Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136IPA2

Protein Details
Accession A0A136IPA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
493-516SAEEARMKKRQKRMNDANKDKTGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-505ARMKKRQKR
536-543PTKKEAKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.833, mito 5.5, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSQPPSQPTAPQPQQSSAQATPSPGAQIASSNLGMPPTKRPRISPGPPSQPGSPYPGSQYGNMPSPGASTPGAMTPGAGAPSPVPQPLSKAPGQPVNYATSFARNGSATPVPTPTQTQPPSQAPSQPQTPIPANNGLPMPVVSAGAMPQSIMMPSQPTTPSALLPTPQAPYTNATLMPIPSPSTPAPAGEMPPPPLNASGSFSAAGPAKAPTKSYAYEMDDMLAGTGINLEEEQELMNEFELRESLSARRPGGRKSLYGAGPANQPPEESEARTTEQLAAEAADKAWNEAAQRLAISRTVELTSHLLDPGFLHRKMAAAASRNNLGLNLDVRSDGKSQYMGRLTAPDTFPKPTINVSTTKTDDGTIITTHGSFIPKEAFLVDQIALLSIATREHLRGLLTDAHKKSLSRQQKSHGQVPAPWTPAASPGPVATNGVVGASPATAGGSAASPALAPKKRPADAMSNGLPTPVSDASPSVNPLAEAMRALGKANRSAEEARMKKRQKRMNDANKDKTGTDGSRAGSTAPGGEGGEVKAPTKKEAKKSAKLAEASSTTVNNTLSLFAGGKKKKKYSWMSGGGGASGPGTPQPQVGGAPDTPGGTGGAMPKATNGPLTMAPNSKHLPGAWREDGPTGKNIQMRDWILVLEDRGQDNIALQRLYDKLDKSNLGDKTTNDEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.54
3 0.55
4 0.46
5 0.44
6 0.39
7 0.37
8 0.34
9 0.29
10 0.27
11 0.21
12 0.2
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.18
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.19
22 0.19
23 0.27
24 0.33
25 0.41
26 0.43
27 0.46
28 0.53
29 0.62
30 0.69
31 0.69
32 0.69
33 0.71
34 0.74
35 0.74
36 0.68
37 0.62
38 0.55
39 0.52
40 0.45
41 0.36
42 0.36
43 0.39
44 0.37
45 0.35
46 0.38
47 0.34
48 0.37
49 0.36
50 0.31
51 0.24
52 0.25
53 0.23
54 0.21
55 0.18
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.13
69 0.15
70 0.14
71 0.15
72 0.15
73 0.2
74 0.25
75 0.3
76 0.3
77 0.33
78 0.36
79 0.41
80 0.44
81 0.42
82 0.39
83 0.39
84 0.36
85 0.33
86 0.3
87 0.27
88 0.25
89 0.22
90 0.22
91 0.18
92 0.18
93 0.21
94 0.23
95 0.2
96 0.2
97 0.23
98 0.21
99 0.23
100 0.27
101 0.25
102 0.32
103 0.33
104 0.35
105 0.38
106 0.42
107 0.45
108 0.43
109 0.46
110 0.41
111 0.44
112 0.44
113 0.41
114 0.37
115 0.37
116 0.39
117 0.36
118 0.34
119 0.35
120 0.31
121 0.31
122 0.3
123 0.25
124 0.22
125 0.19
126 0.16
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.17
146 0.17
147 0.18
148 0.18
149 0.19
150 0.16
151 0.18
152 0.19
153 0.17
154 0.17
155 0.18
156 0.16
157 0.18
158 0.2
159 0.2
160 0.17
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.15
169 0.14
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.18
174 0.17
175 0.19
176 0.19
177 0.21
178 0.2
179 0.21
180 0.22
181 0.2
182 0.19
183 0.19
184 0.16
185 0.18
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.1
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.15
199 0.18
200 0.19
201 0.21
202 0.24
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.22
207 0.19
208 0.17
209 0.15
210 0.1
211 0.06
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.09
233 0.14
234 0.18
235 0.19
236 0.25
237 0.27
238 0.29
239 0.37
240 0.37
241 0.33
242 0.33
243 0.38
244 0.33
245 0.34
246 0.32
247 0.25
248 0.27
249 0.27
250 0.25
251 0.19
252 0.18
253 0.15
254 0.19
255 0.19
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.19
262 0.16
263 0.14
264 0.13
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.09
296 0.14
297 0.17
298 0.16
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.15
305 0.14
306 0.16
307 0.18
308 0.19
309 0.18
310 0.18
311 0.16
312 0.13
313 0.11
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.11
324 0.11
325 0.15
326 0.16
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.18
333 0.16
334 0.16
335 0.17
336 0.18
337 0.17
338 0.16
339 0.14
340 0.17
341 0.16
342 0.18
343 0.19
344 0.22
345 0.23
346 0.22
347 0.21
348 0.19
349 0.17
350 0.14
351 0.13
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.09
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.1
385 0.15
386 0.17
387 0.25
388 0.25
389 0.27
390 0.27
391 0.27
392 0.3
393 0.33
394 0.41
395 0.4
396 0.43
397 0.48
398 0.56
399 0.61
400 0.62
401 0.57
402 0.48
403 0.44
404 0.46
405 0.44
406 0.37
407 0.32
408 0.25
409 0.21
410 0.24
411 0.22
412 0.17
413 0.12
414 0.1
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.09
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.12
439 0.14
440 0.15
441 0.22
442 0.28
443 0.29
444 0.32
445 0.34
446 0.35
447 0.37
448 0.41
449 0.37
450 0.34
451 0.32
452 0.3
453 0.26
454 0.18
455 0.18
456 0.13
457 0.11
458 0.09
459 0.1
460 0.12
461 0.13
462 0.14
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.1
467 0.11
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.12
475 0.13
476 0.17
477 0.19
478 0.19
479 0.21
480 0.22
481 0.26
482 0.34
483 0.38
484 0.4
485 0.48
486 0.55
487 0.59
488 0.67
489 0.7
490 0.69
491 0.75
492 0.8
493 0.81
494 0.84
495 0.87
496 0.86
497 0.83
498 0.75
499 0.64
500 0.56
501 0.5
502 0.4
503 0.35
504 0.3
505 0.26
506 0.25
507 0.25
508 0.23
509 0.18
510 0.17
511 0.13
512 0.09
513 0.09
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.11
519 0.11
520 0.12
521 0.15
522 0.16
523 0.2
524 0.28
525 0.34
526 0.4
527 0.51
528 0.59
529 0.64
530 0.71
531 0.74
532 0.72
533 0.68
534 0.61
535 0.55
536 0.48
537 0.41
538 0.35
539 0.28
540 0.21
541 0.21
542 0.2
543 0.15
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.13
550 0.22
551 0.28
552 0.35
553 0.42
554 0.48
555 0.52
556 0.61
557 0.66
558 0.67
559 0.71
560 0.72
561 0.67
562 0.65
563 0.61
564 0.51
565 0.42
566 0.32
567 0.22
568 0.13
569 0.11
570 0.08
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.1
575 0.11
576 0.11
577 0.13
578 0.16
579 0.14
580 0.16
581 0.16
582 0.16
583 0.15
584 0.14
585 0.13
586 0.09
587 0.1
588 0.1
589 0.13
590 0.13
591 0.13
592 0.14
593 0.16
594 0.16
595 0.16
596 0.14
597 0.14
598 0.18
599 0.22
600 0.24
601 0.27
602 0.27
603 0.32
604 0.33
605 0.32
606 0.3
607 0.28
608 0.31
609 0.31
610 0.39
611 0.37
612 0.37
613 0.37
614 0.4
615 0.43
616 0.38
617 0.37
618 0.32
619 0.32
620 0.33
621 0.33
622 0.31
623 0.35
624 0.35
625 0.33
626 0.3
627 0.26
628 0.24
629 0.25
630 0.23
631 0.21
632 0.22
633 0.2
634 0.2
635 0.21
636 0.19
637 0.2
638 0.23
639 0.22
640 0.18
641 0.18
642 0.21
643 0.22
644 0.26
645 0.29
646 0.26
647 0.28
648 0.35
649 0.38
650 0.38
651 0.45
652 0.44
653 0.45
654 0.46
655 0.42