Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4ZLM6

Protein Details
Accession E4ZLM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-299ETFAKWKKERLDKKQAEEEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-33KGEQPKVKKIAVDKTFGMKNKKGGAAQK
45-64GGSPEEKRKAAEKAQREKEK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.499, nucl 10, cyto 9.5, cyto_mito 7.666, mito_nucl 7.499, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0002181  P:cytoplasmic translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKGKGEQPKVKKIAVDKTFGMKNKKGGAAQKQIAQIKATAASGGSPEEKRKAAEKAQREKEKLAAEQARKEVADLFKPVQIQKVPFGVDPKTVLCQFFKKGNCEKGKKCKFSHDPAVERKTEKRSLYTDSRDQEKEAEEEKKKKDNMDDWDEEKLRQVVLSKHGNPKTTTDKVCKYFIQAIEDQKYGWFWVCPNGGDKCMYKHSLPPGLVTVPVVHIWIARLHYVLIAGHRYVIKTKEQRAAEKALMANSPLATLTLEDFLESERHKLTGTLTPVTEETFAKWKKERLDKKQAEEEAKKMKEATGRAMFEKGDWQQDSDADSDEEDDSWNLETMRKETEAARARKEEERLAASLGNATVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.61
4 0.57
5 0.49
6 0.5
7 0.54
8 0.56
9 0.57
10 0.51
11 0.52
12 0.54
13 0.56
14 0.55
15 0.57
16 0.6
17 0.62
18 0.61
19 0.6
20 0.61
21 0.6
22 0.56
23 0.49
24 0.4
25 0.32
26 0.3
27 0.25
28 0.17
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.15
34 0.16
35 0.2
36 0.24
37 0.25
38 0.27
39 0.31
40 0.35
41 0.4
42 0.46
43 0.53
44 0.59
45 0.68
46 0.75
47 0.74
48 0.7
49 0.67
50 0.63
51 0.55
52 0.54
53 0.52
54 0.47
55 0.49
56 0.49
57 0.45
58 0.4
59 0.38
60 0.34
61 0.29
62 0.28
63 0.26
64 0.25
65 0.25
66 0.28
67 0.28
68 0.28
69 0.28
70 0.27
71 0.26
72 0.28
73 0.27
74 0.26
75 0.29
76 0.25
77 0.23
78 0.23
79 0.21
80 0.22
81 0.22
82 0.22
83 0.21
84 0.23
85 0.25
86 0.3
87 0.32
88 0.36
89 0.42
90 0.5
91 0.57
92 0.61
93 0.67
94 0.71
95 0.78
96 0.78
97 0.73
98 0.74
99 0.73
100 0.72
101 0.74
102 0.71
103 0.69
104 0.69
105 0.72
106 0.64
107 0.59
108 0.57
109 0.53
110 0.51
111 0.45
112 0.41
113 0.38
114 0.42
115 0.47
116 0.47
117 0.47
118 0.44
119 0.48
120 0.45
121 0.42
122 0.38
123 0.32
124 0.28
125 0.26
126 0.3
127 0.3
128 0.37
129 0.4
130 0.45
131 0.45
132 0.45
133 0.47
134 0.45
135 0.47
136 0.47
137 0.47
138 0.42
139 0.45
140 0.43
141 0.38
142 0.33
143 0.26
144 0.18
145 0.15
146 0.16
147 0.13
148 0.18
149 0.24
150 0.27
151 0.35
152 0.38
153 0.4
154 0.38
155 0.4
156 0.42
157 0.41
158 0.4
159 0.37
160 0.41
161 0.41
162 0.43
163 0.39
164 0.35
165 0.34
166 0.32
167 0.3
168 0.27
169 0.28
170 0.28
171 0.28
172 0.24
173 0.19
174 0.18
175 0.14
176 0.12
177 0.08
178 0.06
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.18
186 0.18
187 0.16
188 0.19
189 0.21
190 0.19
191 0.21
192 0.25
193 0.28
194 0.28
195 0.26
196 0.24
197 0.22
198 0.22
199 0.18
200 0.14
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.15
223 0.21
224 0.26
225 0.32
226 0.38
227 0.4
228 0.44
229 0.46
230 0.49
231 0.41
232 0.38
233 0.34
234 0.28
235 0.26
236 0.22
237 0.19
238 0.13
239 0.13
240 0.09
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.18
259 0.22
260 0.22
261 0.21
262 0.22
263 0.23
264 0.23
265 0.22
266 0.16
267 0.15
268 0.21
269 0.23
270 0.26
271 0.3
272 0.34
273 0.41
274 0.51
275 0.6
276 0.61
277 0.7
278 0.73
279 0.77
280 0.81
281 0.78
282 0.77
283 0.7
284 0.67
285 0.65
286 0.59
287 0.53
288 0.45
289 0.41
290 0.38
291 0.36
292 0.38
293 0.36
294 0.38
295 0.38
296 0.4
297 0.36
298 0.31
299 0.36
300 0.3
301 0.29
302 0.27
303 0.27
304 0.27
305 0.28
306 0.29
307 0.23
308 0.22
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.1
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.21
324 0.21
325 0.21
326 0.22
327 0.31
328 0.38
329 0.41
330 0.46
331 0.46
332 0.49
333 0.54
334 0.57
335 0.53
336 0.49
337 0.48
338 0.43
339 0.41
340 0.38
341 0.32
342 0.3