Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LJT5

Protein Details
Accession A0A135LJT5    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-65TDKLESAKNGKKRKRGAAVQQDEEDHydrophilic
134-174PVQPTSTTDSKKKKKKSKKEEAPTLSKKEQKRARRLFPEPLHydrophilic
634-659LPNLSKNSKKDMKRHGVKARQAPRLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-55KNGKKRKR
144-168KKKKKKSKKEEAPTLSKKEQKRARR
642-658KKDMKRHGVKARQAPRL
665-672GKGARGMR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDAFRLLTRSTKLKPASSASDSRLPSTGKAANPQLFRTAETDKLESAKNGKKRKRGAAVQQDEEDIPDLDFFSSNKRPATSVTETAAATEEEEKVSAQDAASDDDDSMDEVQRRTILNSHKIKVTDMRDLENIPVQPTSTTDSKKKKKKSKKEEAPTLSKKEQKRARRLFPEPLLNFKELRSKYKISSRLAENVADQGFTVPTEVQLGTLPLLLRESSEPDLLVVAPTGSGKTLSFLIPVINKIVRHHHSNPDEHGILSVVVAPTRELASQIVNEGRKLVAGTGVKITLMRKGMRVGDHGDANVLEENSEESSGSEDEDAESKPAKERADIPVTKSDILVTTPLMLVNALSANRTTTMATLPLVRSLVMDEADVLLDPLFREQTLDIWKSCSHPDLRVGLWSATMGSNIEDLTKSTIKERLEELGKKPSETHPLLRLVVGLKDSAIPNIDHKLVYAATEQGKLMGLRQLLRPAAASPSDIRLRPPFLIFTQTIPRAVALHSELKYDIPAEAGGSSRIAVLHSDLSDGQRSDIMRDFRKGEIWILVTTDLLARGVDFRGINGVVNYDIPNSAAVYVHRVGRTGRAGREGGIAVTYYTKEDIPYVKSIANIIDVSEKLRGGEQGDKSIQKWLLDALPNLSKNSKKDMKRHGVKARQAPRLTDKEDDGKGARGMRISTKSGFERRLENNKRGAIEASRNRKAAAAASGNVSDTGSWGGLDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.54
4 0.53
5 0.55
6 0.52
7 0.55
8 0.51
9 0.48
10 0.46
11 0.4
12 0.35
13 0.36
14 0.37
15 0.32
16 0.38
17 0.44
18 0.46
19 0.47
20 0.48
21 0.47
22 0.43
23 0.41
24 0.39
25 0.35
26 0.34
27 0.35
28 0.35
29 0.31
30 0.33
31 0.33
32 0.31
33 0.36
34 0.38
35 0.43
36 0.51
37 0.58
38 0.65
39 0.72
40 0.79
41 0.81
42 0.82
43 0.84
44 0.85
45 0.85
46 0.81
47 0.73
48 0.66
49 0.55
50 0.47
51 0.37
52 0.27
53 0.18
54 0.13
55 0.12
56 0.1
57 0.11
58 0.1
59 0.16
60 0.22
61 0.25
62 0.27
63 0.28
64 0.28
65 0.31
66 0.39
67 0.38
68 0.36
69 0.34
70 0.35
71 0.33
72 0.33
73 0.31
74 0.22
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.09
85 0.11
86 0.11
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.14
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.24
103 0.28
104 0.35
105 0.43
106 0.44
107 0.47
108 0.47
109 0.48
110 0.49
111 0.46
112 0.45
113 0.39
114 0.4
115 0.37
116 0.38
117 0.37
118 0.33
119 0.29
120 0.22
121 0.2
122 0.17
123 0.15
124 0.16
125 0.19
126 0.2
127 0.24
128 0.32
129 0.42
130 0.52
131 0.61
132 0.7
133 0.77
134 0.82
135 0.89
136 0.91
137 0.92
138 0.93
139 0.95
140 0.95
141 0.93
142 0.92
143 0.88
144 0.85
145 0.8
146 0.76
147 0.69
148 0.68
149 0.69
150 0.68
151 0.72
152 0.73
153 0.77
154 0.79
155 0.81
156 0.8
157 0.77
158 0.77
159 0.68
160 0.66
161 0.59
162 0.52
163 0.46
164 0.38
165 0.41
166 0.33
167 0.38
168 0.36
169 0.36
170 0.4
171 0.48
172 0.54
173 0.49
174 0.54
175 0.51
176 0.52
177 0.5
178 0.46
179 0.38
180 0.34
181 0.3
182 0.23
183 0.19
184 0.13
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.06
189 0.06
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.16
231 0.24
232 0.25
233 0.31
234 0.35
235 0.41
236 0.44
237 0.47
238 0.48
239 0.45
240 0.43
241 0.35
242 0.31
243 0.22
244 0.17
245 0.14
246 0.12
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.11
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.17
280 0.2
281 0.2
282 0.22
283 0.21
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.17
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.21
316 0.29
317 0.29
318 0.3
319 0.32
320 0.33
321 0.32
322 0.29
323 0.24
324 0.16
325 0.15
326 0.13
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.08
371 0.12
372 0.14
373 0.14
374 0.16
375 0.17
376 0.18
377 0.19
378 0.19
379 0.16
380 0.16
381 0.19
382 0.2
383 0.19
384 0.19
385 0.2
386 0.16
387 0.15
388 0.13
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.17
404 0.17
405 0.18
406 0.19
407 0.2
408 0.25
409 0.28
410 0.29
411 0.34
412 0.34
413 0.32
414 0.33
415 0.32
416 0.34
417 0.33
418 0.34
419 0.29
420 0.32
421 0.32
422 0.3
423 0.28
424 0.21
425 0.19
426 0.16
427 0.11
428 0.08
429 0.09
430 0.1
431 0.09
432 0.1
433 0.09
434 0.1
435 0.13
436 0.13
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.12
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.17
456 0.16
457 0.17
458 0.16
459 0.14
460 0.15
461 0.14
462 0.14
463 0.11
464 0.16
465 0.19
466 0.19
467 0.21
468 0.22
469 0.24
470 0.24
471 0.24
472 0.22
473 0.2
474 0.25
475 0.22
476 0.22
477 0.26
478 0.25
479 0.25
480 0.23
481 0.22
482 0.18
483 0.17
484 0.16
485 0.13
486 0.18
487 0.17
488 0.18
489 0.18
490 0.18
491 0.18
492 0.16
493 0.13
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.09
508 0.09
509 0.1
510 0.1
511 0.12
512 0.14
513 0.14
514 0.13
515 0.14
516 0.14
517 0.16
518 0.21
519 0.24
520 0.25
521 0.28
522 0.3
523 0.29
524 0.31
525 0.3
526 0.26
527 0.24
528 0.23
529 0.2
530 0.18
531 0.17
532 0.14
533 0.13
534 0.12
535 0.09
536 0.07
537 0.06
538 0.05
539 0.07
540 0.07
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.11
548 0.12
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.12
561 0.14
562 0.18
563 0.18
564 0.18
565 0.19
566 0.23
567 0.31
568 0.31
569 0.32
570 0.33
571 0.33
572 0.33
573 0.35
574 0.3
575 0.23
576 0.18
577 0.15
578 0.11
579 0.12
580 0.11
581 0.09
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.13
586 0.16
587 0.18
588 0.2
589 0.22
590 0.21
591 0.22
592 0.22
593 0.21
594 0.2
595 0.16
596 0.14
597 0.16
598 0.15
599 0.16
600 0.17
601 0.16
602 0.14
603 0.15
604 0.15
605 0.15
606 0.23
607 0.23
608 0.28
609 0.32
610 0.34
611 0.33
612 0.39
613 0.38
614 0.31
615 0.29
616 0.25
617 0.26
618 0.28
619 0.28
620 0.26
621 0.31
622 0.32
623 0.34
624 0.36
625 0.35
626 0.34
627 0.43
628 0.47
629 0.48
630 0.56
631 0.65
632 0.71
633 0.76
634 0.83
635 0.84
636 0.85
637 0.86
638 0.87
639 0.85
640 0.84
641 0.77
642 0.73
643 0.71
644 0.69
645 0.65
646 0.58
647 0.53
648 0.51
649 0.5
650 0.48
651 0.41
652 0.37
653 0.36
654 0.35
655 0.33
656 0.28
657 0.29
658 0.32
659 0.35
660 0.36
661 0.35
662 0.37
663 0.43
664 0.48
665 0.51
666 0.46
667 0.49
668 0.54
669 0.62
670 0.64
671 0.64
672 0.65
673 0.64
674 0.63
675 0.57
676 0.52
677 0.48
678 0.5
679 0.53
680 0.55
681 0.56
682 0.55
683 0.54
684 0.52
685 0.47
686 0.41
687 0.39
688 0.34
689 0.29
690 0.31
691 0.31
692 0.3
693 0.29
694 0.25
695 0.16
696 0.13
697 0.13
698 0.1