Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LDY3

Protein Details
Accession A0A135LDY3    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-110ASTKCREDVTKPKKRSNKKDPTSDTSNPIALSKPRRKAKKAADAPETHydrophilic
124-146KDDAVKPAKGRSRKNAKSKDSGNHydrophilic
306-326MASGKPKKTSKGKPKKFTTLTHydrophilic
347-371CLPDIRTTKGRRRKTKETEKEPSFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-82PKKRSNKK
95-104SKPRRKAKKA
129-145KPAKGRSRKNAKSKDSG
151-169GKVTKPSGDPAKKSSKGGK
310-321KPKKTSKGKPKK
357-360RRRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MAGIADVIIISSSPNPPRSPGPARHDSKQVSHLLPRGETPPQIHPAADLSKPHTRSRFFPTPTASTKCREDVTKPKKRSNKKDPTSDTSNPIALSKPRRKAKKAADAPETIALRDPQPETVGTKDDAVKPAKGRSRKNAKSKDSGNMTLAGKVTKPSGDPAKKSSKGGKAVATKLSPSEDMPEKSAPKESHALGGNEVLHLDEAMRRRMDWTPPRETAYQEIATVNDGGSQDKDCYPDLTGGFGKLLSDYNYSGSAFNPRDLVQNANGGGPTKRRRIELVNPEIQELLNGRYSDSSDQTSAQGENMASGKPKKTSKGKPKKFTTLTARMTAQYSTIDPEEDEPVIDCLPDIRTTKGRRRKTKETEKEPSFTVLSPEAAVEFLNDQDLVFGTCSQLETDDSPQMLRETQQAIRVSEGLSYPEAPDKNAKAIQESSTRSVSRLAGTRNMWCVGARDTEGSLIQPETLNVVDLTGGGESPAKKSHDNPERASYNPLQEDWYDLEFADIDSPQEQRPSSLSLTQKGLDSDTQAQLLAQTPAPTVTAMPKVKPTAAKHVKGTDYNPTEAASSQSTASQAPSMPQYTGFTDAELSKQVSAYGFKAVRGRKKMIDLLEQCWNSKHGSNATSHSQPVCHPEQQKEPTSKMDNVPNPTSDAKAKTTVKSKSATSIKNRKLLDATKSTSASQPDLQASPKKNLKGRPIIGTSASFIDVEEIQDSEEEIFPSPSQVQKHYTDIFSKPKADSRVQNHSLDILTKTPSPSPNKRNVVSAKVPVKRPSSSASLTGTHTTESSKEISLADISAQITQAVRIQPRLSPLSSSRGSRSRPTWHEKILMYDPIILEDFTAWLNIEGLGLVGEDREVGTASVREWCESKGICCCWKNNASW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.28
4 0.33
5 0.41
6 0.47
7 0.51
8 0.55
9 0.61
10 0.66
11 0.67
12 0.72
13 0.67
14 0.64
15 0.62
16 0.6
17 0.54
18 0.54
19 0.54
20 0.49
21 0.45
22 0.43
23 0.4
24 0.37
25 0.36
26 0.34
27 0.36
28 0.37
29 0.37
30 0.34
31 0.31
32 0.33
33 0.33
34 0.32
35 0.29
36 0.3
37 0.37
38 0.4
39 0.46
40 0.49
41 0.48
42 0.5
43 0.56
44 0.6
45 0.56
46 0.59
47 0.59
48 0.59
49 0.62
50 0.64
51 0.57
52 0.52
53 0.53
54 0.5
55 0.48
56 0.44
57 0.45
58 0.5
59 0.58
60 0.63
61 0.66
62 0.72
63 0.78
64 0.85
65 0.88
66 0.88
67 0.89
68 0.87
69 0.91
70 0.89
71 0.87
72 0.85
73 0.79
74 0.73
75 0.65
76 0.58
77 0.47
78 0.4
79 0.36
80 0.34
81 0.4
82 0.44
83 0.5
84 0.57
85 0.66
86 0.71
87 0.77
88 0.81
89 0.82
90 0.82
91 0.81
92 0.79
93 0.72
94 0.69
95 0.66
96 0.56
97 0.45
98 0.37
99 0.3
100 0.24
101 0.25
102 0.23
103 0.18
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.22
108 0.24
109 0.2
110 0.22
111 0.25
112 0.27
113 0.32
114 0.32
115 0.34
116 0.33
117 0.41
118 0.46
119 0.5
120 0.54
121 0.59
122 0.67
123 0.72
124 0.8
125 0.82
126 0.81
127 0.82
128 0.8
129 0.78
130 0.74
131 0.68
132 0.59
133 0.54
134 0.47
135 0.41
136 0.36
137 0.28
138 0.22
139 0.19
140 0.19
141 0.15
142 0.15
143 0.18
144 0.28
145 0.34
146 0.37
147 0.43
148 0.52
149 0.53
150 0.57
151 0.6
152 0.57
153 0.57
154 0.57
155 0.58
156 0.55
157 0.56
158 0.57
159 0.5
160 0.42
161 0.37
162 0.36
163 0.3
164 0.23
165 0.24
166 0.25
167 0.25
168 0.27
169 0.31
170 0.3
171 0.31
172 0.37
173 0.32
174 0.3
175 0.33
176 0.31
177 0.32
178 0.34
179 0.33
180 0.27
181 0.29
182 0.25
183 0.2
184 0.2
185 0.14
186 0.1
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.19
195 0.23
196 0.32
197 0.38
198 0.42
199 0.45
200 0.48
201 0.52
202 0.5
203 0.48
204 0.43
205 0.4
206 0.34
207 0.28
208 0.25
209 0.21
210 0.21
211 0.19
212 0.14
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.16
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.18
225 0.17
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.1
233 0.11
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.18
247 0.21
248 0.22
249 0.24
250 0.18
251 0.21
252 0.2
253 0.19
254 0.19
255 0.16
256 0.16
257 0.21
258 0.25
259 0.29
260 0.31
261 0.32
262 0.35
263 0.41
264 0.49
265 0.52
266 0.55
267 0.54
268 0.52
269 0.51
270 0.48
271 0.4
272 0.31
273 0.22
274 0.16
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.12
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.14
296 0.16
297 0.19
298 0.22
299 0.28
300 0.37
301 0.47
302 0.56
303 0.65
304 0.74
305 0.78
306 0.83
307 0.86
308 0.8
309 0.77
310 0.75
311 0.73
312 0.67
313 0.6
314 0.54
315 0.45
316 0.42
317 0.34
318 0.26
319 0.17
320 0.14
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.06
334 0.05
335 0.07
336 0.1
337 0.11
338 0.13
339 0.2
340 0.26
341 0.36
342 0.45
343 0.54
344 0.61
345 0.68
346 0.76
347 0.8
348 0.86
349 0.87
350 0.86
351 0.87
352 0.8
353 0.73
354 0.64
355 0.55
356 0.45
357 0.35
358 0.27
359 0.18
360 0.14
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.1
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.19
396 0.2
397 0.2
398 0.2
399 0.2
400 0.17
401 0.15
402 0.14
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.14
411 0.14
412 0.17
413 0.18
414 0.18
415 0.17
416 0.18
417 0.2
418 0.22
419 0.24
420 0.23
421 0.24
422 0.24
423 0.22
424 0.23
425 0.21
426 0.17
427 0.19
428 0.17
429 0.19
430 0.2
431 0.21
432 0.21
433 0.21
434 0.19
435 0.16
436 0.16
437 0.13
438 0.13
439 0.11
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.08
445 0.08
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.04
459 0.03
460 0.03
461 0.05
462 0.05
463 0.07
464 0.1
465 0.12
466 0.13
467 0.16
468 0.26
469 0.33
470 0.38
471 0.4
472 0.43
473 0.44
474 0.44
475 0.46
476 0.38
477 0.33
478 0.28
479 0.26
480 0.21
481 0.18
482 0.19
483 0.17
484 0.15
485 0.12
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.07
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.14
501 0.15
502 0.19
503 0.21
504 0.22
505 0.24
506 0.24
507 0.23
508 0.2
509 0.2
510 0.15
511 0.16
512 0.16
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.12
518 0.13
519 0.11
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.09
528 0.16
529 0.16
530 0.17
531 0.2
532 0.21
533 0.23
534 0.29
535 0.29
536 0.33
537 0.4
538 0.42
539 0.43
540 0.46
541 0.47
542 0.43
543 0.43
544 0.4
545 0.35
546 0.33
547 0.3
548 0.26
549 0.24
550 0.21
551 0.21
552 0.13
553 0.11
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.12
563 0.12
564 0.11
565 0.12
566 0.13
567 0.13
568 0.18
569 0.16
570 0.14
571 0.14
572 0.15
573 0.15
574 0.15
575 0.14
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.11
582 0.15
583 0.15
584 0.17
585 0.23
586 0.28
587 0.35
588 0.39
589 0.43
590 0.4
591 0.44
592 0.47
593 0.45
594 0.49
595 0.44
596 0.41
597 0.45
598 0.43
599 0.38
600 0.34
601 0.32
602 0.24
603 0.23
604 0.24
605 0.2
606 0.21
607 0.23
608 0.26
609 0.3
610 0.3
611 0.3
612 0.27
613 0.24
614 0.23
615 0.26
616 0.27
617 0.29
618 0.31
619 0.33
620 0.42
621 0.47
622 0.52
623 0.51
624 0.48
625 0.48
626 0.49
627 0.49
628 0.44
629 0.47
630 0.45
631 0.47
632 0.47
633 0.41
634 0.4
635 0.37
636 0.35
637 0.3
638 0.28
639 0.25
640 0.3
641 0.32
642 0.34
643 0.41
644 0.43
645 0.43
646 0.43
647 0.41
648 0.43
649 0.47
650 0.5
651 0.52
652 0.58
653 0.6
654 0.65
655 0.64
656 0.58
657 0.56
658 0.53
659 0.5
660 0.47
661 0.44
662 0.42
663 0.43
664 0.41
665 0.39
666 0.36
667 0.32
668 0.27
669 0.27
670 0.25
671 0.25
672 0.28
673 0.31
674 0.32
675 0.37
676 0.41
677 0.43
678 0.46
679 0.52
680 0.57
681 0.6
682 0.61
683 0.6
684 0.58
685 0.54
686 0.51
687 0.45
688 0.37
689 0.28
690 0.25
691 0.17
692 0.14
693 0.13
694 0.11
695 0.11
696 0.1
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.09
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.11
706 0.1
707 0.13
708 0.14
709 0.17
710 0.19
711 0.22
712 0.26
713 0.28
714 0.34
715 0.34
716 0.35
717 0.36
718 0.39
719 0.44
720 0.43
721 0.43
722 0.4
723 0.43
724 0.46
725 0.47
726 0.5
727 0.5
728 0.56
729 0.58
730 0.57
731 0.51
732 0.47
733 0.42
734 0.36
735 0.3
736 0.21
737 0.19
738 0.19
739 0.21
740 0.23
741 0.3
742 0.36
743 0.44
744 0.51
745 0.59
746 0.64
747 0.64
748 0.68
749 0.66
750 0.65
751 0.61
752 0.62
753 0.61
754 0.59
755 0.63
756 0.62
757 0.61
758 0.55
759 0.52
760 0.48
761 0.45
762 0.42
763 0.4
764 0.37
765 0.35
766 0.35
767 0.35
768 0.31
769 0.25
770 0.23
771 0.21
772 0.18
773 0.18
774 0.18
775 0.16
776 0.16
777 0.16
778 0.16
779 0.16
780 0.15
781 0.13
782 0.13
783 0.13
784 0.12
785 0.12
786 0.12
787 0.11
788 0.11
789 0.15
790 0.17
791 0.19
792 0.23
793 0.24
794 0.25
795 0.31
796 0.35
797 0.32
798 0.32
799 0.33
800 0.37
801 0.39
802 0.41
803 0.41
804 0.44
805 0.47
806 0.49
807 0.53
808 0.55
809 0.6
810 0.66
811 0.66
812 0.65
813 0.68
814 0.62
815 0.62
816 0.57
817 0.52
818 0.45
819 0.4
820 0.34
821 0.3
822 0.29
823 0.22
824 0.17
825 0.13
826 0.12
827 0.09
828 0.1
829 0.08
830 0.07
831 0.08
832 0.08
833 0.07
834 0.06
835 0.06
836 0.06
837 0.05
838 0.05
839 0.04
840 0.04
841 0.04
842 0.05
843 0.05
844 0.06
845 0.06
846 0.08
847 0.09
848 0.1
849 0.17
850 0.18
851 0.19
852 0.2
853 0.21
854 0.26
855 0.27
856 0.3
857 0.31
858 0.36
859 0.44
860 0.47
861 0.49
862 0.51