FuNGI

A0A136ISG3

Protein Details

Accession

A0A136ISG3

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-42	PVLPPGSDKKSKKAKKEHKTKKRDREPDASIDS	Basic
71-97	DDVTTEGKKKKDKKRSRTKGAEQVVEP	Basic
104-130	VESEAPTVKKEKKSKKSKNTAVPESQP	Hydrophilic
136-161	APAVEEPTKKKKKRERKSKDHDTIAA	Basic
186-205	STPVAKKTKKSSKSKSSSTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-37	DKKSKKAKKEHKTKKRDREPD
45-49	RKSKK
78-89	KKKKDKKRSRTK
112-121	KKEKKSKKSK
143-154	TKKKKKRERKSK
456-460	RRRKK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 12.666, cyto 11, mito_nucl 8.666, cyto_mito 7.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSAMVSDAPPVLPPGSDKKSKKAKKEHKTKKRDREPDASIDSSERKSKKARQEIADNVGDDGPAPAVNGVDDVTTEGKKKKDKKRSRTKGAEQVVEPDAAMDVVESEAPTVKKEKKSKKSKNTAVPESQPEPAVEAPAVEEPTKKKKKRERKSKDHDTIAAAAAEAAAIEEKEAAEADGDAMDIDSTPVAKKTKKSSKSKSSSTSKATSTLNTSSADRKFPFFTQTVSLYLPLFPQGMTEPLEGYADQHLKLLVNRYVPDLKGILLAYRNPRLGERPGAKSLTENSGMEDVALLESIAEYAVAFGWFTAEVDIFRPTRGAWMEGKINLQSEGFVGVICFDMFNASIEASRLPEGWRWVDLMSSSKNSKTASDSTPDPFNENANQGEEGADGETEQLHTTGYWVDASGARVTGTLPFRIKNYEVGSSETHGYLSIEGTMLNEEDELARVLDERAEARRRKKHLAGGYLQRQIRRIPDFATTRFAADPLKDEEDEAQRAVQYKGTVAAGDESD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.28
3	0.38
4	0.41
5	0.48
6	0.59
7	0.67
8	0.74
9	0.77
10	0.81
11	0.82
12	0.9
13	0.92
14	0.92
15	0.95
16	0.96
17	0.96
18	0.96
19	0.95
20	0.92
21	0.9
22	0.85
23	0.83
24	0.78
25	0.69
26	0.59
27	0.53
28	0.49
29	0.43
30	0.45
31	0.38
32	0.36
33	0.43
34	0.51
35	0.58
36	0.64
37	0.69
38	0.68
39	0.76
40	0.78
41	0.76
42	0.71
43	0.61
44	0.52
45	0.43
46	0.35
47	0.26
48	0.19
49	0.12
50	0.08
51	0.08
52	0.06
53	0.06
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.05
58	0.05
59	0.07
60	0.1
61	0.11
62	0.15
63	0.19
64	0.25
65	0.34
66	0.44
67	0.52
68	0.61
69	0.71
70	0.79
71	0.86
72	0.91
73	0.93
74	0.94
75	0.93
76	0.92
77	0.88
78	0.83
79	0.72
80	0.66
81	0.57
82	0.46
83	0.36
84	0.25
85	0.18
86	0.12
87	0.11
88	0.05
89	0.04
90	0.04
91	0.05
92	0.04
93	0.05
94	0.08
95	0.09
96	0.11
97	0.16
98	0.23
99	0.32
100	0.42
101	0.52
102	0.6
103	0.71
104	0.81
105	0.86
106	0.9
107	0.91
108	0.91
109	0.9
110	0.88
111	0.83
112	0.77
113	0.72
114	0.64
115	0.56
116	0.46
117	0.37
118	0.31
119	0.24
120	0.2
121	0.14
122	0.11
123	0.1
124	0.11
125	0.13
126	0.1
127	0.13
128	0.16
129	0.27
130	0.38
131	0.42
132	0.5
133	0.6
134	0.7
135	0.79
136	0.86
137	0.86
138	0.88
139	0.93
140	0.95
141	0.93
142	0.87
143	0.79
144	0.7
145	0.61
146	0.51
147	0.4
148	0.28
149	0.19
150	0.13
151	0.1
152	0.06
153	0.04
154	0.03
155	0.03
156	0.03
157	0.03
158	0.03
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.03
169	0.03
170	0.03
171	0.03
172	0.03
173	0.04
174	0.04
175	0.07
176	0.1
177	0.13
178	0.18
179	0.28
180	0.38
181	0.47
182	0.57
183	0.64
184	0.72
185	0.77
186	0.8
187	0.79
188	0.76
189	0.73
190	0.68
191	0.62
192	0.52
193	0.48
194	0.42
195	0.35
196	0.31
197	0.26
198	0.23
199	0.2
200	0.2
201	0.22
202	0.23
203	0.26
204	0.22
205	0.23
206	0.23
207	0.23
208	0.26
209	0.21
210	0.21
211	0.2
212	0.2
213	0.2
214	0.18
215	0.18
216	0.14
217	0.14
218	0.12
219	0.1
220	0.09
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.08
225	0.09
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.08
231	0.09
232	0.11
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.11
239	0.14
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.16
244	0.18
245	0.17
246	0.17
247	0.14
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.12
254	0.14
255	0.17
256	0.17
257	0.16
258	0.17
259	0.19
260	0.21
261	0.25
262	0.26
263	0.28
264	0.3
265	0.31
266	0.3
267	0.28
268	0.27
269	0.24
270	0.21
271	0.17
272	0.15
273	0.15
274	0.14
275	0.13
276	0.11
277	0.07
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.02
286	0.02
287	0.02
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.06
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.12
305	0.13
306	0.15
307	0.14
308	0.17
309	0.19
310	0.2
311	0.22
312	0.19
313	0.18
314	0.16
315	0.14
316	0.12
317	0.09
318	0.09
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.11
340	0.14
341	0.15
342	0.16
343	0.16
344	0.15
345	0.15
346	0.14
347	0.16
348	0.16
349	0.18
350	0.19
351	0.19
352	0.22
353	0.22
354	0.23
355	0.24
356	0.26
357	0.25
358	0.27
359	0.29
360	0.29
361	0.33
362	0.32
363	0.3
364	0.26
365	0.25
366	0.24
367	0.24
368	0.23
369	0.2
370	0.19
371	0.17
372	0.16
373	0.14
374	0.11
375	0.09
376	0.08
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.1
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.11
398	0.15
399	0.16
400	0.19
401	0.2
402	0.21
403	0.23
404	0.27
405	0.28
406	0.29
407	0.3
408	0.31
409	0.31
410	0.33
411	0.33
412	0.31
413	0.31
414	0.25
415	0.22
416	0.16
417	0.15
418	0.12
419	0.11
420	0.09
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.1
438	0.12
439	0.18
440	0.27
441	0.34
442	0.43
443	0.52
444	0.58
445	0.65
446	0.7
447	0.73
448	0.73
449	0.74
450	0.73
451	0.75
452	0.76
453	0.75
454	0.71
455	0.64
456	0.57
457	0.52
458	0.51
459	0.46
460	0.4
461	0.35
462	0.4
463	0.44
464	0.44
465	0.46
466	0.39
467	0.37
468	0.35
469	0.34
470	0.28
471	0.23
472	0.25
473	0.25
474	0.29
475	0.26
476	0.27
477	0.31
478	0.33
479	0.34
480	0.31
481	0.26
482	0.24
483	0.26
484	0.26
485	0.24
486	0.19
487	0.18
488	0.2
489	0.2
490	0.18
491	0.17

A0A136ISG3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer