Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E5A782

Protein Details
Accession E5A782    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-50SSEARDPDRRRDDRDRHGDRYBasic
59-87HRESNGGRRRSRDRDHRRRDGSRPRSSKGBasic
95-114RDRPRRSSSRDRFRGGRRDRBasic
121-143YSGGGRARSRSPRRDRADDRFTRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-158RDRHGDRYDRDRSRDRHRESNGGRRRSRDRDHRRRDGSRPRSSKGGADTDEDRDRPRRSSSRDRFRGGRRDRGGGGDYYSGGGRARSRSPRRDRADDRFTRNRSPVSQRDRRRNGA
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 9, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990446  F:U1 snRNP binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12283  RRM1_RBM39_like  
cd12284  RRM2_RBM23_RBM39  
Amino Acid Sequences MATVDAVDALLEEARLESEVQMRDAESKASSEARDPDRRRDDRDRHGDRYDRDRSRDRHRESNGGRRRSRDRDHRRRDGSRPRSSKGGADTDEDRDRPRRSSSRDRFRGGRRDRGGGGDYYSGGGRARSRSPRRDRADDRFTRNRSPVSQRDRRRNGADDRRLSRKTPEPEVTEDDRDKRTIFVQQISQRAETRHLRSFFETVGPVVEAQIVKDRVTGRSKGVGYVEFKEEESVPKALELTGQKLKGVPIIAQLTEAEKNRAARPSEGGAAPGANGAPFHRLYVGNIHFSVTEKDLQEIFEPYGELEQVILQRDELNPGRSKGYGFVQFVDPTHAKDALAEMNGFELAGRQIRVGLGNDKFTPESTANLLRTFTQQAQSYQGSAFSGAGGRGAYAGGSGGIFDRTHSKDDRGVSGASALDDTDVAGVNFKTYDRSKLMDALARRDGPEVAKHGAQPVVSKPRVPVVDRMASKCIKIENAFDADQYFARSFRTALQADDSSREQAAFGPNWIKGLETEVKAECDKKYGRVVHIAVDPNTDGDIYVKFDSVTGGEKALQGLNGRNFNHRVIRASYVVDKIYNSLWGAAASRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.08
4 0.09
5 0.15
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.19
10 0.21
11 0.21
12 0.22
13 0.17
14 0.16
15 0.18
16 0.21
17 0.21
18 0.23
19 0.3
20 0.36
21 0.45
22 0.48
23 0.56
24 0.63
25 0.67
26 0.71
27 0.74
28 0.75
29 0.76
30 0.83
31 0.81
32 0.76
33 0.79
34 0.78
35 0.73
36 0.73
37 0.73
38 0.69
39 0.68
40 0.71
41 0.7
42 0.73
43 0.78
44 0.75
45 0.75
46 0.73
47 0.77
48 0.75
49 0.79
50 0.77
51 0.77
52 0.74
53 0.72
54 0.75
55 0.74
56 0.77
57 0.77
58 0.79
59 0.8
60 0.86
61 0.9
62 0.9
63 0.89
64 0.89
65 0.89
66 0.88
67 0.87
68 0.84
69 0.77
70 0.74
71 0.68
72 0.63
73 0.58
74 0.55
75 0.46
76 0.43
77 0.42
78 0.41
79 0.44
80 0.4
81 0.38
82 0.37
83 0.38
84 0.38
85 0.44
86 0.46
87 0.5
88 0.61
89 0.67
90 0.72
91 0.77
92 0.79
93 0.79
94 0.79
95 0.81
96 0.77
97 0.77
98 0.69
99 0.66
100 0.62
101 0.58
102 0.52
103 0.42
104 0.37
105 0.28
106 0.24
107 0.19
108 0.18
109 0.14
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.15
114 0.22
115 0.32
116 0.41
117 0.51
118 0.61
119 0.69
120 0.74
121 0.8
122 0.81
123 0.8
124 0.82
125 0.8
126 0.79
127 0.78
128 0.75
129 0.72
130 0.68
131 0.62
132 0.58
133 0.59
134 0.59
135 0.6
136 0.65
137 0.67
138 0.74
139 0.78
140 0.78
141 0.75
142 0.73
143 0.73
144 0.74
145 0.75
146 0.72
147 0.7
148 0.71
149 0.68
150 0.62
151 0.58
152 0.56
153 0.52
154 0.52
155 0.52
156 0.48
157 0.5
158 0.55
159 0.53
160 0.49
161 0.47
162 0.43
163 0.39
164 0.36
165 0.32
166 0.27
167 0.24
168 0.25
169 0.25
170 0.24
171 0.3
172 0.33
173 0.39
174 0.41
175 0.41
176 0.37
177 0.35
178 0.38
179 0.38
180 0.38
181 0.39
182 0.39
183 0.39
184 0.39
185 0.4
186 0.34
187 0.3
188 0.25
189 0.17
190 0.16
191 0.13
192 0.11
193 0.09
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.13
198 0.14
199 0.13
200 0.16
201 0.18
202 0.2
203 0.25
204 0.26
205 0.22
206 0.28
207 0.28
208 0.27
209 0.27
210 0.26
211 0.24
212 0.25
213 0.25
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.16
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.13
226 0.12
227 0.15
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.2
233 0.18
234 0.17
235 0.12
236 0.12
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.16
243 0.16
244 0.13
245 0.14
246 0.16
247 0.18
248 0.22
249 0.21
250 0.19
251 0.21
252 0.22
253 0.22
254 0.2
255 0.18
256 0.14
257 0.12
258 0.11
259 0.09
260 0.07
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.17
271 0.18
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.11
279 0.13
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.13
302 0.13
303 0.16
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.18
308 0.18
309 0.16
310 0.18
311 0.2
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.2
316 0.2
317 0.23
318 0.19
319 0.15
320 0.16
321 0.15
322 0.13
323 0.13
324 0.14
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.09
341 0.1
342 0.14
343 0.14
344 0.16
345 0.17
346 0.18
347 0.18
348 0.17
349 0.19
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.19
354 0.19
355 0.19
356 0.2
357 0.17
358 0.19
359 0.2
360 0.19
361 0.19
362 0.2
363 0.2
364 0.24
365 0.24
366 0.23
367 0.2
368 0.18
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.12
391 0.14
392 0.17
393 0.19
394 0.21
395 0.25
396 0.27
397 0.29
398 0.26
399 0.24
400 0.21
401 0.2
402 0.19
403 0.14
404 0.12
405 0.09
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.11
418 0.13
419 0.18
420 0.19
421 0.22
422 0.23
423 0.27
424 0.29
425 0.28
426 0.29
427 0.29
428 0.32
429 0.31
430 0.3
431 0.27
432 0.26
433 0.23
434 0.25
435 0.24
436 0.21
437 0.22
438 0.22
439 0.23
440 0.23
441 0.22
442 0.2
443 0.23
444 0.3
445 0.3
446 0.3
447 0.29
448 0.34
449 0.37
450 0.37
451 0.37
452 0.34
453 0.41
454 0.44
455 0.46
456 0.45
457 0.42
458 0.4
459 0.36
460 0.32
461 0.28
462 0.27
463 0.27
464 0.25
465 0.29
466 0.29
467 0.27
468 0.25
469 0.22
470 0.2
471 0.2
472 0.16
473 0.12
474 0.14
475 0.14
476 0.14
477 0.17
478 0.24
479 0.21
480 0.22
481 0.27
482 0.28
483 0.28
484 0.31
485 0.29
486 0.24
487 0.23
488 0.22
489 0.17
490 0.17
491 0.21
492 0.18
493 0.2
494 0.21
495 0.21
496 0.23
497 0.22
498 0.2
499 0.15
500 0.2
501 0.23
502 0.21
503 0.24
504 0.24
505 0.27
506 0.29
507 0.31
508 0.26
509 0.27
510 0.28
511 0.29
512 0.37
513 0.4
514 0.41
515 0.47
516 0.47
517 0.45
518 0.49
519 0.5
520 0.42
521 0.38
522 0.35
523 0.27
524 0.26
525 0.21
526 0.15
527 0.11
528 0.11
529 0.13
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.14
535 0.13
536 0.16
537 0.13
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.17
542 0.17
543 0.18
544 0.17
545 0.23
546 0.28
547 0.33
548 0.35
549 0.39
550 0.41
551 0.44
552 0.5
553 0.46
554 0.44
555 0.41
556 0.45
557 0.41
558 0.42
559 0.41
560 0.37
561 0.36
562 0.33
563 0.29
564 0.26
565 0.25
566 0.24
567 0.2
568 0.17
569 0.16
570 0.15