Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JIC4

Protein Details
Accession A0A136JIC4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-281QSTSSSKLSQRSRRRRWVMEAQLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010378  TRAPPC13  
Pfam View protein in Pfam  
PF06159  DUF974  
Amino Acid Sequences MSHQRYPSIDPVKEPHGVSLKVLRLSRPSLVSQHPLLAPSAAAAPLASSSIPASLAYQTAADTNPDPFLLTPVLNLPPSFGSAYVGETFSCTLCANNETHGDDGGAAVANQQHKQKRLIRDVRIEAEMKTPGSGTAQQLTLTPSGGSSAKLAGGSADDSKQEGGSASSAGVDLEPGQTLQKIVNFDLKDEGNHVLAVTVSYYEATETSGRTRTFRKLYQFICKGALIVRTKVGVLPAPGDKAATHGEGETTSQSEGGSQSTSSSKLSQRSRRRRWVMEAQLENCSEDAMQLSRVALELDSGVHYRDCNWEASGSPRPLLQPGEIQQCCFIVGEDEEGSAVEGADGRIVFGVLGIGWRSEMGSKGYLTTGKLGTRAAAAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.4
4 0.39
5 0.37
6 0.4
7 0.4
8 0.41
9 0.42
10 0.38
11 0.37
12 0.4
13 0.42
14 0.38
15 0.36
16 0.36
17 0.4
18 0.42
19 0.39
20 0.39
21 0.36
22 0.33
23 0.3
24 0.25
25 0.19
26 0.15
27 0.14
28 0.1
29 0.09
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.13
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.1
77 0.11
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.12
82 0.12
83 0.13
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.12
91 0.1
92 0.07
93 0.05
94 0.06
95 0.08
96 0.1
97 0.13
98 0.19
99 0.23
100 0.27
101 0.35
102 0.41
103 0.47
104 0.56
105 0.62
106 0.63
107 0.67
108 0.68
109 0.63
110 0.59
111 0.51
112 0.41
113 0.35
114 0.3
115 0.22
116 0.17
117 0.14
118 0.11
119 0.12
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.1
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.09
195 0.13
196 0.14
197 0.16
198 0.19
199 0.24
200 0.29
201 0.33
202 0.38
203 0.4
204 0.43
205 0.51
206 0.51
207 0.46
208 0.43
209 0.39
210 0.32
211 0.27
212 0.3
213 0.22
214 0.2
215 0.19
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.11
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.12
250 0.15
251 0.18
252 0.25
253 0.35
254 0.43
255 0.53
256 0.63
257 0.72
258 0.79
259 0.83
260 0.81
261 0.81
262 0.81
263 0.8
264 0.78
265 0.74
266 0.65
267 0.61
268 0.55
269 0.48
270 0.37
271 0.27
272 0.18
273 0.12
274 0.11
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.16
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.19
298 0.25
299 0.31
300 0.27
301 0.26
302 0.26
303 0.26
304 0.28
305 0.29
306 0.25
307 0.23
308 0.27
309 0.37
310 0.36
311 0.35
312 0.33
313 0.31
314 0.3
315 0.24
316 0.18
317 0.11
318 0.11
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.09
326 0.08
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.04
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.13
348 0.15
349 0.15
350 0.17
351 0.2
352 0.21
353 0.21
354 0.24
355 0.24
356 0.23
357 0.25
358 0.24
359 0.22