FuNGI

G0WDB5

Protein Details

Accession

G0WDB5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
57-87	ELYKPTKISSWKQRLRAKKVQQKEKSSSKDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-99	KQRLRAKKVQQKEKSSSKDEIPRVRREPMERK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	ndi:NDAI_0F04580 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MDLLGDIVEKNISSDEESLGTNHNNDHDDDLLNFEIKEHKDLDDIYPENSAKNGFPELYKPTKISSWKQRLRAKKVQQKEKSSSKDEIPRVRREPMERKKENVMSEAQSIHMENLNRIKDMTDEQFLNEKRELLESLNPKLIKNLLSKINKRLDNDTNNSTALFPEVEGASGTWVGGINENVVPTTNDINKLPSLLDDEQVKKVLNIQDLSLNDSDGNEPQKEVRFEGENNKTIDHDDEANVSVYDDYDDVDDVAPLDYQMAQTIDHMSNEELMKDVHFITHNHNHSQNDEEMEGEEDVDVNLDINDPDFDSKLHEKYFPDLPKDIDKLKWFQQVPNLPENGNENGIIIEDVSQCRFDFNGNLIPPTRKIDNTTHSALHHHATDPQLAGYTIPELQHLSISNFPSQRCISIQILGRILYKLGKQTYYQLIPEVDVETYQEDGNIDNVMKRIYSMFWDLCKTCNVIESLEIAANESFTKNLSVRNYAIDALWLWRKGGGDFRISEEKRGKTDSN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.15
4	0.15
5	0.16
6	0.19
7	0.19
8	0.18
9	0.19
10	0.21
11	0.21
12	0.22
13	0.24
14	0.22
15	0.21
16	0.2
17	0.22
18	0.2
19	0.19
20	0.18
21	0.16
22	0.21
23	0.21
24	0.24
25	0.21
26	0.21
27	0.23
28	0.25
29	0.27
30	0.29
31	0.28
32	0.26
33	0.29
34	0.29
35	0.26
36	0.26
37	0.24
38	0.17
39	0.19
40	0.2
41	0.16
42	0.18
43	0.21
44	0.28
45	0.33
46	0.35
47	0.33
48	0.33
49	0.38
50	0.44
51	0.49
52	0.53
53	0.57
54	0.62
55	0.71
56	0.77
57	0.81
58	0.84
59	0.85
60	0.85
61	0.84
62	0.86
63	0.87
64	0.88
65	0.87
66	0.86
67	0.86
68	0.82
69	0.78
70	0.72
71	0.69
72	0.69
73	0.67
74	0.69
75	0.65
76	0.67
77	0.66
78	0.67
79	0.65
80	0.65
81	0.68
82	0.68
83	0.72
84	0.67
85	0.67
86	0.7
87	0.7
88	0.64
89	0.56
90	0.5
91	0.42
92	0.41
93	0.37
94	0.29
95	0.24
96	0.22
97	0.2
98	0.18
99	0.16
100	0.17
101	0.23
102	0.23
103	0.22
104	0.22
105	0.21
106	0.2
107	0.24
108	0.24
109	0.21
110	0.2
111	0.21
112	0.28
113	0.29
114	0.31
115	0.28
116	0.25
117	0.22
118	0.23
119	0.23
120	0.18
121	0.24
122	0.23
123	0.26
124	0.3
125	0.3
126	0.28
127	0.29
128	0.29
129	0.27
130	0.26
131	0.29
132	0.32
133	0.4
134	0.45
135	0.51
136	0.57
137	0.56
138	0.55
139	0.56
140	0.56
141	0.55
142	0.56
143	0.51
144	0.45
145	0.42
146	0.39
147	0.33
148	0.24
149	0.17
150	0.12
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.06
164	0.06
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.12
173	0.12
174	0.14
175	0.14
176	0.16
177	0.16
178	0.16
179	0.14
180	0.11
181	0.15
182	0.14
183	0.16
184	0.18
185	0.2
186	0.21
187	0.22
188	0.21
189	0.16
190	0.2
191	0.21
192	0.21
193	0.19
194	0.18
195	0.21
196	0.21
197	0.24
198	0.19
199	0.16
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.11
204	0.13
205	0.1
206	0.1
207	0.12
208	0.16
209	0.16
210	0.16
211	0.16
212	0.16
213	0.18
214	0.26
215	0.3
216	0.31
217	0.3
218	0.3
219	0.28
220	0.26
221	0.26
222	0.18
223	0.14
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.09
255	0.08
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.06
265	0.08
266	0.09
267	0.15
268	0.23
269	0.25
270	0.27
271	0.3
272	0.3
273	0.29
274	0.31
275	0.26
276	0.2
277	0.18
278	0.15
279	0.12
280	0.13
281	0.11
282	0.08
283	0.07
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.03
289	0.03
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.1
299	0.13
300	0.15
301	0.17
302	0.19
303	0.19
304	0.22
305	0.3
306	0.29
307	0.3
308	0.29
309	0.3
310	0.32
311	0.34
312	0.33
313	0.29
314	0.29
315	0.29
316	0.33
317	0.38
318	0.34
319	0.34
320	0.4
321	0.43
322	0.44
323	0.46
324	0.42
325	0.34
326	0.34
327	0.35
328	0.28
329	0.22
330	0.18
331	0.12
332	0.11
333	0.11
334	0.1
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.11
344	0.1
345	0.1
346	0.12
347	0.19
348	0.19
349	0.21
350	0.22
351	0.24
352	0.25
353	0.27
354	0.26
355	0.21
356	0.25
357	0.3
358	0.33
359	0.37
360	0.38
361	0.36
362	0.34
363	0.35
364	0.32
365	0.28
366	0.24
367	0.19
368	0.19
369	0.19
370	0.2
371	0.18
372	0.17
373	0.15
374	0.14
375	0.13
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.14
386	0.17
387	0.19
388	0.23
389	0.25
390	0.25
391	0.28
392	0.28
393	0.28
394	0.25
395	0.28
396	0.25
397	0.27
398	0.32
399	0.3
400	0.31
401	0.3
402	0.29
403	0.25
404	0.24
405	0.21
406	0.19
407	0.21
408	0.22
409	0.23
410	0.23
411	0.29
412	0.35
413	0.36
414	0.35
415	0.32
416	0.29
417	0.28
418	0.28
419	0.23
420	0.16
421	0.12
422	0.13
423	0.11
424	0.11
425	0.1
426	0.09
427	0.08
428	0.09
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.11
439	0.15
440	0.19
441	0.21
442	0.24
443	0.29
444	0.29
445	0.3
446	0.31
447	0.29
448	0.24
449	0.25
450	0.23
451	0.19
452	0.19
453	0.19
454	0.19
455	0.19
456	0.18
457	0.16
458	0.14
459	0.14
460	0.14
461	0.12
462	0.1
463	0.1
464	0.13
465	0.13
466	0.19
467	0.23
468	0.27
469	0.28
470	0.31
471	0.33
472	0.3
473	0.29
474	0.25
475	0.21
476	0.21
477	0.25
478	0.22
479	0.2
480	0.21
481	0.22
482	0.23
483	0.3
484	0.29
485	0.29
486	0.3
487	0.36
488	0.44
489	0.45
490	0.51
491	0.5
492	0.51
493	0.5

G0WDB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer