FuNGI

A0A136JDP2

Protein Details

Accession

A0A136JDP2

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-58	SGNPLVSRKRVVRRPPPTANAP	Hydrophilic
208-234	VKEVAVKKKDPKKEKKPHTQVAWQPRT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
27-50	PLRKPPNRGGSGNPLVSRKRVVRR
213-224	VKKKDPKKEKKP
434-448	RKRLGKDLKKALRKR
510-528	GKKSAAEAAKKGKSLKRPG
589-597	GKKKRKGLL

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSSNAPNGVAAPGTGAQKPTPPPGANPLRKPPNRGGSGNPLVSRKRVVRRPPPTANAPAASSVTNLPGSLPKHVPLSQQKPQNFESLRAQNGGWSFPKPEGANDYPLRITKRALKEGMRFHVMRLVPAQRFAKPDDLGVDPTNQNEFTRPVTLHRRDPRQPPPGRELKVEHIPEPPVVDDAEVQRLAQIKEAREAQRALDDAQKAPVVKEVAVKKKDPKKEKKPHTQVAWQPRTEQQRKEGEIRYEEALPWHLEDADARNVWVGQYEAPLSHAKVALLIDGQGFRMIPLEKWYRFTSKRGAIQAMTVEEAEKAMAQQAPMTRWAMRDAQREAKEKAMADSRVIMYGRAAVKQESASFRNASRREKMDHDDIDMSGDEFQDDDETAGYEPDRDEDTKDSVDRVRREQLGANLFGDANEKEVERVEKEELKEEEERKRLGKDLKKALRKRDKQFQYDSDSSNDRDPFATSSSESESDSDAEKKDDDKKGDKDKDKTAAASGTSSKGTNTPQGKKSAAEAAKKGKSLKRPGSPMASDSSGTESTRKKTKTGINSSRPSRGGTPLPGSQRGRGAGSGSDGEGTAGEMSDGAGGKKKRKGLLGGDARPTPGGSRAGSPAAAGGASGTVSTPRAGSPAAGAAKSWTNAPTLEEISAALPARPQGLSIGELMKVFAGRISKTEGQDGLMPRKEWLRLVKLSCDFGEDRLLRRKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.18
4	0.23
5	0.27
6	0.31
7	0.36
8	0.35
9	0.37
10	0.45
11	0.55
12	0.58
13	0.62
14	0.66
15	0.69
16	0.72
17	0.76
18	0.75
19	0.74
20	0.72
21	0.68
22	0.64
23	0.63
24	0.66
25	0.64
26	0.58
27	0.54
28	0.5
29	0.5
30	0.5
31	0.49
32	0.51
33	0.55
34	0.62
35	0.67
36	0.74
37	0.81
38	0.84
39	0.82
40	0.79
41	0.77
42	0.72
43	0.63
44	0.55
45	0.47
46	0.39
47	0.32
48	0.27
49	0.21
50	0.18
51	0.16
52	0.15
53	0.13
54	0.17
55	0.19
56	0.23
57	0.24
58	0.24
59	0.28
60	0.31
61	0.38
62	0.43
63	0.5
64	0.52
65	0.58
66	0.59
67	0.6
68	0.6
69	0.6
70	0.52
71	0.48
72	0.5
73	0.47
74	0.47
75	0.43
76	0.41
77	0.35
78	0.34
79	0.34
80	0.27
81	0.22
82	0.22
83	0.21
84	0.27
85	0.24
86	0.25
87	0.29
88	0.31
89	0.37
90	0.36
91	0.38
92	0.35
93	0.38
94	0.4
95	0.33
96	0.33
97	0.34
98	0.41
99	0.46
100	0.49
101	0.52
102	0.55
103	0.61
104	0.64
105	0.61
106	0.53
107	0.46
108	0.47
109	0.41
110	0.35
111	0.33
112	0.34
113	0.29
114	0.35
115	0.37
116	0.33
117	0.36
118	0.37
119	0.38
120	0.31
121	0.31
122	0.28
123	0.28
124	0.28
125	0.26
126	0.27
127	0.21
128	0.22
129	0.23
130	0.21
131	0.19
132	0.18
133	0.19
134	0.18
135	0.21
136	0.2
137	0.24
138	0.34
139	0.39
140	0.46
141	0.53
142	0.59
143	0.62
144	0.71
145	0.74
146	0.74
147	0.76
148	0.72
149	0.73
150	0.73
151	0.69
152	0.64
153	0.59
154	0.54
155	0.56
156	0.52
157	0.45
158	0.39
159	0.38
160	0.34
161	0.3
162	0.24
163	0.17
164	0.14
165	0.13
166	0.12
167	0.12
168	0.15
169	0.14
170	0.13
171	0.14
172	0.17
173	0.17
174	0.21
175	0.23
176	0.2
177	0.25
178	0.32
179	0.33
180	0.33
181	0.33
182	0.29
183	0.28
184	0.28
185	0.25
186	0.24
187	0.23
188	0.2
189	0.21
190	0.22
191	0.19
192	0.18
193	0.2
194	0.16
195	0.15
196	0.2
197	0.26
198	0.33
199	0.37
200	0.4
201	0.45
202	0.52
203	0.61
204	0.66
205	0.69
206	0.72
207	0.79
208	0.86
209	0.89
210	0.9
211	0.9
212	0.86
213	0.84
214	0.8
215	0.81
216	0.78
217	0.67
218	0.59
219	0.57
220	0.6
221	0.57
222	0.53
223	0.49
224	0.5
225	0.53
226	0.57
227	0.56
228	0.5
229	0.47
230	0.45
231	0.4
232	0.32
233	0.28
234	0.23
235	0.2
236	0.16
237	0.13
238	0.11
239	0.09
240	0.08
241	0.09
242	0.12
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.09
251	0.05
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.09
256	0.1
257	0.1
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.07
273	0.08
274	0.07
275	0.13
276	0.19
277	0.19
278	0.23
279	0.26
280	0.3
281	0.32
282	0.35
283	0.38
284	0.38
285	0.42
286	0.42
287	0.41
288	0.34
289	0.33
290	0.32
291	0.24
292	0.19
293	0.13
294	0.1
295	0.08
296	0.08
297	0.06
298	0.05
299	0.04
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.12
307	0.13
308	0.12
309	0.13
310	0.15
311	0.19
312	0.22
313	0.27
314	0.29
315	0.36
316	0.39
317	0.43
318	0.41
319	0.39
320	0.36
321	0.31
322	0.29
323	0.26
324	0.22
325	0.18
326	0.19
327	0.17
328	0.17
329	0.16
330	0.14
331	0.09
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.12
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.15
340	0.14
341	0.15
342	0.16
343	0.16
344	0.18
345	0.25
346	0.28
347	0.3
348	0.31
349	0.33
350	0.34
351	0.37
352	0.39
353	0.38
354	0.35
355	0.33
356	0.29
357	0.26
358	0.24
359	0.2
360	0.16
361	0.09
362	0.09
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.08
378	0.08
379	0.09
380	0.11
381	0.14
382	0.14
383	0.15
384	0.15
385	0.17
386	0.23
387	0.24
388	0.25
389	0.28
390	0.28
391	0.3
392	0.31
393	0.32
394	0.3
395	0.28
396	0.25
397	0.2
398	0.19
399	0.17
400	0.16
401	0.11
402	0.09
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.11
408	0.1
409	0.12
410	0.14
411	0.17
412	0.18
413	0.23
414	0.23
415	0.25
416	0.29
417	0.31
418	0.35
419	0.34
420	0.36
421	0.32
422	0.32
423	0.34
424	0.38
425	0.41
426	0.42
427	0.49
428	0.56
429	0.64
430	0.69
431	0.74
432	0.77
433	0.79
434	0.78
435	0.78
436	0.78
437	0.74
438	0.75
439	0.7
440	0.67
441	0.62
442	0.56
443	0.49
444	0.43
445	0.38
446	0.36
447	0.31
448	0.23
449	0.2
450	0.2
451	0.18
452	0.17
453	0.17
454	0.13
455	0.14
456	0.16
457	0.16
458	0.16
459	0.15
460	0.14
461	0.14
462	0.15
463	0.15
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.16
468	0.23
469	0.27
470	0.3
471	0.35
472	0.42
473	0.52
474	0.6
475	0.65
476	0.62
477	0.64
478	0.65
479	0.6
480	0.53
481	0.45
482	0.37
483	0.31
484	0.28
485	0.23
486	0.18
487	0.17
488	0.17
489	0.15
490	0.15
491	0.17
492	0.22
493	0.28
494	0.34
495	0.37
496	0.42
497	0.42
498	0.41
499	0.41
500	0.43
501	0.4
502	0.38
503	0.39
504	0.43
505	0.45
506	0.47
507	0.5
508	0.46
509	0.49
510	0.55
511	0.59
512	0.58
513	0.61
514	0.63
515	0.64
516	0.6
517	0.53
518	0.47
519	0.4
520	0.32
521	0.26
522	0.26
523	0.21
524	0.2
525	0.23
526	0.23
527	0.25
528	0.33
529	0.34
530	0.32
531	0.38
532	0.45
533	0.51
534	0.59
535	0.65
536	0.66
537	0.73
538	0.76
539	0.75
540	0.68
541	0.6
542	0.52
543	0.47
544	0.42
545	0.38
546	0.38
547	0.37
548	0.41
549	0.46
550	0.45
551	0.42
552	0.42
553	0.39
554	0.35
555	0.3
556	0.27
557	0.2
558	0.21
559	0.19
560	0.15
561	0.14
562	0.12
563	0.11
564	0.09
565	0.09
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.04
570	0.04
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.13
575	0.16
576	0.23
577	0.28
578	0.34
579	0.37
580	0.42
581	0.48
582	0.49
583	0.56
584	0.6
585	0.6
586	0.6
587	0.56
588	0.52
589	0.46
590	0.39
591	0.29
592	0.23
593	0.21
594	0.17
595	0.19
596	0.21
597	0.23
598	0.22
599	0.21
600	0.17
601	0.14
602	0.12
603	0.09
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.08
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.11
618	0.16
619	0.19
620	0.18
621	0.18
622	0.19
623	0.21
624	0.21
625	0.22
626	0.16
627	0.15
628	0.16
629	0.18
630	0.19
631	0.18
632	0.18
633	0.17
634	0.16
635	0.15
636	0.18
637	0.16
638	0.12
639	0.11
640	0.12
641	0.14
642	0.13
643	0.13
644	0.12
645	0.13
646	0.14
647	0.16
648	0.16
649	0.15
650	0.15
651	0.15
652	0.14
653	0.12
654	0.11
655	0.11
656	0.13
657	0.12
658	0.15
659	0.22
660	0.27
661	0.29
662	0.33
663	0.32
664	0.3
665	0.35
666	0.39
667	0.4
668	0.4
669	0.38
670	0.36
671	0.4
672	0.4
673	0.4
674	0.43
675	0.42
676	0.44
677	0.48
678	0.55
679	0.54
680	0.56
681	0.5
682	0.48
683	0.41
684	0.35
685	0.4
686	0.34
687	0.36

A0A136JDP2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer