Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136IUC8

Protein Details
Accession A0A136IUC8    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-339SEDEKTPAKKDKKSSKKITADGGHydrophilic
415-442LIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYRGGALDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-257KPKSKKAKTKA
326-329KDKK
421-434KGFTKEKNKKKRGA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MPQKTSKTDTTSQGPPSWLFSNNSSATTTEAQPKRPEADTMAKTKKEVKAEPVEAAATSAAVQEPPSQLMNLVEGFLSDQGFDKAHKEFQKHRAKKGWTAGEEGTAAGQSLVSVYQTWETVSSKDTTPAATTKKEDDSSSDSSSDSDSSSSDDSSSDDSDSDSDDVSMADAPGGDSDSDSSSSSSSSSSSSSSDDSSDDSDSDDEAATKTPKAAAAKAGPSSALKRKAESDSDSSSDSSDSEPETEKPKSKKAKTKAAAKEDSSDSDSSSSSSSSSDSSSDSDSDSDSESESAKVAETAAKVPLPESDSDSSSSSDSEDEKTPAKKDKKSSKKITADGGSDTSATLDKTSPAFEAATLADPPLPPNPSLNNRKGNGAKKQNEPFSRIKKDTYVDPRLSSNAYVSHEYGDRAHADLIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYRGGALDVNKSNSIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.44
3 0.43
4 0.39
5 0.37
6 0.33
7 0.31
8 0.36
9 0.34
10 0.35
11 0.31
12 0.28
13 0.29
14 0.29
15 0.29
16 0.31
17 0.34
18 0.37
19 0.41
20 0.45
21 0.45
22 0.44
23 0.43
24 0.39
25 0.45
26 0.45
27 0.5
28 0.54
29 0.51
30 0.52
31 0.57
32 0.56
33 0.54
34 0.53
35 0.52
36 0.53
37 0.55
38 0.54
39 0.48
40 0.43
41 0.35
42 0.31
43 0.22
44 0.13
45 0.1
46 0.09
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.1
51 0.12
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.13
59 0.12
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.14
72 0.21
73 0.26
74 0.31
75 0.38
76 0.48
77 0.59
78 0.62
79 0.68
80 0.71
81 0.71
82 0.73
83 0.74
84 0.73
85 0.63
86 0.62
87 0.54
88 0.46
89 0.41
90 0.33
91 0.24
92 0.14
93 0.12
94 0.07
95 0.06
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.16
112 0.17
113 0.15
114 0.16
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.25
119 0.26
120 0.3
121 0.31
122 0.29
123 0.28
124 0.31
125 0.32
126 0.32
127 0.29
128 0.25
129 0.23
130 0.24
131 0.2
132 0.14
133 0.1
134 0.08
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.16
207 0.15
208 0.18
209 0.21
210 0.25
211 0.23
212 0.24
213 0.27
214 0.29
215 0.31
216 0.31
217 0.29
218 0.25
219 0.26
220 0.26
221 0.23
222 0.2
223 0.18
224 0.15
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.15
232 0.17
233 0.22
234 0.25
235 0.33
236 0.41
237 0.48
238 0.56
239 0.6
240 0.68
241 0.69
242 0.77
243 0.77
244 0.76
245 0.73
246 0.64
247 0.6
248 0.51
249 0.46
250 0.38
251 0.3
252 0.21
253 0.18
254 0.16
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.19
308 0.21
309 0.24
310 0.33
311 0.39
312 0.43
313 0.51
314 0.6
315 0.67
316 0.75
317 0.81
318 0.82
319 0.83
320 0.8
321 0.78
322 0.72
323 0.63
324 0.55
325 0.46
326 0.36
327 0.28
328 0.24
329 0.17
330 0.13
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.13
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.18
353 0.24
354 0.33
355 0.41
356 0.48
357 0.52
358 0.51
359 0.58
360 0.63
361 0.64
362 0.65
363 0.67
364 0.65
365 0.66
366 0.74
367 0.75
368 0.72
369 0.7
370 0.7
371 0.69
372 0.72
373 0.66
374 0.61
375 0.57
376 0.56
377 0.59
378 0.59
379 0.58
380 0.53
381 0.52
382 0.51
383 0.48
384 0.47
385 0.38
386 0.31
387 0.26
388 0.26
389 0.27
390 0.25
391 0.25
392 0.24
393 0.25
394 0.24
395 0.22
396 0.2
397 0.18
398 0.18
399 0.16
400 0.15
401 0.17
402 0.19
403 0.21
404 0.2
405 0.19
406 0.22
407 0.24
408 0.31
409 0.32
410 0.39
411 0.46
412 0.56
413 0.67
414 0.75
415 0.81
416 0.83
417 0.89
418 0.9
419 0.89
420 0.89
421 0.86
422 0.83
423 0.81
424 0.75
425 0.68
426 0.58
427 0.54
428 0.48
429 0.45
430 0.4
431 0.34
432 0.31