Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A136JJM8

Protein Details
Accession A0A136JJM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
444-472VRSWKANRRGNYHRKRRRWARVRHIVDTTHydrophilic
607-627EGKVEARGKARSKKRKVGEESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
448-464KANRRGNYHRKRRRWAR
606-623AEGKVEARGKARSKKRKV
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 12, cyto 6.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSLVQPNSWVAIKLPTGALRILQATPNTTISLGKYGTFPSNLIIQRPFHLTYELEDRREDESFNRLRIVPASELYQDVLTSGDSANATEAQSTPLPDGDDDAAASGTGSAEPSGVEFSLVDPESGAVVAKTNRVDIDAAVAATQTLTMEEIEALKKHGTNAGQDLIAKLMLSHTAIDQKTEYSLAKYKLLKTKKYIRRFSVLPLDVPLLNHWLLEEKDPSKILDMREEMIGLLGCWANIHFGGEESCEGQEIVVGDDGQAAPAKSLEDASGRWLAIDDTGGLLVAAMAERMGVLFSPAATHGPQPTTEKKDSKPKTSEGDKELDQNTAPAESTSATTEQPAQTQAADEQQQAATKPATQQQKRPHNDLQIPFSQTNTLTVIHTNSQPNLSYLRYFDYDAANPPAAHVHPLARHLLTLTWLQLLDPAADTTYSAELASSTPEEVRSWKANRRGNYHRKRRRWARVRHIVDTTRQGGFSGLVVASTMDPISIMRHAVPLLAGGAPVAIYSQSVEPLSALMDCYSIARRAAWVQSPPAELEGVTDADELEAWQGNDEFPLNPTLLLGASLQTSRVRKWQVLPNRTHPLMTSRGGAEGYVFTAFRVKPAEGKVEARGKARSKKRKVGEES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.21
4 0.22
5 0.22
6 0.22
7 0.19
8 0.21
9 0.2
10 0.22
11 0.21
12 0.22
13 0.24
14 0.25
15 0.24
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.23
20 0.2
21 0.18
22 0.18
23 0.21
24 0.24
25 0.23
26 0.22
27 0.19
28 0.26
29 0.27
30 0.29
31 0.3
32 0.28
33 0.3
34 0.35
35 0.35
36 0.28
37 0.29
38 0.26
39 0.25
40 0.34
41 0.36
42 0.32
43 0.31
44 0.32
45 0.33
46 0.33
47 0.3
48 0.22
49 0.27
50 0.3
51 0.31
52 0.32
53 0.29
54 0.3
55 0.32
56 0.34
57 0.27
58 0.24
59 0.25
60 0.23
61 0.23
62 0.23
63 0.2
64 0.15
65 0.12
66 0.11
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.13
85 0.16
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.05
115 0.07
116 0.09
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.15
122 0.15
123 0.12
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.07
139 0.09
140 0.09
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.16
146 0.16
147 0.18
148 0.21
149 0.21
150 0.21
151 0.2
152 0.2
153 0.16
154 0.15
155 0.11
156 0.08
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.19
172 0.2
173 0.26
174 0.29
175 0.34
176 0.41
177 0.47
178 0.49
179 0.51
180 0.59
181 0.63
182 0.7
183 0.73
184 0.69
185 0.68
186 0.64
187 0.63
188 0.62
189 0.53
190 0.44
191 0.37
192 0.33
193 0.28
194 0.27
195 0.21
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.16
204 0.14
205 0.16
206 0.17
207 0.17
208 0.18
209 0.2
210 0.19
211 0.2
212 0.21
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.16
217 0.14
218 0.13
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.09
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.02
278 0.02
279 0.02
280 0.02
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.14
293 0.19
294 0.25
295 0.29
296 0.32
297 0.34
298 0.44
299 0.47
300 0.5
301 0.49
302 0.47
303 0.48
304 0.51
305 0.52
306 0.45
307 0.44
308 0.37
309 0.37
310 0.34
311 0.28
312 0.22
313 0.17
314 0.14
315 0.11
316 0.1
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.1
342 0.1
343 0.12
344 0.17
345 0.26
346 0.27
347 0.34
348 0.43
349 0.53
350 0.56
351 0.61
352 0.6
353 0.58
354 0.63
355 0.59
356 0.54
357 0.47
358 0.47
359 0.41
360 0.36
361 0.3
362 0.23
363 0.21
364 0.18
365 0.14
366 0.1
367 0.11
368 0.13
369 0.13
370 0.17
371 0.17
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.14
379 0.13
380 0.15
381 0.15
382 0.16
383 0.16
384 0.17
385 0.17
386 0.19
387 0.21
388 0.19
389 0.17
390 0.17
391 0.17
392 0.15
393 0.15
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.16
398 0.18
399 0.16
400 0.16
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.12
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.09
429 0.09
430 0.11
431 0.15
432 0.21
433 0.25
434 0.32
435 0.4
436 0.45
437 0.5
438 0.56
439 0.63
440 0.68
441 0.74
442 0.78
443 0.8
444 0.84
445 0.89
446 0.91
447 0.92
448 0.91
449 0.91
450 0.91
451 0.91
452 0.88
453 0.82
454 0.79
455 0.7
456 0.64
457 0.6
458 0.52
459 0.42
460 0.35
461 0.3
462 0.24
463 0.21
464 0.16
465 0.12
466 0.09
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.03
494 0.03
495 0.05
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.08
509 0.1
510 0.11
511 0.12
512 0.12
513 0.13
514 0.17
515 0.21
516 0.24
517 0.25
518 0.27
519 0.3
520 0.31
521 0.3
522 0.28
523 0.24
524 0.19
525 0.17
526 0.15
527 0.12
528 0.11
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.07
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.11
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.1
549 0.09
550 0.1
551 0.09
552 0.07
553 0.09
554 0.09
555 0.11
556 0.16
557 0.18
558 0.2
559 0.28
560 0.32
561 0.35
562 0.42
563 0.5
564 0.56
565 0.62
566 0.68
567 0.69
568 0.73
569 0.7
570 0.63
571 0.55
572 0.5
573 0.46
574 0.4
575 0.35
576 0.27
577 0.27
578 0.27
579 0.25
580 0.21
581 0.15
582 0.15
583 0.13
584 0.12
585 0.1
586 0.17
587 0.16
588 0.18
589 0.21
590 0.21
591 0.25
592 0.29
593 0.36
594 0.34
595 0.37
596 0.42
597 0.47
598 0.5
599 0.48
600 0.52
601 0.53
602 0.59
603 0.67
604 0.7
605 0.72
606 0.78
607 0.84