Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4ZPB1

Protein Details
Accession E4ZPB1    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-47QDEEPPKKAAIRKKGRVNRVVDDHydrophilic
56-83VISKKATLQQPPPKKIKREPTPNLEETTHydrophilic
284-305VKKDTCAKSPVRKKARKEEVAEHydrophilic
1038-1065DVDLSKDKYVKQPKKKSVAKKATTAAKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-40PKKAAIRKKGR
246-261SKRKTPTSVGHKRKSP
274-300REEIRPKKGFVKKDTCAKSPVRKKARK
1048-1069KQPKKKSVAKKATTAAKRGQKK
1083-1098RPKGKGKAKAPAKGKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 9.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006272  P:leading strand elongation  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF00533  BRCT  
PF08519  RFC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
CDD cd00009  AAA  
cd17752  BRCT_RFC1  
cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MPADIRSFFGGGPKPTSGNQGSQKQDEEPPKKAAIRKKGRVNRVVDDSDDDEGDLVISKKATLQQPPPKKIKREPTPNLEETTTSAFFASTNMPKRSEPFQKKVLNMPKDTHRVTPTKAHGKASKVATSTSNGRASGRTRKPVTSYAERDDDDEFPDDDFAEADDIFGDEVKSKGRGKDDYSASSESDHYVAVHLPHRETPRALLGRKLLKNEDDFMPGEDDVEMKDSSAEEDMPESQEDKQAMKSKRKTPTSVGHKRKSPELDANEEKKDEDREEIRPKKGFVKKDTCAKSPVRKKARKEEVAESADIQAIYDSIPTVRAPTPPARNPDAKFDWRANAGRADPAPLSGSSGDMPSGSETCLAGLNFVFTGVLQRWGRTEAQELVKRHGGKVTGAPSKKTNYVVLGSDAGPSKLQKIKDMDIKTIDEDGLTLLIEKLTEAGNKGDSKAQAAYKEQQRKEEEKIRKQAAELEQEEMIHMKDMKVANAASGRQTATNAAATAEPIIDSRLWTTKYAPTTLSQICGNKIVVEKIQRWLQMYPKNLKTGFKLAGKDGSGVFRAIMLHGPPGIGKTTAAHLVAKLEGYDIVERNASDTRSKKLIEDGLRGVLNTNSLHGYFAGDGKNVEESKKKLVLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAAVCKKTEIPMILICNDRRLPKMKPFDFVTYDLPFRRPTVDQVRSRIMTIAFREGLKIPGPVVNALIEGSHADIRQVVNMISTAKLDQDAMDFDRGKQMSKSWEKHVILKPWDITQKILGGGMFASSSNATLNDKIELYFNDHEFSPLMLQENYLGTNPILSLGLSGKEKNLRNLELASQAADSISDGDLVDRMIHGSQQQWSLMPTHAVFSFVRPASFVSGSTANNQTRFTSWLGKNSSGNKLSRMIKEIQAHMRLRSSGDRHEVRQQYVPILWTELVQKLQKQGKDAVPQVIELMDSYFLTKDDFDAIMELGVGPMDQDKIKIESQAKAAFTRIYNQQSHPLPFMKASSVVAPKKQVKEKPDLEEAIEESDDGEVVEEVKEDDDDVDLSKDKYVKQPKKKSVAKKATTAAKRGQKKASDESDEGEENYVRPKGKGKAKAPAKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.39
4 0.36
5 0.38
6 0.44
7 0.48
8 0.52
9 0.53
10 0.54
11 0.51
12 0.55
13 0.58
14 0.56
15 0.52
16 0.52
17 0.54
18 0.57
19 0.6
20 0.62
21 0.62
22 0.67
23 0.71
24 0.77
25 0.81
26 0.85
27 0.86
28 0.83
29 0.8
30 0.77
31 0.7
32 0.61
33 0.57
34 0.49
35 0.43
36 0.36
37 0.28
38 0.2
39 0.17
40 0.15
41 0.12
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.12
47 0.19
48 0.25
49 0.3
50 0.4
51 0.49
52 0.6
53 0.69
54 0.76
55 0.79
56 0.82
57 0.84
58 0.84
59 0.85
60 0.85
61 0.86
62 0.85
63 0.86
64 0.8
65 0.74
66 0.65
67 0.55
68 0.47
69 0.44
70 0.34
71 0.25
72 0.22
73 0.18
74 0.16
75 0.17
76 0.2
77 0.22
78 0.29
79 0.32
80 0.35
81 0.36
82 0.4
83 0.47
84 0.52
85 0.54
86 0.52
87 0.59
88 0.63
89 0.65
90 0.71
91 0.73
92 0.7
93 0.65
94 0.63
95 0.63
96 0.64
97 0.64
98 0.6
99 0.56
100 0.53
101 0.53
102 0.57
103 0.57
104 0.59
105 0.6
106 0.61
107 0.59
108 0.59
109 0.62
110 0.59
111 0.54
112 0.46
113 0.44
114 0.39
115 0.38
116 0.39
117 0.38
118 0.36
119 0.32
120 0.32
121 0.34
122 0.38
123 0.44
124 0.46
125 0.49
126 0.5
127 0.53
128 0.56
129 0.59
130 0.62
131 0.61
132 0.59
133 0.56
134 0.57
135 0.53
136 0.5
137 0.46
138 0.39
139 0.32
140 0.28
141 0.23
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.13
146 0.12
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.13
160 0.17
161 0.21
162 0.26
163 0.31
164 0.35
165 0.43
166 0.46
167 0.47
168 0.48
169 0.46
170 0.4
171 0.37
172 0.33
173 0.26
174 0.21
175 0.17
176 0.12
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.17
181 0.18
182 0.19
183 0.25
184 0.29
185 0.31
186 0.31
187 0.31
188 0.35
189 0.4
190 0.39
191 0.38
192 0.41
193 0.48
194 0.5
195 0.52
196 0.46
197 0.44
198 0.45
199 0.44
200 0.39
201 0.33
202 0.31
203 0.28
204 0.26
205 0.22
206 0.19
207 0.16
208 0.13
209 0.1
210 0.12
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.21
229 0.29
230 0.35
231 0.44
232 0.51
233 0.56
234 0.65
235 0.7
236 0.69
237 0.67
238 0.71
239 0.72
240 0.74
241 0.76
242 0.74
243 0.73
244 0.71
245 0.72
246 0.67
247 0.62
248 0.6
249 0.55
250 0.56
251 0.58
252 0.6
253 0.55
254 0.5
255 0.44
256 0.37
257 0.36
258 0.28
259 0.26
260 0.25
261 0.3
262 0.41
263 0.47
264 0.5
265 0.5
266 0.5
267 0.54
268 0.58
269 0.58
270 0.57
271 0.59
272 0.59
273 0.66
274 0.7
275 0.63
276 0.62
277 0.61
278 0.62
279 0.63
280 0.68
281 0.69
282 0.71
283 0.76
284 0.81
285 0.84
286 0.82
287 0.78
288 0.74
289 0.72
290 0.67
291 0.6
292 0.5
293 0.4
294 0.33
295 0.27
296 0.2
297 0.11
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.09
306 0.1
307 0.12
308 0.16
309 0.23
310 0.31
311 0.35
312 0.41
313 0.43
314 0.48
315 0.48
316 0.52
317 0.51
318 0.48
319 0.47
320 0.43
321 0.41
322 0.4
323 0.4
324 0.34
325 0.31
326 0.27
327 0.27
328 0.24
329 0.24
330 0.19
331 0.18
332 0.17
333 0.14
334 0.15
335 0.11
336 0.12
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.04
357 0.07
358 0.07
359 0.14
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.18
364 0.19
365 0.18
366 0.21
367 0.19
368 0.26
369 0.32
370 0.33
371 0.34
372 0.38
373 0.38
374 0.35
375 0.32
376 0.26
377 0.21
378 0.24
379 0.27
380 0.3
381 0.3
382 0.32
383 0.33
384 0.35
385 0.36
386 0.33
387 0.28
388 0.23
389 0.24
390 0.23
391 0.21
392 0.2
393 0.17
394 0.17
395 0.16
396 0.14
397 0.12
398 0.11
399 0.14
400 0.16
401 0.17
402 0.2
403 0.23
404 0.28
405 0.35
406 0.37
407 0.35
408 0.34
409 0.35
410 0.3
411 0.27
412 0.23
413 0.14
414 0.12
415 0.09
416 0.07
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.07
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.14
432 0.14
433 0.15
434 0.17
435 0.18
436 0.17
437 0.2
438 0.26
439 0.31
440 0.4
441 0.4
442 0.44
443 0.48
444 0.49
445 0.53
446 0.56
447 0.57
448 0.57
449 0.64
450 0.6
451 0.56
452 0.52
453 0.52
454 0.47
455 0.45
456 0.37
457 0.31
458 0.27
459 0.26
460 0.26
461 0.19
462 0.15
463 0.08
464 0.08
465 0.06
466 0.1
467 0.1
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.11
475 0.12
476 0.12
477 0.1
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.09
495 0.11
496 0.11
497 0.13
498 0.16
499 0.18
500 0.19
501 0.19
502 0.17
503 0.21
504 0.21
505 0.2
506 0.18
507 0.18
508 0.17
509 0.18
510 0.17
511 0.13
512 0.13
513 0.13
514 0.13
515 0.16
516 0.16
517 0.18
518 0.21
519 0.21
520 0.22
521 0.23
522 0.27
523 0.29
524 0.32
525 0.36
526 0.35
527 0.38
528 0.37
529 0.37
530 0.33
531 0.33
532 0.32
533 0.29
534 0.28
535 0.24
536 0.26
537 0.25
538 0.23
539 0.19
540 0.16
541 0.13
542 0.11
543 0.1
544 0.08
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.08
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.09
565 0.08
566 0.07
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.09
576 0.1
577 0.11
578 0.14
579 0.15
580 0.18
581 0.21
582 0.22
583 0.2
584 0.22
585 0.28
586 0.26
587 0.28
588 0.26
589 0.25
590 0.25
591 0.24
592 0.21
593 0.15
594 0.13
595 0.1
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.07
603 0.09
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.12
609 0.11
610 0.12
611 0.14
612 0.15
613 0.2
614 0.23
615 0.22
616 0.21
617 0.22
618 0.22
619 0.21
620 0.21
621 0.17
622 0.14
623 0.14
624 0.11
625 0.1
626 0.08
627 0.05
628 0.04
629 0.03
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.02
636 0.03
637 0.03
638 0.04
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.06
645 0.08
646 0.09
647 0.11
648 0.13
649 0.15
650 0.17
651 0.21
652 0.2
653 0.22
654 0.23
655 0.23
656 0.23
657 0.25
658 0.27
659 0.33
660 0.43
661 0.41
662 0.43
663 0.45
664 0.47
665 0.46
666 0.44
667 0.39
668 0.31
669 0.32
670 0.29
671 0.27
672 0.23
673 0.21
674 0.21
675 0.18
676 0.23
677 0.3
678 0.38
679 0.4
680 0.44
681 0.48
682 0.46
683 0.45
684 0.4
685 0.31
686 0.26
687 0.23
688 0.23
689 0.19
690 0.18
691 0.19
692 0.18
693 0.19
694 0.16
695 0.15
696 0.11
697 0.12
698 0.13
699 0.12
700 0.12
701 0.1
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.06
706 0.05
707 0.06
708 0.07
709 0.06
710 0.06
711 0.08
712 0.08
713 0.09
714 0.1
715 0.08
716 0.07
717 0.08
718 0.09
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.07
723 0.08
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.09
728 0.1
729 0.14
730 0.14
731 0.14
732 0.2
733 0.2
734 0.21
735 0.2
736 0.21
737 0.26
738 0.35
739 0.38
740 0.37
741 0.47
742 0.47
743 0.55
744 0.59
745 0.57
746 0.51
747 0.51
748 0.47
749 0.42
750 0.45
751 0.37
752 0.32
753 0.26
754 0.24
755 0.21
756 0.2
757 0.15
758 0.11
759 0.1
760 0.09
761 0.07
762 0.05
763 0.06
764 0.05
765 0.06
766 0.06
767 0.07
768 0.08
769 0.09
770 0.1
771 0.11
772 0.11
773 0.11
774 0.12
775 0.12
776 0.17
777 0.19
778 0.19
779 0.19
780 0.18
781 0.19
782 0.17
783 0.17
784 0.12
785 0.1
786 0.12
787 0.1
788 0.1
789 0.11
790 0.11
791 0.11
792 0.11
793 0.11
794 0.08
795 0.09
796 0.08
797 0.08
798 0.07
799 0.06
800 0.07
801 0.07
802 0.09
803 0.11
804 0.11
805 0.13
806 0.2
807 0.23
808 0.29
809 0.33
810 0.32
811 0.33
812 0.34
813 0.33
814 0.3
815 0.28
816 0.22
817 0.17
818 0.15
819 0.12
820 0.11
821 0.09
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.06
826 0.06
827 0.06
828 0.07
829 0.07
830 0.05
831 0.06
832 0.06
833 0.07
834 0.08
835 0.1
836 0.13
837 0.15
838 0.15
839 0.15
840 0.16
841 0.17
842 0.17
843 0.17
844 0.14
845 0.14
846 0.13
847 0.16
848 0.15
849 0.15
850 0.21
851 0.2
852 0.19
853 0.18
854 0.19
855 0.2
856 0.21
857 0.19
858 0.15
859 0.18
860 0.19
861 0.22
862 0.28
863 0.26
864 0.28
865 0.29
866 0.27
867 0.25
868 0.27
869 0.26
870 0.29
871 0.29
872 0.35
873 0.38
874 0.4
875 0.43
876 0.46
877 0.5
878 0.46
879 0.45
880 0.4
881 0.43
882 0.46
883 0.44
884 0.44
885 0.39
886 0.41
887 0.44
888 0.48
889 0.48
890 0.5
891 0.49
892 0.46
893 0.45
894 0.4
895 0.38
896 0.39
897 0.35
898 0.34
899 0.41
900 0.42
901 0.43
902 0.52
903 0.53
904 0.49
905 0.51
906 0.46
907 0.41
908 0.39
909 0.37
910 0.28
911 0.26
912 0.22
913 0.17
914 0.19
915 0.18
916 0.21
917 0.22
918 0.23
919 0.29
920 0.35
921 0.36
922 0.37
923 0.41
924 0.43
925 0.49
926 0.5
927 0.48
928 0.43
929 0.41
930 0.37
931 0.31
932 0.24
933 0.16
934 0.14
935 0.08
936 0.07
937 0.08
938 0.08
939 0.08
940 0.09
941 0.09
942 0.09
943 0.11
944 0.11
945 0.11
946 0.11
947 0.11
948 0.1
949 0.1
950 0.09
951 0.06
952 0.06
953 0.05
954 0.04
955 0.05
956 0.07
957 0.07
958 0.08
959 0.11
960 0.15
961 0.16
962 0.22
963 0.25
964 0.27
965 0.33
966 0.37
967 0.36
968 0.34
969 0.35
970 0.32
971 0.3
972 0.31
973 0.33
974 0.35
975 0.37
976 0.38
977 0.45
978 0.47
979 0.49
980 0.49
981 0.43
982 0.39
983 0.36
984 0.35
985 0.29
986 0.25
987 0.23
988 0.25
989 0.31
990 0.33
991 0.35
992 0.42
993 0.47
994 0.54
995 0.61
996 0.62
997 0.6
998 0.66
999 0.69
1000 0.67
1001 0.68
1002 0.61
1003 0.54
1004 0.51
1005 0.45
1006 0.38
1007 0.31
1008 0.24
1009 0.16
1010 0.14
1011 0.12
1012 0.09
1013 0.08
1014 0.05
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.06
1018 0.07
1019 0.07
1020 0.08
1021 0.07
1022 0.08
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.1
1026 0.11
1027 0.13
1028 0.14
1029 0.17
1030 0.19
1031 0.21
1032 0.3
1033 0.4
1034 0.49
1035 0.58
1036 0.68
1037 0.75
1038 0.83
1039 0.9
1040 0.91
1041 0.91
1042 0.92
1043 0.87
1044 0.84
1045 0.82
1046 0.81
1047 0.78
1048 0.73
1049 0.71
1050 0.69
1051 0.72
1052 0.72
1053 0.72
1054 0.69
1055 0.7
1056 0.73
1057 0.72
1058 0.7
1059 0.63
1060 0.59
1061 0.55
1062 0.5
1063 0.43
1064 0.37
1065 0.29
1066 0.22
1067 0.25
1068 0.26
1069 0.22
1070 0.22
1071 0.29
1072 0.35
1073 0.44
1074 0.54
1075 0.55
1076 0.62
1077 0.69
1078 0.76