Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A136J3C6

Protein Details
Accession A0A136J3C6    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
500-522PEPAPGKRGRKRKGDKPEFSLNFBasic
626-655YRKQMEALGPPKRRRNRPKRPRMGEGQESPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
503-515APGKRGRKRKGDK
634-647GPPKRRRNRPKRPR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
Amino Acid Sequences MSSFIRSSKLNKPGSGFQIKPRGVAGGSRISEALGQIEKTKNASTAPSTTAGKSTASGGAAVDVVAAPRKSCPNPRCPNPSAPISEGYCTACGREIDASNIVAEVQFGETSSGAAMVQGQFVGADQSTARSMGPGFRRMGGIADNRDRTARDAKHRMNELAHALSINSSTVDIAIQIFKLAMNENWIQGRGMEKVIVVCLYTACRREDRCQIMLIDFAEIVKINVYELGHVFKNLNDIYSFQNHHVRSIIPEDLMFRFADKLDFGEFTNNVAESAIKLCRRMGRDWMVMGRRPSGICGACLLMAARMWNFRRTVKEVVYVVKVTTATIEQRLDEFNVTESSGLTIEDFLNQEFLESRHDPPSFYKGSAEWKEKQDKERLEAGRKRRMIEDISEDVVRSARASVSRDMPPPPLPRPEPDMSKLRQVSDFLPRSFDNSEGSELIAPFDPNSVPKPAPRITPAATDVAAGLAAEDPNAEDALDDLAQLHGEGPVEEEEPEPEPEPAPGKRGRKRKGDKPEFSLNFDEEWERDEAELEKQINEVISDPHSDEHQRALASAAFRAKVKAEWARSLLPRVQVPNDETIGEHEFDDDPEVANCVLPPEQVKIKEVIWLNSNKAYLREQQEKIYRKQMEALGPPKRRRNRPKRPRMGEGQESPASTAEEAAMQVAERRGYSRRINYDAINMIFDKNKKRGPGSVASTVLDRDDLSRRTSRANSVVADTPQPRPDEPSSRSAADSSSSSKQQEKPAGKNAKAAAAEEEEEEEEEDNVPYDDGEDLEHPGYDDEDYEEGEGYWDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.65
3 0.58
4 0.57
5 0.62
6 0.59
7 0.55
8 0.48
9 0.42
10 0.33
11 0.34
12 0.3
13 0.29
14 0.29
15 0.29
16 0.28
17 0.25
18 0.25
19 0.23
20 0.22
21 0.15
22 0.15
23 0.19
24 0.23
25 0.24
26 0.26
27 0.28
28 0.25
29 0.25
30 0.28
31 0.27
32 0.28
33 0.29
34 0.31
35 0.31
36 0.31
37 0.31
38 0.28
39 0.25
40 0.21
41 0.21
42 0.19
43 0.17
44 0.16
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.06
51 0.07
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.14
56 0.21
57 0.27
58 0.37
59 0.44
60 0.51
61 0.61
62 0.7
63 0.75
64 0.74
65 0.77
66 0.73
67 0.72
68 0.66
69 0.58
70 0.55
71 0.47
72 0.43
73 0.37
74 0.33
75 0.28
76 0.23
77 0.21
78 0.19
79 0.17
80 0.18
81 0.2
82 0.19
83 0.21
84 0.23
85 0.22
86 0.19
87 0.18
88 0.16
89 0.12
90 0.1
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.16
120 0.21
121 0.25
122 0.25
123 0.26
124 0.27
125 0.27
126 0.28
127 0.26
128 0.27
129 0.29
130 0.35
131 0.35
132 0.35
133 0.36
134 0.36
135 0.35
136 0.38
137 0.38
138 0.41
139 0.49
140 0.54
141 0.61
142 0.65
143 0.63
144 0.56
145 0.53
146 0.47
147 0.38
148 0.32
149 0.24
150 0.2
151 0.17
152 0.15
153 0.12
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.17
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.17
177 0.14
178 0.14
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.1
188 0.13
189 0.15
190 0.17
191 0.22
192 0.26
193 0.31
194 0.39
195 0.43
196 0.41
197 0.41
198 0.4
199 0.36
200 0.34
201 0.29
202 0.21
203 0.14
204 0.12
205 0.1
206 0.08
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.12
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.21
227 0.22
228 0.2
229 0.27
230 0.26
231 0.27
232 0.27
233 0.24
234 0.22
235 0.24
236 0.22
237 0.15
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.17
242 0.14
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.07
261 0.1
262 0.13
263 0.12
264 0.13
265 0.16
266 0.2
267 0.24
268 0.26
269 0.3
270 0.33
271 0.34
272 0.35
273 0.39
274 0.38
275 0.38
276 0.37
277 0.31
278 0.26
279 0.24
280 0.23
281 0.22
282 0.19
283 0.16
284 0.16
285 0.14
286 0.12
287 0.13
288 0.12
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.11
294 0.13
295 0.16
296 0.17
297 0.2
298 0.25
299 0.29
300 0.33
301 0.3
302 0.33
303 0.32
304 0.32
305 0.32
306 0.27
307 0.22
308 0.19
309 0.17
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.11
342 0.13
343 0.15
344 0.19
345 0.2
346 0.21
347 0.22
348 0.27
349 0.24
350 0.22
351 0.21
352 0.17
353 0.25
354 0.3
355 0.33
356 0.31
357 0.35
358 0.43
359 0.46
360 0.49
361 0.48
362 0.45
363 0.44
364 0.48
365 0.46
366 0.47
367 0.5
368 0.53
369 0.54
370 0.54
371 0.51
372 0.44
373 0.43
374 0.36
375 0.32
376 0.31
377 0.24
378 0.24
379 0.22
380 0.21
381 0.18
382 0.16
383 0.13
384 0.08
385 0.06
386 0.05
387 0.07
388 0.1
389 0.12
390 0.15
391 0.18
392 0.2
393 0.21
394 0.23
395 0.26
396 0.27
397 0.28
398 0.3
399 0.29
400 0.29
401 0.34
402 0.34
403 0.33
404 0.33
405 0.36
406 0.32
407 0.38
408 0.37
409 0.31
410 0.29
411 0.28
412 0.26
413 0.3
414 0.32
415 0.25
416 0.27
417 0.26
418 0.28
419 0.27
420 0.25
421 0.18
422 0.15
423 0.16
424 0.13
425 0.14
426 0.12
427 0.11
428 0.11
429 0.09
430 0.08
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.09
436 0.12
437 0.12
438 0.13
439 0.19
440 0.2
441 0.22
442 0.24
443 0.26
444 0.24
445 0.27
446 0.27
447 0.23
448 0.21
449 0.19
450 0.16
451 0.12
452 0.1
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.1
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.14
489 0.13
490 0.16
491 0.22
492 0.3
493 0.37
494 0.47
495 0.54
496 0.61
497 0.69
498 0.75
499 0.8
500 0.82
501 0.8
502 0.77
503 0.8
504 0.71
505 0.67
506 0.6
507 0.49
508 0.39
509 0.34
510 0.28
511 0.17
512 0.17
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.11
518 0.11
519 0.15
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.13
524 0.12
525 0.11
526 0.1
527 0.08
528 0.09
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.15
537 0.14
538 0.13
539 0.14
540 0.15
541 0.14
542 0.16
543 0.16
544 0.14
545 0.15
546 0.16
547 0.15
548 0.14
549 0.19
550 0.24
551 0.25
552 0.28
553 0.31
554 0.35
555 0.36
556 0.39
557 0.36
558 0.33
559 0.32
560 0.31
561 0.31
562 0.29
563 0.29
564 0.29
565 0.27
566 0.23
567 0.2
568 0.21
569 0.21
570 0.18
571 0.15
572 0.13
573 0.13
574 0.13
575 0.15
576 0.12
577 0.1
578 0.09
579 0.11
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.1
587 0.13
588 0.18
589 0.19
590 0.21
591 0.21
592 0.21
593 0.26
594 0.27
595 0.25
596 0.26
597 0.27
598 0.28
599 0.3
600 0.31
601 0.26
602 0.26
603 0.28
604 0.29
605 0.34
606 0.4
607 0.38
608 0.45
609 0.53
610 0.57
611 0.58
612 0.6
613 0.55
614 0.48
615 0.51
616 0.48
617 0.46
618 0.47
619 0.51
620 0.51
621 0.57
622 0.63
623 0.68
624 0.72
625 0.77
626 0.8
627 0.84
628 0.85
629 0.88
630 0.93
631 0.94
632 0.93
633 0.9
634 0.89
635 0.86
636 0.84
637 0.77
638 0.72
639 0.63
640 0.55
641 0.48
642 0.39
643 0.31
644 0.22
645 0.17
646 0.11
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.07
651 0.06
652 0.09
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.13
657 0.16
658 0.22
659 0.3
660 0.36
661 0.41
662 0.46
663 0.49
664 0.48
665 0.5
666 0.5
667 0.43
668 0.37
669 0.31
670 0.27
671 0.29
672 0.32
673 0.33
674 0.34
675 0.37
676 0.4
677 0.43
678 0.47
679 0.49
680 0.54
681 0.53
682 0.53
683 0.51
684 0.47
685 0.44
686 0.38
687 0.32
688 0.24
689 0.17
690 0.14
691 0.18
692 0.2
693 0.24
694 0.28
695 0.3
696 0.36
697 0.39
698 0.43
699 0.42
700 0.44
701 0.41
702 0.4
703 0.43
704 0.38
705 0.41
706 0.37
707 0.36
708 0.36
709 0.37
710 0.34
711 0.36
712 0.41
713 0.43
714 0.45
715 0.46
716 0.47
717 0.46
718 0.46
719 0.4
720 0.35
721 0.28
722 0.27
723 0.25
724 0.26
725 0.28
726 0.3
727 0.36
728 0.41
729 0.47
730 0.54
731 0.57
732 0.59
733 0.65
734 0.72
735 0.67
736 0.68
737 0.61
738 0.59
739 0.52
740 0.45
741 0.39
742 0.32
743 0.31
744 0.25
745 0.25
746 0.19
747 0.18
748 0.18
749 0.15
750 0.12
751 0.12
752 0.11
753 0.1
754 0.1
755 0.09
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.07
760 0.09
761 0.09
762 0.12
763 0.13
764 0.13
765 0.13
766 0.13
767 0.13
768 0.12
769 0.12
770 0.11
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.12
775 0.11