Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LKT0

Protein Details
Accession A0A135LKT0    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-270EKEARAILRKKEKRVRKESAAMEBasic
307-329DSDFEGRQKHRPTRPPPKLEIVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-124SVKTGKPKTKPKAGTR
246-264RAEKEARAILRKKEKRVRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences METESPKPIPAYYCCYLLRSTVRHASLYIGSTPNPIRRLPQHNGVAKGGAKRTARDKLRPWEMTLVVEGFTSRVGALQFEWAWQHPERSRHLESEDDLDPKSRTKANASVKTGKPKTKPKAGTRRSLVAHLEDLLSLLRSTYFSSWPLRVRFFCADVYRAWRAWNDRVDGHLPDNIRVILDGDNLATAPDAKKYDELAPVGSINNLSIDYTRIEDYLEKSIFMLEDPEDLQCTWVAMMRELSLRNRAEKEARAILRKKEKRVRKESAAMETSSGPRSSSIEPRSVPEESSQDDLGPNWFEEVDIESDSDFEGRQKHRPTRPPPKLEIVIEDSDWDDAELIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.35
4 0.36
5 0.38
6 0.34
7 0.39
8 0.41
9 0.42
10 0.41
11 0.41
12 0.38
13 0.34
14 0.33
15 0.3
16 0.24
17 0.22
18 0.26
19 0.3
20 0.32
21 0.32
22 0.3
23 0.33
24 0.39
25 0.47
26 0.48
27 0.53
28 0.56
29 0.6
30 0.62
31 0.58
32 0.53
33 0.48
34 0.47
35 0.4
36 0.38
37 0.34
38 0.33
39 0.39
40 0.45
41 0.49
42 0.52
43 0.58
44 0.61
45 0.69
46 0.68
47 0.64
48 0.61
49 0.55
50 0.48
51 0.41
52 0.32
53 0.22
54 0.2
55 0.16
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.14
68 0.13
69 0.17
70 0.17
71 0.23
72 0.24
73 0.29
74 0.34
75 0.4
76 0.42
77 0.41
78 0.42
79 0.39
80 0.36
81 0.35
82 0.31
83 0.25
84 0.23
85 0.22
86 0.21
87 0.19
88 0.21
89 0.19
90 0.19
91 0.22
92 0.31
93 0.39
94 0.47
95 0.51
96 0.57
97 0.58
98 0.67
99 0.68
100 0.65
101 0.63
102 0.65
103 0.66
104 0.67
105 0.72
106 0.72
107 0.78
108 0.77
109 0.78
110 0.72
111 0.71
112 0.63
113 0.57
114 0.49
115 0.39
116 0.34
117 0.25
118 0.21
119 0.14
120 0.13
121 0.09
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.14
132 0.17
133 0.22
134 0.24
135 0.26
136 0.25
137 0.29
138 0.28
139 0.27
140 0.27
141 0.24
142 0.23
143 0.2
144 0.25
145 0.22
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.21
150 0.25
151 0.27
152 0.24
153 0.22
154 0.24
155 0.25
156 0.24
157 0.21
158 0.19
159 0.16
160 0.14
161 0.15
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.12
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.12
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.12
203 0.17
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.13
227 0.14
228 0.16
229 0.21
230 0.22
231 0.25
232 0.27
233 0.3
234 0.32
235 0.33
236 0.36
237 0.38
238 0.4
239 0.44
240 0.46
241 0.51
242 0.58
243 0.62
244 0.66
245 0.67
246 0.74
247 0.76
248 0.81
249 0.81
250 0.79
251 0.81
252 0.76
253 0.75
254 0.68
255 0.58
256 0.5
257 0.43
258 0.38
259 0.31
260 0.26
261 0.18
262 0.16
263 0.19
264 0.21
265 0.28
266 0.29
267 0.32
268 0.33
269 0.35
270 0.39
271 0.36
272 0.33
273 0.28
274 0.28
275 0.25
276 0.28
277 0.25
278 0.21
279 0.21
280 0.2
281 0.19
282 0.17
283 0.15
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.16
299 0.19
300 0.28
301 0.38
302 0.47
303 0.56
304 0.66
305 0.75
306 0.79
307 0.86
308 0.86
309 0.83
310 0.83
311 0.8
312 0.72
313 0.67
314 0.62
315 0.54
316 0.45
317 0.4
318 0.31
319 0.25
320 0.23
321 0.16