Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A136J1W8

Protein Details
Accession A0A136J1W8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-315KRSAAGGPPRKKRRRGQAKTGKLKEPBasic
403-426RVACGFTRRYRRRHEGLGKNGRKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-312RQRSKRSAAGGPPRKKRRRGQAKTGKL
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8.5, cyto_mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MPNRQLSAAGSGLVENPFIKKRNLDWTINLPAQDESEDAVQQEDQTPSSSLAPPTAAVEAGYAHVEDHLAYFTQILQKGTQSPYPSNSPHLTVDEYRELYNANSGNRNGSHFIIHQHDHPIAGTHYDLRLQINETSSASWAIMYGLPGDPNSVRLNRNATETRVHCLWNHLIETASSHTGFLLIWDTGTYSILPRRSKYAPAIDPDSERSSSSSSSSASSSDSEGGHTTHDKQGRPRRRHAPMTEQQKLHRAFANRKVRLQLHGTRLPRNYVLNLRLTRGEDVAGRQRSKRSAAGGPPRKKRRRGQAKTGKLKEPVMTSSDEDGSRENDDCIRVKDEDEDNDANEDVKAPVVQAGQQQEGISALEKELRELEDEEVRRTNAYMGAENTIGSVHQRRWYLSLDRVACGFTRRYRRRHEGLGKNGRKVEWVDQERADGTKQGGGDGRLKFPFYVRGVEVERSVITGRLGADILRDEGVVDYVNRQGWHPVLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.15
4 0.2
5 0.23
6 0.25
7 0.27
8 0.32
9 0.42
10 0.48
11 0.48
12 0.48
13 0.53
14 0.58
15 0.56
16 0.51
17 0.42
18 0.36
19 0.32
20 0.28
21 0.21
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.12
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.2
36 0.22
37 0.19
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.18
42 0.17
43 0.14
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.15
61 0.17
62 0.18
63 0.18
64 0.2
65 0.25
66 0.28
67 0.3
68 0.28
69 0.29
70 0.32
71 0.37
72 0.37
73 0.38
74 0.37
75 0.36
76 0.34
77 0.33
78 0.33
79 0.29
80 0.32
81 0.32
82 0.31
83 0.28
84 0.26
85 0.25
86 0.21
87 0.24
88 0.21
89 0.19
90 0.22
91 0.22
92 0.26
93 0.26
94 0.29
95 0.26
96 0.24
97 0.24
98 0.21
99 0.24
100 0.26
101 0.26
102 0.25
103 0.26
104 0.26
105 0.23
106 0.22
107 0.2
108 0.15
109 0.15
110 0.14
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.12
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.1
136 0.09
137 0.11
138 0.14
139 0.16
140 0.17
141 0.2
142 0.25
143 0.24
144 0.3
145 0.3
146 0.29
147 0.33
148 0.33
149 0.34
150 0.31
151 0.31
152 0.25
153 0.27
154 0.28
155 0.23
156 0.23
157 0.19
158 0.18
159 0.16
160 0.18
161 0.15
162 0.14
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.1
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.23
183 0.24
184 0.28
185 0.31
186 0.36
187 0.34
188 0.36
189 0.4
190 0.36
191 0.35
192 0.35
193 0.33
194 0.25
195 0.22
196 0.2
197 0.17
198 0.16
199 0.16
200 0.14
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.15
217 0.2
218 0.21
219 0.29
220 0.39
221 0.48
222 0.53
223 0.59
224 0.63
225 0.66
226 0.73
227 0.68
228 0.68
229 0.65
230 0.69
231 0.67
232 0.59
233 0.53
234 0.53
235 0.5
236 0.41
237 0.38
238 0.33
239 0.32
240 0.41
241 0.5
242 0.44
243 0.45
244 0.48
245 0.45
246 0.44
247 0.45
248 0.41
249 0.38
250 0.42
251 0.43
252 0.43
253 0.43
254 0.42
255 0.37
256 0.32
257 0.28
258 0.26
259 0.26
260 0.28
261 0.27
262 0.27
263 0.27
264 0.27
265 0.25
266 0.2
267 0.18
268 0.12
269 0.14
270 0.21
271 0.24
272 0.24
273 0.25
274 0.28
275 0.3
276 0.33
277 0.33
278 0.29
279 0.3
280 0.36
281 0.45
282 0.52
283 0.58
284 0.65
285 0.73
286 0.77
287 0.8
288 0.79
289 0.8
290 0.81
291 0.82
292 0.83
293 0.83
294 0.86
295 0.88
296 0.86
297 0.8
298 0.71
299 0.65
300 0.56
301 0.48
302 0.39
303 0.3
304 0.27
305 0.23
306 0.22
307 0.22
308 0.19
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.15
317 0.17
318 0.18
319 0.2
320 0.18
321 0.19
322 0.23
323 0.24
324 0.24
325 0.27
326 0.26
327 0.23
328 0.24
329 0.23
330 0.18
331 0.15
332 0.14
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.13
341 0.16
342 0.16
343 0.17
344 0.17
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.11
349 0.08
350 0.08
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.17
359 0.2
360 0.22
361 0.24
362 0.25
363 0.24
364 0.23
365 0.22
366 0.21
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.17
374 0.16
375 0.13
376 0.11
377 0.11
378 0.14
379 0.15
380 0.2
381 0.22
382 0.23
383 0.26
384 0.31
385 0.34
386 0.36
387 0.41
388 0.38
389 0.37
390 0.36
391 0.34
392 0.3
393 0.28
394 0.27
395 0.27
396 0.36
397 0.43
398 0.51
399 0.6
400 0.68
401 0.71
402 0.77
403 0.8
404 0.79
405 0.82
406 0.85
407 0.82
408 0.79
409 0.75
410 0.65
411 0.57
412 0.51
413 0.48
414 0.47
415 0.46
416 0.45
417 0.42
418 0.44
419 0.42
420 0.4
421 0.33
422 0.25
423 0.21
424 0.19
425 0.18
426 0.18
427 0.2
428 0.21
429 0.27
430 0.27
431 0.31
432 0.3
433 0.31
434 0.29
435 0.29
436 0.34
437 0.29
438 0.32
439 0.27
440 0.31
441 0.33
442 0.35
443 0.34
444 0.28
445 0.25
446 0.22
447 0.22
448 0.18
449 0.14
450 0.14
451 0.14
452 0.14
453 0.14
454 0.12
455 0.13
456 0.14
457 0.15
458 0.13
459 0.12
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.11
464 0.1
465 0.11
466 0.14
467 0.17
468 0.17
469 0.18
470 0.22