Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JC00

Protein Details
Accession A0A136JC00    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-206VVVVRPTEKREKKKLKRTGDPTRQTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-197KREKKKLKR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences MATTTLTEPRTQRFNSHVAFDNISAGESTEYNPIAFTLNYKHAGYQWRRRHRTFMVGVDDNAYSDHALQWLLNELVDDGDEIVCVRVIETQLRLTNKAYQDDAKSLMEAIQAKNTKNHAISLILEYAVGKLHNTFQHMIKMYQPSMLIVGTKGRSLDGVQGFLVNRSSFSKYCLQYSPIPVVVVRPTEKREKKKLKRTGDPTRQTYINLLGGVKHEADSETSSLYNLEPNITADEEAHRVAVAVGLPAAYDPTIKKLPRDSVPGSSQRRSVGELPKEAPQILAKGGIPAEKPPGEDTESEDEEEEFEVESGEQLLRKEQLKSMEHNEGAALRRHMSTGSTDSDDETAGAGGAKTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.46
4 0.47
5 0.43
6 0.43
7 0.39
8 0.36
9 0.28
10 0.26
11 0.21
12 0.16
13 0.13
14 0.11
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.2
26 0.24
27 0.24
28 0.25
29 0.27
30 0.37
31 0.44
32 0.49
33 0.55
34 0.62
35 0.7
36 0.72
37 0.76
38 0.71
39 0.72
40 0.68
41 0.65
42 0.62
43 0.56
44 0.53
45 0.47
46 0.42
47 0.32
48 0.26
49 0.19
50 0.11
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.08
75 0.1
76 0.12
77 0.16
78 0.2
79 0.22
80 0.24
81 0.24
82 0.29
83 0.3
84 0.31
85 0.29
86 0.28
87 0.29
88 0.29
89 0.3
90 0.24
91 0.21
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.15
97 0.19
98 0.22
99 0.22
100 0.26
101 0.28
102 0.29
103 0.27
104 0.27
105 0.21
106 0.2
107 0.21
108 0.19
109 0.17
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.05
117 0.06
118 0.09
119 0.11
120 0.14
121 0.16
122 0.17
123 0.22
124 0.24
125 0.24
126 0.24
127 0.26
128 0.24
129 0.23
130 0.22
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.11
135 0.07
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.15
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.14
155 0.12
156 0.16
157 0.22
158 0.22
159 0.25
160 0.25
161 0.26
162 0.26
163 0.28
164 0.27
165 0.21
166 0.2
167 0.17
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.16
174 0.26
175 0.33
176 0.4
177 0.49
178 0.59
179 0.67
180 0.76
181 0.82
182 0.81
183 0.84
184 0.85
185 0.86
186 0.85
187 0.83
188 0.77
189 0.7
190 0.62
191 0.53
192 0.45
193 0.36
194 0.27
195 0.2
196 0.15
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.1
240 0.17
241 0.18
242 0.21
243 0.26
244 0.32
245 0.35
246 0.42
247 0.4
248 0.4
249 0.46
250 0.53
251 0.53
252 0.5
253 0.48
254 0.44
255 0.42
256 0.4
257 0.4
258 0.4
259 0.39
260 0.41
261 0.41
262 0.43
263 0.43
264 0.38
265 0.33
266 0.26
267 0.22
268 0.18
269 0.18
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.21
277 0.19
278 0.2
279 0.2
280 0.23
281 0.23
282 0.23
283 0.26
284 0.27
285 0.28
286 0.27
287 0.26
288 0.23
289 0.21
290 0.21
291 0.16
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.12
302 0.16
303 0.19
304 0.21
305 0.24
306 0.31
307 0.34
308 0.39
309 0.43
310 0.47
311 0.45
312 0.43
313 0.4
314 0.35
315 0.34
316 0.34
317 0.29
318 0.23
319 0.23
320 0.24
321 0.23
322 0.21
323 0.23
324 0.22
325 0.24
326 0.25
327 0.25
328 0.26
329 0.26
330 0.25
331 0.2
332 0.16
333 0.12
334 0.09
335 0.09