Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E5ABM7

Protein Details
Accession E5ABM7    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
445-469LGNHHVQGKRRVKKGKQLSPMEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-353GRKKKRK
455-457RVK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRRKFIDKKTATNFRLVHRAQNDPRIHDEDAPQMVFAETSAPNQREDSEAAGSSRASQYSAATGRSKIKSRRELESEYGAQVRKNEGEAANYGVYYDDTEYDYMQHMRDLGTGGGEAYFVEAPSEKKKGKNKVDLADMLRDTSLQDRQSNADLSVSSNISSVSDLFGEDMAPSEFVRKTTYQDQQNVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDEDDIFAELAADGYEVDQREWGYDGFEGEDQRDTMDRFLDDDDAGWESDDTVKASSPNPKKPTPAQPTDPSFLPAPDEAPAPAQAGDLAYLDEFKKFKNDVKAAKAPRPTAPSDMQSSIMTGASALTAGGRKKKRKGAMTSTSGYSMSSSALHRTEGLTLLDQRFDKIEEEYADNGDFDFPDDSSMISGMSKMSGLSKMSGMTGMSQWSSSEAPPLRSDFDSIMDDFLGNHHVQGKRRVKKGKQLSPMEQLDEVRNGLGPARVSARTKAQQAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.63
3 0.66
4 0.57
5 0.56
6 0.5
7 0.58
8 0.56
9 0.62
10 0.62
11 0.56
12 0.61
13 0.57
14 0.55
15 0.49
16 0.46
17 0.43
18 0.43
19 0.38
20 0.31
21 0.27
22 0.24
23 0.2
24 0.17
25 0.14
26 0.1
27 0.15
28 0.22
29 0.23
30 0.24
31 0.25
32 0.26
33 0.25
34 0.26
35 0.25
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.2
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.2
48 0.22
49 0.23
50 0.23
51 0.27
52 0.33
53 0.38
54 0.46
55 0.48
56 0.55
57 0.61
58 0.63
59 0.68
60 0.67
61 0.68
62 0.64
63 0.63
64 0.55
65 0.48
66 0.48
67 0.4
68 0.35
69 0.31
70 0.3
71 0.23
72 0.23
73 0.24
74 0.21
75 0.23
76 0.23
77 0.24
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.14
82 0.13
83 0.11
84 0.11
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.1
111 0.14
112 0.21
113 0.22
114 0.29
115 0.38
116 0.48
117 0.56
118 0.64
119 0.67
120 0.66
121 0.7
122 0.68
123 0.62
124 0.58
125 0.48
126 0.39
127 0.31
128 0.26
129 0.2
130 0.18
131 0.19
132 0.17
133 0.18
134 0.19
135 0.21
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.18
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.14
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.13
165 0.13
166 0.17
167 0.24
168 0.32
169 0.35
170 0.41
171 0.43
172 0.44
173 0.48
174 0.44
175 0.37
176 0.3
177 0.24
178 0.19
179 0.16
180 0.12
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.1
259 0.19
260 0.24
261 0.32
262 0.37
263 0.39
264 0.43
265 0.48
266 0.56
267 0.56
268 0.55
269 0.53
270 0.54
271 0.56
272 0.55
273 0.49
274 0.4
275 0.32
276 0.26
277 0.22
278 0.16
279 0.12
280 0.1
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.13
300 0.15
301 0.2
302 0.28
303 0.34
304 0.38
305 0.46
306 0.54
307 0.54
308 0.59
309 0.59
310 0.52
311 0.5
312 0.49
313 0.43
314 0.4
315 0.38
316 0.35
317 0.34
318 0.33
319 0.3
320 0.25
321 0.23
322 0.19
323 0.16
324 0.12
325 0.08
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.07
332 0.09
333 0.18
334 0.26
335 0.33
336 0.41
337 0.49
338 0.57
339 0.63
340 0.7
341 0.72
342 0.73
343 0.72
344 0.68
345 0.61
346 0.54
347 0.45
348 0.36
349 0.27
350 0.18
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.18
364 0.18
365 0.21
366 0.2
367 0.2
368 0.19
369 0.19
370 0.18
371 0.15
372 0.18
373 0.17
374 0.19
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.18
379 0.16
380 0.13
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.08
398 0.1
399 0.12
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.13
413 0.15
414 0.13
415 0.2
416 0.21
417 0.24
418 0.27
419 0.29
420 0.3
421 0.29
422 0.32
423 0.24
424 0.25
425 0.25
426 0.23
427 0.21
428 0.17
429 0.16
430 0.14
431 0.14
432 0.14
433 0.11
434 0.12
435 0.17
436 0.22
437 0.26
438 0.37
439 0.47
440 0.51
441 0.61
442 0.7
443 0.72
444 0.78
445 0.85
446 0.84
447 0.84
448 0.84
449 0.82
450 0.81
451 0.77
452 0.69
453 0.61
454 0.53
455 0.47
456 0.4
457 0.33
458 0.24
459 0.21
460 0.18
461 0.17
462 0.18
463 0.15
464 0.15
465 0.19
466 0.23
467 0.26
468 0.29
469 0.37
470 0.4