Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JGC3

Protein Details
Accession A0A136JGC3    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-58PEKPTARTPKATTPRKPRKPNYELLTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-50PKATTPRKPRK
125-170PVKRPRGRPKKVTTEEAASSTSKPKTKARAKSPAKTARAKKGQAKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MPPPPPPPETPVPPEQGGSEPSRASVIPEPPPEKPTARTPKATTPRKPRKPNYELLTDVQLARKIKTFGFKPIKRRSAMISLLDQCWESQQQATTPPSARAFSTSVVAESPKRATPTKTVEPVPPVKRPRGRPKKVTTEEAASSTSKPKTKARAKSPAKTARAKKGQAKKAALIEIPDSDDILDEQLSAGASTPCGASSPEPVFSPTSPASLDLSSADAAEMSLALTPPTDNEEVLFKHVTDIVKATPRSTNPAEPSWHERMLLYDPIVVEDFAAWLNSGELTKVGYDAEVSAADV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.42
3 0.37
4 0.35
5 0.32
6 0.29
7 0.24
8 0.23
9 0.24
10 0.22
11 0.23
12 0.25
13 0.26
14 0.3
15 0.38
16 0.41
17 0.42
18 0.45
19 0.45
20 0.42
21 0.4
22 0.44
23 0.47
24 0.5
25 0.54
26 0.56
27 0.62
28 0.7
29 0.75
30 0.74
31 0.75
32 0.8
33 0.84
34 0.9
35 0.89
36 0.9
37 0.87
38 0.87
39 0.81
40 0.77
41 0.7
42 0.62
43 0.57
44 0.47
45 0.41
46 0.34
47 0.33
48 0.26
49 0.24
50 0.25
51 0.22
52 0.23
53 0.3
54 0.29
55 0.35
56 0.45
57 0.49
58 0.56
59 0.65
60 0.7
61 0.64
62 0.64
63 0.58
64 0.55
65 0.54
66 0.47
67 0.42
68 0.38
69 0.36
70 0.35
71 0.3
72 0.22
73 0.2
74 0.18
75 0.13
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.18
80 0.19
81 0.21
82 0.21
83 0.23
84 0.23
85 0.23
86 0.22
87 0.2
88 0.2
89 0.17
90 0.18
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.16
100 0.18
101 0.2
102 0.25
103 0.32
104 0.36
105 0.38
106 0.38
107 0.38
108 0.41
109 0.47
110 0.44
111 0.44
112 0.42
113 0.46
114 0.5
115 0.57
116 0.63
117 0.66
118 0.7
119 0.72
120 0.76
121 0.79
122 0.77
123 0.73
124 0.64
125 0.56
126 0.5
127 0.42
128 0.35
129 0.25
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.22
135 0.24
136 0.33
137 0.41
138 0.48
139 0.53
140 0.61
141 0.65
142 0.68
143 0.74
144 0.73
145 0.7
146 0.7
147 0.67
148 0.66
149 0.67
150 0.65
151 0.64
152 0.65
153 0.66
154 0.66
155 0.63
156 0.57
157 0.52
158 0.5
159 0.41
160 0.33
161 0.26
162 0.19
163 0.18
164 0.14
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.21
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.15
199 0.15
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.14
221 0.14
222 0.18
223 0.18
224 0.14
225 0.15
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.24
232 0.25
233 0.25
234 0.27
235 0.29
236 0.35
237 0.37
238 0.4
239 0.38
240 0.42
241 0.44
242 0.43
243 0.49
244 0.48
245 0.45
246 0.38
247 0.34
248 0.32
249 0.33
250 0.32
251 0.25
252 0.21
253 0.19
254 0.21
255 0.22
256 0.18
257 0.14
258 0.1
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.09