Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LSH1

Protein Details
Accession A0A135LSH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-273DENSVPLRRTRRKGKASGTGHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-267RTRRKGK
Subcellular Location(s) mito 8, cyto 7, nucl 5, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR005225  Small_GTP-bd_dom  
IPR001806  Small_GTPase  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00071  Ras  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51419  RAB  
CDD cd00154  Rab  
Amino Acid Sequences MYNTPISTGFPSLLLTYSGRVLSSQTIGVEFASRIVKLGTGSRRRRIKLQLWDTAGTERFRSVSRSYYRGAAGAILIYDVASYASFASLPTFLMDARALASPNLSVILAGNKADLTSDAQSDFEDNSRPPPTPSSTSSRQSSIPWDMNGSIRSTSMMGTGTRLTATRASEGREVSSEETSHWAAKSNIPVAVEISALTGDGVEEVFNRLARIILTKIELGEIDPDDPQSGIQYGDGGLYGSDASSIRSRATLDENSVPLRRTRRKGKASGTGHSWKSGMREWEDVFRLGSGTHPNQGCC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.13
4 0.15
5 0.15
6 0.14
7 0.13
8 0.14
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.2
26 0.27
27 0.35
28 0.43
29 0.51
30 0.6
31 0.62
32 0.68
33 0.7
34 0.7
35 0.71
36 0.71
37 0.7
38 0.66
39 0.65
40 0.59
41 0.54
42 0.48
43 0.38
44 0.31
45 0.23
46 0.2
47 0.19
48 0.22
49 0.2
50 0.25
51 0.29
52 0.31
53 0.32
54 0.34
55 0.34
56 0.3
57 0.28
58 0.2
59 0.15
60 0.12
61 0.1
62 0.06
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.03
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.12
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.17
118 0.2
119 0.22
120 0.26
121 0.29
122 0.33
123 0.37
124 0.37
125 0.36
126 0.33
127 0.3
128 0.3
129 0.29
130 0.26
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.17
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.17
157 0.18
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.13
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.15
172 0.18
173 0.17
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.15
178 0.15
179 0.12
180 0.09
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.15
237 0.21
238 0.21
239 0.24
240 0.27
241 0.29
242 0.31
243 0.33
244 0.32
245 0.31
246 0.39
247 0.43
248 0.48
249 0.57
250 0.64
251 0.71
252 0.79
253 0.82
254 0.83
255 0.79
256 0.76
257 0.73
258 0.71
259 0.63
260 0.56
261 0.48
262 0.39
263 0.38
264 0.38
265 0.36
266 0.32
267 0.36
268 0.36
269 0.43
270 0.44
271 0.4
272 0.35
273 0.29
274 0.26
275 0.2
276 0.21
277 0.22
278 0.23
279 0.29