Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136J6I3

Protein Details
Accession A0A136J6I3    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-189EYDPEERARRRRSYRDRDGDDRRRRQQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-187ARRRRSYRDRDGDDRRRR
238-253SRRRRQSPARRENAGK
269-270RR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDTMDLDMEMDVEVDLVPDEPIVPDAYNEDLAPRSPGEVADHDPEAHAPNKVHIRGLDVLNPKELKAYVAEHFPETSFNRIEWIDDTSANLLFSHDDVAARALIALSAESAVDVATLPIKQLLPAKSFSQRPEVALQVRRAVYGDRKQQGAASRSRFYLLNPEYDPEERARRRRSYRDRDGDDRRRRQQPRTREDEPKDHFDVNLYDDDEAALATRPTGDGSNSRRRRSYTPESDAGSRRRRQSPARRENAGKELFPLGGGSSGGDRSRRNGGASRDRSRSPMRSDRDGDRDMDGSGFASDASGAAASSRNRDRARAVKSHMQRSGRAATGRELFPVAGGKGDTSSGRLGDKVEDAAELLAKGITLPLMDGSDDVAASASMRSQRSSSRRLEDRISAPGQGGGRLADRISGASSNNGSAFSIRGAASKDSSGGGDQGFAIKGMGKSARELFPDKFGSSGSTGNETKELFGNSSRGDGGSRARNRKKAGDLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.1
13 0.13
14 0.14
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.16
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.17
25 0.19
26 0.23
27 0.24
28 0.25
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.18
36 0.24
37 0.32
38 0.33
39 0.34
40 0.31
41 0.34
42 0.35
43 0.37
44 0.38
45 0.37
46 0.37
47 0.4
48 0.4
49 0.35
50 0.32
51 0.3
52 0.24
53 0.2
54 0.22
55 0.18
56 0.23
57 0.25
58 0.24
59 0.24
60 0.23
61 0.25
62 0.24
63 0.26
64 0.22
65 0.2
66 0.22
67 0.21
68 0.22
69 0.19
70 0.21
71 0.18
72 0.17
73 0.19
74 0.17
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.16
109 0.19
110 0.2
111 0.23
112 0.26
113 0.3
114 0.35
115 0.35
116 0.37
117 0.35
118 0.35
119 0.35
120 0.37
121 0.37
122 0.38
123 0.38
124 0.36
125 0.35
126 0.32
127 0.3
128 0.28
129 0.3
130 0.32
131 0.39
132 0.36
133 0.37
134 0.37
135 0.39
136 0.43
137 0.4
138 0.4
139 0.36
140 0.36
141 0.35
142 0.37
143 0.34
144 0.28
145 0.33
146 0.27
147 0.26
148 0.25
149 0.26
150 0.27
151 0.27
152 0.28
153 0.21
154 0.29
155 0.3
156 0.38
157 0.44
158 0.5
159 0.57
160 0.66
161 0.74
162 0.75
163 0.8
164 0.82
165 0.81
166 0.81
167 0.84
168 0.84
169 0.83
170 0.82
171 0.78
172 0.79
173 0.78
174 0.79
175 0.78
176 0.77
177 0.76
178 0.75
179 0.74
180 0.73
181 0.73
182 0.73
183 0.68
184 0.64
185 0.58
186 0.5
187 0.43
188 0.35
189 0.31
190 0.23
191 0.21
192 0.15
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.06
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.12
208 0.19
209 0.3
210 0.36
211 0.38
212 0.4
213 0.43
214 0.46
215 0.49
216 0.53
217 0.51
218 0.5
219 0.52
220 0.51
221 0.52
222 0.52
223 0.51
224 0.48
225 0.44
226 0.44
227 0.45
228 0.49
229 0.55
230 0.61
231 0.65
232 0.68
233 0.69
234 0.68
235 0.65
236 0.63
237 0.61
238 0.52
239 0.41
240 0.32
241 0.27
242 0.22
243 0.19
244 0.16
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.06
251 0.06
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.16
256 0.17
257 0.18
258 0.22
259 0.28
260 0.36
261 0.44
262 0.47
263 0.46
264 0.46
265 0.49
266 0.49
267 0.47
268 0.44
269 0.46
270 0.45
271 0.48
272 0.51
273 0.51
274 0.52
275 0.49
276 0.43
277 0.35
278 0.31
279 0.25
280 0.21
281 0.16
282 0.1
283 0.08
284 0.07
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.07
294 0.07
295 0.12
296 0.15
297 0.22
298 0.23
299 0.25
300 0.3
301 0.34
302 0.4
303 0.42
304 0.45
305 0.47
306 0.53
307 0.59
308 0.6
309 0.55
310 0.51
311 0.49
312 0.48
313 0.43
314 0.38
315 0.31
316 0.29
317 0.31
318 0.29
319 0.25
320 0.21
321 0.17
322 0.16
323 0.16
324 0.12
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.15
371 0.24
372 0.3
373 0.37
374 0.42
375 0.46
376 0.52
377 0.55
378 0.58
379 0.56
380 0.53
381 0.52
382 0.47
383 0.39
384 0.33
385 0.32
386 0.28
387 0.22
388 0.19
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.12
398 0.12
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.15
404 0.14
405 0.13
406 0.13
407 0.1
408 0.12
409 0.11
410 0.12
411 0.15
412 0.16
413 0.18
414 0.17
415 0.18
416 0.16
417 0.17
418 0.15
419 0.14
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.15
430 0.18
431 0.17
432 0.21
433 0.26
434 0.29
435 0.31
436 0.35
437 0.33
438 0.36
439 0.39
440 0.36
441 0.31
442 0.28
443 0.27
444 0.25
445 0.26
446 0.22
447 0.24
448 0.24
449 0.25
450 0.28
451 0.25
452 0.25
453 0.25
454 0.25
455 0.21
456 0.23
457 0.25
458 0.23
459 0.25
460 0.24
461 0.2
462 0.2
463 0.2
464 0.25
465 0.31
466 0.4
467 0.48
468 0.56
469 0.64
470 0.68
471 0.74
472 0.77