Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A136J9E6

Protein Details
Accession A0A136J9E6    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-208SSSSRRREDRHHHSSRRHRHRSRSGDRHRHSERBasic
225-246REGSRERRSRRHRSTSRDGRSDBasic
278-304ESERTTDRRRDRSRSPRRDPKEDSYRRBasic
322-348RDSYDNKNNNRGKRRQDRDHQEFRDSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-298RRREDRHHHSSRRHRHRSRSGDRHRHSERSSRRHHHSRRSDSASDREGSRERRSRRHRSTSRDGRSDRDGAYSKGREGRTEGSHRRRRSVSDDRAPRQESERTTDRRRDRSRSPRRDPK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGNNLLLKKSWHPGLMKNQDRVWQEEKKALDERKKTEARLQEIKEERAKEDLQRQLEAAGAKPKLDKVDWMYQGPTDGQGDNHELEAFLLGKRRIDNVLTRNDGTENLKKNAGEQSFMALQNANTERDTQSKIREDPMLAMKKAEQAAYESMMNDPIRRRQLLASRGMADEKDSSSSSRRREDRHHHSSRRHRHRSRSGDRHRHSERSSRRHHHSRRSDSASDREGSRERRSRRHRSTSRDGRSDRDGAYSKGREGRTEGSHRRRRSVSDDRAPRQESERTTDRRRDRSRSPRRDPKEDSYRRTRDYSPEPSRDRQRNDGRDSYDNKNNNRGKRRQDRDHQEFRDSRRGLPSHDLPNKNPGGSHKGSNNNDNDEEERARKLAAMQAAATDLDKDRESRLAALAQKEQADREADDKAREHSHKFGGGDRDFANGLRRKQLGLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.52
3 0.6
4 0.63
5 0.62
6 0.61
7 0.62
8 0.62
9 0.6
10 0.56
11 0.53
12 0.49
13 0.49
14 0.48
15 0.47
16 0.53
17 0.54
18 0.57
19 0.57
20 0.59
21 0.64
22 0.67
23 0.64
24 0.64
25 0.64
26 0.63
27 0.64
28 0.62
29 0.61
30 0.62
31 0.65
32 0.63
33 0.57
34 0.5
35 0.47
36 0.46
37 0.43
38 0.46
39 0.47
40 0.44
41 0.42
42 0.41
43 0.36
44 0.36
45 0.31
46 0.25
47 0.25
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.25
52 0.27
53 0.26
54 0.28
55 0.28
56 0.37
57 0.39
58 0.4
59 0.38
60 0.34
61 0.35
62 0.31
63 0.26
64 0.18
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.15
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.11
76 0.09
77 0.14
78 0.14
79 0.16
80 0.17
81 0.19
82 0.2
83 0.23
84 0.29
85 0.3
86 0.38
87 0.39
88 0.39
89 0.38
90 0.36
91 0.36
92 0.34
93 0.35
94 0.33
95 0.31
96 0.33
97 0.32
98 0.33
99 0.38
100 0.33
101 0.28
102 0.22
103 0.24
104 0.25
105 0.26
106 0.24
107 0.17
108 0.16
109 0.21
110 0.23
111 0.2
112 0.16
113 0.18
114 0.19
115 0.22
116 0.27
117 0.23
118 0.28
119 0.32
120 0.33
121 0.34
122 0.35
123 0.32
124 0.32
125 0.38
126 0.37
127 0.31
128 0.3
129 0.28
130 0.3
131 0.3
132 0.26
133 0.18
134 0.15
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.13
139 0.12
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.2
145 0.24
146 0.24
147 0.26
148 0.27
149 0.34
150 0.38
151 0.41
152 0.37
153 0.35
154 0.35
155 0.34
156 0.29
157 0.23
158 0.18
159 0.13
160 0.13
161 0.11
162 0.12
163 0.17
164 0.23
165 0.26
166 0.32
167 0.36
168 0.39
169 0.48
170 0.56
171 0.61
172 0.66
173 0.72
174 0.71
175 0.77
176 0.83
177 0.84
178 0.86
179 0.86
180 0.83
181 0.83
182 0.85
183 0.87
184 0.87
185 0.87
186 0.87
187 0.87
188 0.83
189 0.82
190 0.76
191 0.71
192 0.64
193 0.62
194 0.61
195 0.59
196 0.66
197 0.64
198 0.67
199 0.72
200 0.76
201 0.77
202 0.78
203 0.77
204 0.76
205 0.75
206 0.71
207 0.63
208 0.6
209 0.52
210 0.43
211 0.35
212 0.3
213 0.27
214 0.28
215 0.32
216 0.35
217 0.37
218 0.46
219 0.56
220 0.64
221 0.69
222 0.76
223 0.76
224 0.77
225 0.83
226 0.84
227 0.82
228 0.8
229 0.71
230 0.64
231 0.61
232 0.55
233 0.44
234 0.38
235 0.33
236 0.26
237 0.31
238 0.28
239 0.26
240 0.29
241 0.29
242 0.25
243 0.26
244 0.29
245 0.29
246 0.36
247 0.44
248 0.48
249 0.56
250 0.57
251 0.59
252 0.57
253 0.55
254 0.55
255 0.57
256 0.56
257 0.57
258 0.64
259 0.62
260 0.67
261 0.65
262 0.57
263 0.51
264 0.46
265 0.39
266 0.36
267 0.41
268 0.41
269 0.45
270 0.53
271 0.56
272 0.62
273 0.66
274 0.67
275 0.69
276 0.74
277 0.79
278 0.81
279 0.84
280 0.84
281 0.84
282 0.87
283 0.84
284 0.82
285 0.82
286 0.8
287 0.76
288 0.76
289 0.75
290 0.7
291 0.67
292 0.6
293 0.56
294 0.56
295 0.59
296 0.57
297 0.59
298 0.61
299 0.64
300 0.71
301 0.72
302 0.69
303 0.68
304 0.7
305 0.7
306 0.72
307 0.71
308 0.66
309 0.65
310 0.65
311 0.62
312 0.6
313 0.58
314 0.54
315 0.58
316 0.59
317 0.61
318 0.66
319 0.67
320 0.69
321 0.74
322 0.8
323 0.8
324 0.84
325 0.86
326 0.86
327 0.88
328 0.82
329 0.8
330 0.76
331 0.72
332 0.72
333 0.62
334 0.56
335 0.54
336 0.51
337 0.46
338 0.48
339 0.48
340 0.48
341 0.56
342 0.57
343 0.5
344 0.58
345 0.56
346 0.49
347 0.44
348 0.38
349 0.38
350 0.36
351 0.39
352 0.38
353 0.45
354 0.49
355 0.55
356 0.54
357 0.51
358 0.5
359 0.48
360 0.43
361 0.38
362 0.38
363 0.33
364 0.3
365 0.25
366 0.24
367 0.21
368 0.21
369 0.21
370 0.21
371 0.21
372 0.19
373 0.19
374 0.2
375 0.19
376 0.17
377 0.14
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.15
383 0.18
384 0.2
385 0.2
386 0.21
387 0.25
388 0.28
389 0.31
390 0.34
391 0.34
392 0.36
393 0.35
394 0.34
395 0.31
396 0.29
397 0.27
398 0.24
399 0.28
400 0.27
401 0.3
402 0.31
403 0.32
404 0.38
405 0.41
406 0.42
407 0.42
408 0.45
409 0.46
410 0.45
411 0.47
412 0.48
413 0.45
414 0.46
415 0.4
416 0.37
417 0.33
418 0.32
419 0.35
420 0.32
421 0.35
422 0.38
423 0.39