Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136IXB3

Protein Details
Accession A0A136IXB3    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-117RTLKASKRKGTATKKPKEGKREKKRRDRTDDSLDABasic
159-185IERASRKEVKKPSQRRKRKDEEDLEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-109KASKRKGTATKKPKEGKREKKRRD
154-177RRRRAIERASRKEVKKPSQRRKRK
427-429KKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDRDSPAPAPATDTLHDGVETVPEDSTKDLGDYDVARAGDSDRDSDILSDVDEVDEDQFDEYDASAANIDERPVEIDEDVARTLKASKRKGTATKKPKEGKREKKRRDRTDDSLDAGDAEIYSGKRVRKAAAAAAEPEQPEPENEEDLTPEERRRRAIERASRKEVKKPSQRRKRKDEEDLEDELDEVIASLKIRMERACEADNVARSEGQPAIHKLKLLPEVMALLNRNNNQSAVVDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFTALVRLPIDKECLLSSGIGKVVLFYTKSKRPELGIKRMAEKLIGEWSRPILKRTHDYRKRHVESRDYDYQAAKLKQASQSSSQFTLTQRPAAQNAKDAERERFLAPASTSNRARVVGLPSSYTIAPRSTFDASRGPDHRPIGASGMEAFRKMTTSRKKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.25
3 0.23
4 0.22
5 0.18
6 0.15
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.13
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.18
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.16
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.13
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.15
72 0.19
73 0.27
74 0.32
75 0.38
76 0.43
77 0.52
78 0.61
79 0.67
80 0.73
81 0.75
82 0.77
83 0.81
84 0.84
85 0.83
86 0.84
87 0.85
88 0.85
89 0.86
90 0.88
91 0.89
92 0.91
93 0.95
94 0.95
95 0.93
96 0.91
97 0.87
98 0.86
99 0.79
100 0.71
101 0.61
102 0.5
103 0.4
104 0.31
105 0.23
106 0.13
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.08
111 0.12
112 0.13
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.23
117 0.25
118 0.28
119 0.29
120 0.29
121 0.27
122 0.27
123 0.28
124 0.24
125 0.22
126 0.18
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.17
137 0.15
138 0.18
139 0.22
140 0.24
141 0.26
142 0.3
143 0.32
144 0.37
145 0.45
146 0.51
147 0.56
148 0.63
149 0.69
150 0.72
151 0.69
152 0.7
153 0.7
154 0.7
155 0.69
156 0.72
157 0.75
158 0.78
159 0.87
160 0.88
161 0.89
162 0.89
163 0.87
164 0.86
165 0.84
166 0.8
167 0.75
168 0.69
169 0.59
170 0.48
171 0.4
172 0.29
173 0.2
174 0.12
175 0.06
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.13
186 0.16
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.2
192 0.18
193 0.17
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.14
201 0.18
202 0.18
203 0.18
204 0.17
205 0.2
206 0.22
207 0.21
208 0.18
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.12
214 0.1
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.12
247 0.11
248 0.13
249 0.12
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.1
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.17
283 0.23
284 0.28
285 0.29
286 0.3
287 0.32
288 0.42
289 0.47
290 0.51
291 0.52
292 0.51
293 0.53
294 0.53
295 0.5
296 0.41
297 0.33
298 0.24
299 0.25
300 0.24
301 0.2
302 0.19
303 0.22
304 0.28
305 0.29
306 0.29
307 0.25
308 0.3
309 0.38
310 0.46
311 0.54
312 0.56
313 0.63
314 0.71
315 0.78
316 0.79
317 0.77
318 0.75
319 0.73
320 0.7
321 0.7
322 0.69
323 0.61
324 0.57
325 0.51
326 0.48
327 0.46
328 0.41
329 0.35
330 0.29
331 0.3
332 0.34
333 0.37
334 0.37
335 0.36
336 0.4
337 0.42
338 0.41
339 0.38
340 0.35
341 0.33
342 0.38
343 0.34
344 0.34
345 0.32
346 0.33
347 0.38
348 0.41
349 0.41
350 0.39
351 0.4
352 0.4
353 0.43
354 0.43
355 0.41
356 0.38
357 0.4
358 0.34
359 0.32
360 0.28
361 0.26
362 0.25
363 0.28
364 0.29
365 0.34
366 0.35
367 0.36
368 0.38
369 0.34
370 0.34
371 0.3
372 0.32
373 0.3
374 0.29
375 0.28
376 0.27
377 0.29
378 0.27
379 0.25
380 0.21
381 0.18
382 0.18
383 0.18
384 0.22
385 0.24
386 0.25
387 0.26
388 0.32
389 0.33
390 0.39
391 0.41
392 0.41
393 0.44
394 0.45
395 0.45
396 0.4
397 0.38
398 0.33
399 0.31
400 0.27
401 0.23
402 0.26
403 0.24
404 0.22
405 0.21
406 0.18
407 0.2
408 0.21
409 0.28
410 0.34