FuNGI

G0W887

Protein Details

Accession

G0W887

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-439	DVVLVKKLYQRKTKKNRNWKLKRMAKEHKDID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-433	RKTKKNRNWKLKRMAK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
KEGG	ndi:NDAI_0C03380 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MNNTFGQHQHPHEHQQMLQTQQHQHQQVATVLCCNCGTPIDGSTGLVMCYDCIKMTVDITEGIPREANISFCRNCERFLQPPGQWIRADLESRELLAICLRRLKGLTKVRLVDASFIWTEPHSRRIRIKLTVQGEAMSNTIIQQTFEVEYVVIAMQCPDCARSYTTNTWRATVQIRQKVPHKRTFLYLEQLILRHNAHVDTISISEAKDGLDFFYSQKNHAVKMIDFLNSVVPIKSKKSEELISQDTHTGSSTYKFSYSVEIVPICRDDLVVLPKKLAKHLGNISQFVLCSKISNTVQFLDPTTLQTADLSPSLYWRSPFSALADVSQLTDFIVLDVDPTGISKGKRILADITIARTADLGINDQVYYARSHLGAILHAGDTVAGYFIANSNYNSELFDGLNIDYVPDVVLVKKLYQRKTKKNRNWKLKRMAKEHKDIDAAQDYSSKAQKQDMERAEKDYELFLQELEEDEEMRQTINLYKNNEAAAAAQIAAAANGMEEDEDPDAPQIDIDELLDELDEMTLDDPSEEQPQMQQPNM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.52
3	0.53
4	0.52
5	0.52
6	0.5
7	0.5
8	0.52
9	0.58
10	0.53
11	0.49
12	0.44
13	0.42
14	0.41
15	0.39
16	0.33
17	0.32
18	0.29
19	0.29
20	0.27
21	0.24
22	0.2
23	0.17
24	0.18
25	0.14
26	0.15
27	0.17
28	0.17
29	0.17
30	0.18
31	0.17
32	0.14
33	0.13
34	0.12
35	0.08
36	0.1
37	0.1
38	0.09
39	0.09
40	0.12
41	0.12
42	0.13
43	0.14
44	0.13
45	0.14
46	0.15
47	0.18
48	0.17
49	0.17
50	0.17
51	0.15
52	0.17
53	0.16
54	0.18
55	0.17
56	0.24
57	0.24
58	0.26
59	0.35
60	0.33
61	0.34
62	0.37
63	0.39
64	0.38
65	0.43
66	0.48
67	0.41
68	0.49
69	0.52
70	0.51
71	0.44
72	0.4
73	0.38
74	0.34
75	0.35
76	0.27
77	0.26
78	0.23
79	0.23
80	0.23
81	0.19
82	0.14
83	0.17
84	0.18
85	0.15
86	0.21
87	0.21
88	0.22
89	0.24
90	0.26
91	0.32
92	0.39
93	0.44
94	0.45
95	0.47
96	0.47
97	0.49
98	0.47
99	0.4
100	0.31
101	0.27
102	0.21
103	0.19
104	0.18
105	0.14
106	0.19
107	0.18
108	0.27
109	0.27
110	0.31
111	0.38
112	0.45
113	0.51
114	0.52
115	0.56
116	0.55
117	0.55
118	0.54
119	0.48
120	0.41
121	0.35
122	0.3
123	0.24
124	0.16
125	0.12
126	0.08
127	0.1
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.08
136	0.07
137	0.08
138	0.08
139	0.06
140	0.05
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.07
146	0.08
147	0.1
148	0.13
149	0.16
150	0.22
151	0.3
152	0.37
153	0.44
154	0.44
155	0.43
156	0.41
157	0.39
158	0.37
159	0.36
160	0.37
161	0.37
162	0.39
163	0.42
164	0.5
165	0.57
166	0.61
167	0.62
168	0.59
169	0.52
170	0.55
171	0.57
172	0.52
173	0.48
174	0.41
175	0.35
176	0.31
177	0.29
178	0.25
179	0.21
180	0.18
181	0.13
182	0.13
183	0.11
184	0.1
185	0.09
186	0.09
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.08
201	0.14
202	0.15
203	0.15
204	0.22
205	0.22
206	0.22
207	0.24
208	0.25
209	0.19
210	0.21
211	0.22
212	0.16
213	0.16
214	0.15
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.11
222	0.15
223	0.15
224	0.17
225	0.2
226	0.22
227	0.24
228	0.28
229	0.29
230	0.27
231	0.26
232	0.25
233	0.21
234	0.19
235	0.17
236	0.12
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.12
245	0.13
246	0.12
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.1
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.13
258	0.18
259	0.17
260	0.18
261	0.2
262	0.21
263	0.22
264	0.26
265	0.2
266	0.21
267	0.25
268	0.32
269	0.32
270	0.33
271	0.32
272	0.27
273	0.25
274	0.2
275	0.18
276	0.1
277	0.09
278	0.08
279	0.13
280	0.13
281	0.15
282	0.16
283	0.16
284	0.17
285	0.17
286	0.17
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.09
295	0.08
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.08
300	0.1
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.14
305	0.15
306	0.15
307	0.16
308	0.18
309	0.17
310	0.17
311	0.17
312	0.14
313	0.13
314	0.12
315	0.1
316	0.06
317	0.06
318	0.05
319	0.04
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.08
329	0.08
330	0.1
331	0.14
332	0.17
333	0.18
334	0.19
335	0.2
336	0.19
337	0.23
338	0.22
339	0.2
340	0.18
341	0.17
342	0.16
343	0.14
344	0.13
345	0.1
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.08
354	0.09
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.1
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.05
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.11
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.09
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.08
398	0.08
399	0.11
400	0.17
401	0.24
402	0.32
403	0.42
404	0.51
405	0.6
406	0.71
407	0.8
408	0.85
409	0.89
410	0.92
411	0.93
412	0.94
413	0.93
414	0.93
415	0.91
416	0.9
417	0.89
418	0.89
419	0.86
420	0.85
421	0.78
422	0.72
423	0.67
424	0.58
425	0.53
426	0.49
427	0.41
428	0.32
429	0.31
430	0.27
431	0.27
432	0.31
433	0.27
434	0.22
435	0.26
436	0.31
437	0.34
438	0.43
439	0.47
440	0.52
441	0.51
442	0.55
443	0.52
444	0.47
445	0.42
446	0.34
447	0.27
448	0.2
449	0.19
450	0.14
451	0.12
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.15
464	0.22
465	0.27
466	0.3
467	0.33
468	0.35
469	0.36
470	0.35
471	0.29
472	0.23
473	0.19
474	0.16
475	0.12
476	0.1
477	0.1
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.06
488	0.08
489	0.08
490	0.09
491	0.1
492	0.11
493	0.1
494	0.1
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.08
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.09
514	0.14
515	0.14
516	0.14
517	0.18
518	0.26

G0W887

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer