 0.3
306 0.37
307 0.37
308 0.37
309 0.47
310 0.45
311 0.42
312 0.47
313 0.53
314 0.5
315 0.5
316 0.5
317 0.41
318 0.39
319 0.35
320 0.32
321 0.27
322 0.26
323 0.26
324 0.24
325 0.27
326 0.27
327 0.27
328 0.28
329 0.35
330 0.38
331 0.45
332 0.53
333 0.58
334 0.65
335 0.72
336 0.79
337 0.81
338 0.84
339 0.85
340 0.85
341 0.85
342 0.88
343 0.84
344 0.78
345 0.7
346 0.63
347 0.61
348 0.62
349 0.55
350 0.53
351 0.54
352 0.59
353 0.62
354 0.68
355 0.69
356 0.67
357 0.72
358 0.74
359 0.73
360 0.7
361 0.72
362 0.64
363 0.58
364 0.53
365 0.43
366 0.34
367 0.28
368 0.22
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.19
374 0.27