Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LHX6

Protein Details
Accession A0A135LHX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-380EEAPKPAPVRRSKRGAKGNKAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-378KPAPVRRSKRGAKGNKA
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8, cyto 4.5, plas 4, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040115  Lnp  
IPR019273  Lunapark_dom  
Gene Ontology GO:0098826  C:endoplasmic reticulum tubular network membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0071788  P:endoplasmic reticulum tubular network maintenance  
GO:1903373  P:positive regulation of endoplasmic reticulum tubular network organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF10058  zinc_ribbon_10  
Amino Acid Sequences MVSFWPWKGDDNSAASFEKTLSTLSTKIAQATARLDQQRQSSRRIKALWTLYSTFAYLFYSIVLALILGWESWGVKEYAAIVGGPVLIYGVRTLSSRIFDYRISRIQRRLDDFHKQREETIEKLKVATKYNSTQQLLEKYGGESPKPSPAKGQDETRQPAQQQQHVARTGLPPPPTANIRRPSAPQTQNDPPFPSSPSPPLELPQAPQTPQQPSFPPSLPPQTSTDQPGFAPNAFTQNGQYIEQPHWYDRLLDVLLGEDETQPRNRMVMMCTACRLVNGQAPPGIKTPEELGRWRCCSCGAWNGVESETTKILSSLRQDAVPGEGAWEPVSKAETDTQSSESMEEGVIVASSEEEQMEEAPKPAPVRRSKRGAKGNKAEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.31
3 0.29
4 0.24
5 0.2
6 0.16
7 0.14
8 0.13
9 0.16
10 0.16
11 0.18
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.26
16 0.24
17 0.24
18 0.27
19 0.29
20 0.31
21 0.35
22 0.35
23 0.37
24 0.45
25 0.52
26 0.5
27 0.55
28 0.56
29 0.58
30 0.63
31 0.61
32 0.56
33 0.55
34 0.59
35 0.55
36 0.52
37 0.49
38 0.44
39 0.42
40 0.38
41 0.3
42 0.23
43 0.19
44 0.13
45 0.11
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.03
56 0.03
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.09
82 0.12
83 0.14
84 0.15
85 0.17
86 0.19
87 0.23
88 0.27
89 0.33
90 0.37
91 0.41
92 0.45
93 0.5
94 0.54
95 0.56
96 0.56
97 0.54
98 0.59
99 0.6
100 0.63
101 0.63
102 0.56
103 0.52
104 0.53
105 0.51
106 0.44
107 0.46
108 0.4
109 0.34
110 0.35
111 0.38
112 0.34
113 0.35
114 0.34
115 0.31
116 0.3
117 0.36
118 0.42
119 0.39
120 0.37
121 0.36
122 0.38
123 0.35
124 0.32
125 0.27
126 0.21
127 0.23
128 0.22
129 0.19
130 0.16
131 0.15
132 0.23
133 0.24
134 0.23
135 0.24
136 0.29
137 0.36
138 0.37
139 0.42
140 0.39
141 0.45
142 0.49
143 0.48
144 0.44
145 0.37
146 0.41
147 0.38
148 0.36
149 0.35
150 0.35
151 0.37
152 0.36
153 0.36
154 0.31
155 0.29
156 0.28
157 0.26
158 0.23
159 0.18
160 0.18
161 0.2
162 0.22
163 0.25
164 0.28
165 0.28
166 0.3
167 0.31
168 0.33
169 0.36
170 0.41
171 0.43
172 0.38
173 0.4
174 0.46
175 0.48
176 0.47
177 0.44
178 0.36
179 0.32
180 0.31
181 0.26
182 0.21
183 0.21
184 0.21
185 0.21
186 0.2
187 0.2
188 0.21
189 0.2
190 0.19
191 0.22
192 0.21
193 0.2
194 0.23
195 0.25
196 0.26
197 0.27
198 0.28
199 0.24
200 0.25
201 0.28
202 0.25
203 0.25
204 0.24
205 0.29
206 0.28
207 0.28
208 0.29
209 0.28
210 0.29
211 0.3
212 0.27
213 0.21
214 0.2
215 0.21
216 0.18
217 0.16
218 0.16
219 0.13
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.14
224 0.15
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.15
229 0.16
230 0.2
231 0.2
232 0.18
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.17
238 0.13
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.12
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.21
256 0.23
257 0.23
258 0.24
259 0.24
260 0.23
261 0.22
262 0.22
263 0.15
264 0.18
265 0.17
266 0.18
267 0.2
268 0.21
269 0.23
270 0.23
271 0.23
272 0.17
273 0.17
274 0.19
275 0.22
276 0.24
277 0.28
278 0.32
279 0.37
280 0.41
281 0.41
282 0.38
283 0.34
284 0.33
285 0.32
286 0.34
287 0.31
288 0.29
289 0.3
290 0.3
291 0.29
292 0.27
293 0.24
294 0.19
295 0.16
296 0.14
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.18
302 0.21
303 0.22
304 0.22
305 0.22
306 0.22
307 0.24
308 0.22
309 0.18
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.1
319 0.12
320 0.17
321 0.19
322 0.22
323 0.24
324 0.26
325 0.26
326 0.26
327 0.24
328 0.19
329 0.17
330 0.13
331 0.11
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.15
349 0.18
350 0.22
351 0.3
352 0.38
353 0.47
354 0.55
355 0.64
356 0.7
357 0.78
358 0.84
359 0.85
360 0.85