Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136J6U6

Protein Details
Accession A0A136J6U6    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-412SSVRQREKARADRRREEERKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-248EPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPR
352-359NKSSGRRA
398-417REKARADRRREEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLAASLAQALPKPKYTGEEEELPQHAQQRGPRIVGAGQIDESQVVLRRSGPPAYGQRSGWRPRGQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLEMGKKGSSTSNALAIQVDAEGKVKYDAIARQGHAENRIVQASFKDLIPLRQRANAGEIDLARPSEEEVAATAEKTKNALAALVSGAVAAQKPKNVNVGSRKDPTFVRYTPANQMGDHSKKQDRIMKIVERQRDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPRKLTAEDQEMWKIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFSEALFMADRHAREEVKQRAVMQQRLAEKEKQAKEDNLRSLAQKAREERAAANKSSGRRASSRDSRDSRDSRDSRSRSRSRSYSYSGSGSESDSSVRQREKARADRRREEERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQQAETMYDSRLFNQTSGFDSGFNEDNPYDKPLFQAQDAISSIYRPSAANDDYEDEEAGDREMAKIQRQSRYGEVLGKGTFKGAGDVEAREGPVQFEKDGGVDPFNVDKFLTEVDQSSSSKRGYGLQEDDSRQPKRARVDEEEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.29
4 0.34
5 0.39
6 0.4
7 0.44
8 0.43
9 0.46
10 0.47
11 0.44
12 0.39
13 0.37
14 0.34
15 0.32
16 0.34
17 0.38
18 0.4
19 0.4
20 0.4
21 0.36
22 0.34
23 0.35
24 0.33
25 0.25
26 0.22
27 0.2
28 0.2
29 0.17
30 0.16
31 0.13
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.16
36 0.2
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.28
41 0.37
42 0.42
43 0.44
44 0.41
45 0.45
46 0.52
47 0.58
48 0.59
49 0.57
50 0.53
51 0.54
52 0.61
53 0.56
54 0.5
55 0.48
56 0.42
57 0.35
58 0.33
59 0.28
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.22
80 0.2
81 0.22
82 0.23
83 0.28
84 0.26
85 0.25
86 0.24
87 0.21
88 0.18
89 0.14
90 0.13
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.15
100 0.2
101 0.24
102 0.24
103 0.29
104 0.32
105 0.34
106 0.33
107 0.33
108 0.29
109 0.27
110 0.29
111 0.24
112 0.21
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.16
117 0.18
118 0.17
119 0.24
120 0.31
121 0.35
122 0.33
123 0.36
124 0.37
125 0.34
126 0.36
127 0.3
128 0.25
129 0.23
130 0.21
131 0.18
132 0.17
133 0.16
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.21
167 0.21
168 0.28
169 0.34
170 0.4
171 0.43
172 0.47
173 0.47
174 0.43
175 0.43
176 0.4
177 0.37
178 0.31
179 0.29
180 0.26
181 0.29
182 0.33
183 0.37
184 0.35
185 0.29
186 0.31
187 0.35
188 0.37
189 0.36
190 0.35
191 0.33
192 0.36
193 0.41
194 0.46
195 0.4
196 0.41
197 0.46
198 0.47
199 0.5
200 0.53
201 0.55
202 0.5
203 0.51
204 0.47
205 0.43
206 0.41
207 0.42
208 0.45
209 0.43
210 0.44
211 0.52
212 0.56
213 0.55
214 0.61
215 0.61
216 0.63
217 0.68
218 0.77
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.76
224 0.72
225 0.66
226 0.58
227 0.53
228 0.49
229 0.52
230 0.52
231 0.53
232 0.52
233 0.55
234 0.56
235 0.53
236 0.51
237 0.5
238 0.49
239 0.46
240 0.42
241 0.37
242 0.35
243 0.34
244 0.32
245 0.29
246 0.22
247 0.16
248 0.18
249 0.2
250 0.28
251 0.3
252 0.38
253 0.43
254 0.48
255 0.52
256 0.49
257 0.49
258 0.42
259 0.41
260 0.35
261 0.39
262 0.34
263 0.35
264 0.37
265 0.34
266 0.3
267 0.31
268 0.29
269 0.19
270 0.18
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.13
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.22
301 0.26
302 0.28
303 0.29
304 0.29
305 0.34
306 0.39
307 0.4
308 0.33
309 0.32
310 0.32
311 0.35
312 0.37
313 0.32
314 0.31
315 0.37
316 0.38
317 0.38
318 0.37
319 0.38
320 0.41
321 0.45
322 0.45
323 0.39
324 0.37
325 0.33
326 0.34
327 0.34
328 0.31
329 0.29
330 0.29
331 0.29
332 0.3
333 0.3
334 0.29
335 0.35
336 0.34
337 0.3
338 0.31
339 0.31
340 0.31
341 0.35
342 0.35
343 0.28
344 0.27
345 0.31
346 0.36
347 0.42
348 0.46
349 0.49
350 0.51
351 0.54
352 0.6
353 0.59
354 0.56
355 0.57
356 0.53
357 0.52
358 0.57
359 0.57
360 0.57
361 0.64
362 0.65
363 0.61
364 0.66
365 0.65
366 0.61
367 0.62
368 0.59
369 0.53
370 0.49
371 0.45
372 0.38
373 0.34
374 0.29
375 0.24
376 0.19
377 0.15
378 0.13
379 0.13
380 0.14
381 0.17
382 0.17
383 0.21
384 0.24
385 0.31
386 0.39
387 0.48
388 0.56
389 0.62
390 0.69
391 0.74
392 0.76
393 0.8
394 0.77
395 0.76
396 0.75
397 0.76
398 0.78
399 0.76
400 0.73
401 0.67
402 0.66
403 0.65
404 0.65
405 0.62
406 0.56
407 0.54
408 0.54
409 0.51
410 0.49
411 0.41
412 0.32
413 0.33
414 0.37
415 0.37
416 0.37
417 0.36
418 0.39
419 0.4
420 0.41
421 0.34
422 0.27
423 0.24
424 0.19
425 0.19
426 0.16
427 0.14
428 0.12
429 0.14
430 0.13
431 0.15
432 0.15
433 0.16
434 0.14
435 0.16
436 0.17
437 0.17
438 0.22
439 0.21
440 0.22
441 0.25
442 0.24
443 0.25
444 0.28
445 0.26
446 0.19
447 0.19
448 0.19
449 0.19
450 0.22
451 0.2
452 0.17
453 0.17
454 0.19
455 0.19
456 0.18
457 0.17
458 0.14
459 0.15
460 0.17
461 0.2
462 0.19
463 0.17
464 0.2
465 0.23
466 0.25
467 0.24
468 0.28
469 0.23
470 0.27
471 0.27
472 0.27
473 0.21
474 0.2
475 0.19
476 0.15
477 0.16
478 0.11
479 0.12
480 0.16
481 0.17
482 0.17
483 0.19
484 0.21
485 0.22
486 0.23
487 0.21
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.13
492 0.1
493 0.08
494 0.08
495 0.14
496 0.15
497 0.2
498 0.27
499 0.32
500 0.39
501 0.41
502 0.45
503 0.44
504 0.48
505 0.45
506 0.44
507 0.4
508 0.37
509 0.36
510 0.33
511 0.29
512 0.24
513 0.22
514 0.16
515 0.17
516 0.13
517 0.15
518 0.16
519 0.17
520 0.19
521 0.19
522 0.19
523 0.18
524 0.18
525 0.16
526 0.19
527 0.2
528 0.17
529 0.17
530 0.17
531 0.17
532 0.19
533 0.18
534 0.15
535 0.14
536 0.16
537 0.19
538 0.19
539 0.19
540 0.16
541 0.15
542 0.15
543 0.16
544 0.16
545 0.13
546 0.14
547 0.16
548 0.21
549 0.22
550 0.24
551 0.26
552 0.25
553 0.25
554 0.25
555 0.28
556 0.29
557 0.36
558 0.38
559 0.41
560 0.48
561 0.5
562 0.57
563 0.58
564 0.55
565 0.54
566 0.54
567 0.53
568 0.55
569 0.59
570 0.6
571 0.6