Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136J4S0

Protein Details
Accession A0A136J4S0    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-113RTKPKSTVAKKAPSSKKKENPNEVFRECHydrophilic
245-264NKKNQKAKARSVKKASKRLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-103APRTKPKSTVAKKAPSSKKK
242-262KNGNKKNQKAKARSVKKASKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MDMHPIQYDLGDLQISHPSVKPFVLGEPDFALHNSSTDVSSSLTAEDFDLNMLDEVCLPPQTSYAELPQVAITKTEPASTPRSAPRTKPKSTVAKKAPSSKKKENPNEVFRECPELLEKALEMGAWSQFFRGKAVEEAFEKIVQLVNRPAHVRQQEARDNRKPGQLLTPKRPINRFMLYRKTYQTFVVAHCKLVRHQMISKLCGVAWHLESDDVKAKFMQLQENDSDGLEAAFEGYKFNPAKNGNKKNQKAKARSVKKASKRLQDATNLSTSVCQTSPVPHMPVTPPTQRPLLNYPKSSQNINYVYWSNPMQPLHGSYQGPPALNNFYLKRGNVQHYLPNAAQFTMDPMLGSQSAMVGFNTPHGLPLGGNMDLSYRLPGAFPLIAQQHDGSVLTSPFNDFGLLDDFNYGDFLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.17
4 0.19
5 0.21
6 0.22
7 0.22
8 0.22
9 0.18
10 0.2
11 0.26
12 0.24
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.23
17 0.23
18 0.22
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.11
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.17
52 0.2
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.21
57 0.19
58 0.18
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.18
63 0.17
64 0.19
65 0.24
66 0.25
67 0.3
68 0.33
69 0.4
70 0.42
71 0.49
72 0.56
73 0.59
74 0.62
75 0.63
76 0.64
77 0.68
78 0.71
79 0.74
80 0.72
81 0.72
82 0.73
83 0.77
84 0.79
85 0.78
86 0.8
87 0.8
88 0.79
89 0.81
90 0.85
91 0.85
92 0.84
93 0.83
94 0.83
95 0.75
96 0.7
97 0.6
98 0.57
99 0.46
100 0.38
101 0.31
102 0.24
103 0.21
104 0.19
105 0.17
106 0.11
107 0.11
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.19
125 0.19
126 0.18
127 0.16
128 0.13
129 0.14
130 0.12
131 0.13
132 0.16
133 0.17
134 0.19
135 0.21
136 0.21
137 0.26
138 0.28
139 0.3
140 0.28
141 0.35
142 0.41
143 0.47
144 0.54
145 0.54
146 0.57
147 0.56
148 0.56
149 0.49
150 0.43
151 0.45
152 0.45
153 0.45
154 0.47
155 0.53
156 0.53
157 0.56
158 0.57
159 0.51
160 0.48
161 0.48
162 0.46
163 0.44
164 0.49
165 0.48
166 0.49
167 0.49
168 0.45
169 0.4
170 0.35
171 0.32
172 0.24
173 0.25
174 0.3
175 0.26
176 0.25
177 0.25
178 0.26
179 0.23
180 0.28
181 0.26
182 0.2
183 0.22
184 0.29
185 0.3
186 0.31
187 0.31
188 0.24
189 0.22
190 0.2
191 0.19
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.16
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.2
207 0.15
208 0.18
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.16
213 0.15
214 0.1
215 0.08
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.17
227 0.21
228 0.31
229 0.41
230 0.5
231 0.53
232 0.63
233 0.7
234 0.74
235 0.79
236 0.79
237 0.76
238 0.76
239 0.78
240 0.77
241 0.78
242 0.78
243 0.78
244 0.78
245 0.82
246 0.79
247 0.77
248 0.74
249 0.71
250 0.66
251 0.64
252 0.59
253 0.51
254 0.46
255 0.37
256 0.3
257 0.27
258 0.22
259 0.17
260 0.13
261 0.11
262 0.1
263 0.13
264 0.18
265 0.2
266 0.21
267 0.2
268 0.22
269 0.23
270 0.27
271 0.29
272 0.31
273 0.3
274 0.31
275 0.34
276 0.33
277 0.36
278 0.39
279 0.44
280 0.44
281 0.45
282 0.45
283 0.49
284 0.5
285 0.49
286 0.43
287 0.41
288 0.37
289 0.36
290 0.37
291 0.3
292 0.29
293 0.29
294 0.28
295 0.22
296 0.23
297 0.22
298 0.2
299 0.19
300 0.22
301 0.23
302 0.27
303 0.25
304 0.22
305 0.29
306 0.31
307 0.3
308 0.27
309 0.26
310 0.24
311 0.25
312 0.27
313 0.22
314 0.24
315 0.27
316 0.27
317 0.31
318 0.33
319 0.38
320 0.38
321 0.4
322 0.41
323 0.4
324 0.44
325 0.39
326 0.36
327 0.31
328 0.26
329 0.24
330 0.18
331 0.19
332 0.15
333 0.15
334 0.11
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.1
347 0.13
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.1
353 0.14
354 0.15
355 0.13
356 0.13
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.14
367 0.13
368 0.12
369 0.16
370 0.19
371 0.2
372 0.21
373 0.21
374 0.18
375 0.18
376 0.19
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.1
387 0.12
388 0.15
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.13