Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JC80

Protein Details
Accession A0A136JC80    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-243TPSGGKAKRERERKAKNVLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-55R
71-110SRANQGRGTDEPARGGARGGRGARDRGGPGSGRPRNRDDR
228-238GKAKRERERKA
261-305RGGRGGARGDGGRGRGDGARGGRGRGEGRGRGGNRGSDFPRGGAR
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 12, nucl 6.5, mito 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFALLGNDEEEPPSGPVKTVDKVTARTTKRNVEPEAPAKPANAGSARRGPGGNEGAFRDRNAGSRANQGRGTDEPARGGARGGRGARDRGGPGSGRPRNRDDRHSKSQPSGGTDKQAAQSWGANEGDAEQKDEQAGEEIAQKEFKEAAAEDAEGPETPAEPETKSVSYTEYLAQQLEKKASLGDNLEIRKPNEGSKADKKWANAKALEKEEGEDFITPSGGKAKRERERKAKNVLDIDQAWVENERPTTTSAPRGGRGGARGDGGRGRGDGARGGRGRGEGRGRGGNRGSDFPRGGARGGRDTAGFNANDQSAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.16
5 0.15
6 0.14
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.16
11 0.2
12 0.22
13 0.24
14 0.28
15 0.31
16 0.34
17 0.4
18 0.46
19 0.47
20 0.52
21 0.55
22 0.58
23 0.62
24 0.66
25 0.64
26 0.6
27 0.63
28 0.62
29 0.6
30 0.55
31 0.48
32 0.4
33 0.37
34 0.32
35 0.29
36 0.28
37 0.25
38 0.27
39 0.34
40 0.35
41 0.35
42 0.34
43 0.31
44 0.32
45 0.35
46 0.32
47 0.26
48 0.28
49 0.31
50 0.31
51 0.31
52 0.28
53 0.23
54 0.25
55 0.26
56 0.27
57 0.24
58 0.33
59 0.37
60 0.37
61 0.39
62 0.35
63 0.36
64 0.33
65 0.38
66 0.32
67 0.29
68 0.25
69 0.25
70 0.25
71 0.22
72 0.21
73 0.17
74 0.15
75 0.19
76 0.19
77 0.22
78 0.24
79 0.26
80 0.27
81 0.28
82 0.27
83 0.23
84 0.25
85 0.21
86 0.22
87 0.3
88 0.35
89 0.37
90 0.4
91 0.45
92 0.53
93 0.57
94 0.63
95 0.62
96 0.65
97 0.69
98 0.73
99 0.69
100 0.62
101 0.62
102 0.55
103 0.5
104 0.46
105 0.38
106 0.33
107 0.31
108 0.3
109 0.27
110 0.27
111 0.22
112 0.18
113 0.19
114 0.16
115 0.17
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.14
121 0.12
122 0.14
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.08
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.12
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.21
182 0.21
183 0.23
184 0.22
185 0.23
186 0.25
187 0.27
188 0.31
189 0.37
190 0.42
191 0.44
192 0.46
193 0.45
194 0.46
195 0.49
196 0.47
197 0.43
198 0.43
199 0.44
200 0.45
201 0.45
202 0.37
203 0.33
204 0.28
205 0.25
206 0.21
207 0.14
208 0.11
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.14
214 0.16
215 0.19
216 0.25
217 0.35
218 0.43
219 0.52
220 0.61
221 0.64
222 0.72
223 0.77
224 0.81
225 0.76
226 0.74
227 0.71
228 0.65
229 0.59
230 0.5
231 0.44
232 0.35
233 0.29
234 0.23
235 0.18
236 0.17
237 0.13
238 0.14
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.19
243 0.2
244 0.26
245 0.3
246 0.32
247 0.33
248 0.34
249 0.33
250 0.32
251 0.32
252 0.29
253 0.24
254 0.23
255 0.22
256 0.22
257 0.23
258 0.22
259 0.2
260 0.17
261 0.17
262 0.16
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.25
267 0.25
268 0.26
269 0.26
270 0.28
271 0.29
272 0.31
273 0.35
274 0.31
275 0.34
276 0.42
277 0.41
278 0.45
279 0.46
280 0.45
281 0.42
282 0.45
283 0.43
284 0.41
285 0.41
286 0.36
287 0.38
288 0.34
289 0.33
290 0.31
291 0.32
292 0.31
293 0.32
294 0.32
295 0.27
296 0.27
297 0.29
298 0.3
299 0.26
300 0.21
301 0.23
302 0.23
303 0.22
304 0.2
305 0.2
306 0.17