Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LP29

Protein Details
Accession A0A135LP29    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-445RRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRS
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIVSPVIEEQPQVVDGEEIPIDITRPNPNGEEQDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPADEQEMMMEIYKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKENDQKKEELHKMLAKQQATKTGDQLIREEVVQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPGWENLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPNHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSRPRGCRLCGQNGHKAEECLGRPKEKSGEFDEKQHAAPLKPFIWLHVAVLREYLAVELRVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNLPAMGSYLTKDGSVELKNAQIILQGLAKQEDAIFARRRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRSSPQRDLTAGDRSRGEPAPPMELITPGRGHLNKETRELTHSMVINRGAVYRANMENKSAAAVLKSRLMKGNQEEAGDSETPVTDGEDVSSEIPEQTSPGVLGKRKADVVEQEVADAGTPGRDSPPPVPIAAEKPKQDEAQEDTVKLWEPGYADRYYEQKFGVDPKDLEFRHQVAREYAMGLCWVLQYYFQGCPSWTWYYPRHYAPFAADFVDIADMDVKFEKGTIFKPFEQLMGVLPAASNHALPKVFHPLMENPDSEIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVILLPFIDETRLLNAMAKVYPLLTEEEKIRNSHGQDVLLLSDRNPLYQDLVANFYSKKPGPAQYPLKEDVSGGLAGIVERSDTYIPHSSLVSPLEAHGMPGVDDDRSLTVLYKIPKSSHVHKSMLLRGVKLPTPMLDSNDIRATQNRSQNSGRSFGGAPFQGRGRGGRMNYSSDRPNPFAAHLDPKFNSGPQGGPGGAPMVPPGWVPPGQGYGGYARGPPPPPRGGMSHQYPPQHPPQHVYQQPGDYYGQQNNQYNQGGQYNNAHQSGYGSQDYRGGRGGNRGGRGRGGQNRDHYSHNQGGGGYNRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.46
8 0.46
9 0.44
10 0.42
11 0.35
12 0.32
13 0.3
14 0.23
15 0.16
16 0.13
17 0.1
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.13
26 0.17
27 0.19
28 0.22
29 0.24
30 0.28
31 0.33
32 0.34
33 0.36
34 0.32
35 0.35
36 0.33
37 0.33
38 0.29
39 0.24
40 0.22
41 0.18
42 0.15
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.42
55 0.47
56 0.47
57 0.5
58 0.51
59 0.54
60 0.46
61 0.41
62 0.36
63 0.31
64 0.28
65 0.22
66 0.17
67 0.13
68 0.15
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.15
74 0.19
75 0.24
76 0.3
77 0.38
78 0.47
79 0.48
80 0.47
81 0.49
82 0.47
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.71
110 0.72
111 0.69
112 0.66
113 0.71
114 0.68
115 0.6
116 0.55
117 0.49
118 0.42
119 0.46
120 0.48
121 0.44
122 0.46
123 0.5
124 0.49
125 0.55
126 0.58
127 0.5
128 0.5
129 0.48
130 0.51
131 0.49
132 0.47
133 0.42
134 0.44
135 0.44
136 0.39
137 0.38
138 0.31
139 0.28
140 0.26
141 0.28
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.17
147 0.17
148 0.21
149 0.19
150 0.2
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.21
155 0.22
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.2
175 0.27
176 0.26
177 0.29
178 0.29
179 0.3
180 0.34
181 0.31
182 0.28
183 0.22
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.15
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.21
205 0.28
206 0.29
207 0.31
208 0.35
209 0.41
210 0.48
211 0.53
212 0.59
213 0.59
214 0.64
215 0.65
216 0.62
217 0.64
218 0.56
219 0.48
220 0.38
221 0.31
222 0.26
223 0.25
224 0.21
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.19
247 0.18
248 0.2
249 0.2
250 0.18
251 0.21
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.27
256 0.25
257 0.27
258 0.34
259 0.37
260 0.44
261 0.5
262 0.52
263 0.58
264 0.6
265 0.61
266 0.54
267 0.48
268 0.4
269 0.37
270 0.34
271 0.33
272 0.33
273 0.33
274 0.32
275 0.35
276 0.39
277 0.36
278 0.38
279 0.37
280 0.44
281 0.42
282 0.47
283 0.49
284 0.44
285 0.41
286 0.41
287 0.36
288 0.27
289 0.29
290 0.27
291 0.23
292 0.24
293 0.24
294 0.21
295 0.23
296 0.22
297 0.2
298 0.18
299 0.19
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.09
310 0.12
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.2
315 0.21
316 0.22
317 0.25
318 0.24
319 0.2
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.12
346 0.15
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.15
352 0.15
353 0.1
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.13
396 0.17
397 0.17
398 0.24
399 0.25
400 0.28
401 0.32
402 0.41
403 0.45
404 0.52
405 0.58
406 0.57
407 0.64
408 0.68
409 0.72
410 0.72
411 0.69
412 0.68
413 0.69
414 0.69
415 0.66
416 0.68
417 0.66
418 0.66
419 0.68
420 0.61
421 0.55
422 0.51
423 0.55
424 0.53
425 0.52
426 0.51
427 0.5
428 0.53
429 0.6
430 0.69
431 0.72
432 0.75
433 0.77
434 0.79
435 0.75
436 0.71
437 0.63
438 0.56
439 0.54
440 0.45
441 0.36
442 0.28
443 0.24
444 0.26
445 0.25
446 0.22
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.17
451 0.17
452 0.14
453 0.15
454 0.15
455 0.13
456 0.12
457 0.1
458 0.13
459 0.13
460 0.15
461 0.2
462 0.26
463 0.26
464 0.3
465 0.31
466 0.28
467 0.31
468 0.31
469 0.25
470 0.22
471 0.22
472 0.19
473 0.19
474 0.19
475 0.16
476 0.15
477 0.14
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.12
483 0.15
484 0.15
485 0.16
486 0.16
487 0.15
488 0.15
489 0.12
490 0.1
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.16
498 0.17
499 0.2
500 0.22
501 0.27
502 0.23
503 0.23
504 0.22
505 0.2
506 0.22
507 0.18
508 0.15
509 0.09
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.06
530 0.09
531 0.11
532 0.13
533 0.14
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.16
538 0.16
539 0.18
540 0.18
541 0.17
542 0.16
543 0.15
544 0.14
545 0.12
546 0.1
547 0.06
548 0.03
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.06
553 0.08
554 0.1
555 0.13
556 0.14
557 0.14
558 0.15
559 0.14
560 0.2
561 0.25
562 0.27
563 0.25
564 0.28
565 0.3
566 0.3
567 0.3
568 0.26
569 0.25
570 0.28
571 0.28
572 0.25
573 0.23
574 0.23
575 0.22
576 0.2
577 0.15
578 0.08
579 0.08
580 0.1
581 0.13
582 0.12
583 0.13
584 0.14
585 0.18
586 0.19
587 0.19
588 0.17
589 0.15
590 0.15
591 0.19
592 0.2
593 0.19
594 0.18
595 0.18
596 0.26
597 0.25
598 0.27
599 0.26
600 0.25
601 0.28
602 0.29
603 0.29
604 0.22
605 0.24
606 0.22
607 0.2
608 0.18
609 0.12
610 0.11
611 0.09
612 0.08
613 0.06
614 0.06
615 0.04
616 0.05
617 0.05
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.11
624 0.16
625 0.19
626 0.18
627 0.22
628 0.25
629 0.3
630 0.35
631 0.38
632 0.36
633 0.33
634 0.33
635 0.31
636 0.3
637 0.25
638 0.21
639 0.17
640 0.14
641 0.13
642 0.12
643 0.09
644 0.07
645 0.08
646 0.06
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.06
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.1
655 0.16
656 0.2
657 0.2
658 0.24
659 0.24
660 0.24
661 0.22
662 0.2
663 0.15
664 0.12
665 0.12
666 0.08
667 0.08
668 0.07
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.06
673 0.08
674 0.09
675 0.1
676 0.12
677 0.19
678 0.19
679 0.19
680 0.22
681 0.23
682 0.28
683 0.3
684 0.28
685 0.21
686 0.23
687 0.22
688 0.19
689 0.16
690 0.11
691 0.1
692 0.1
693 0.1
694 0.09
695 0.09
696 0.1
697 0.09
698 0.09
699 0.1
700 0.14
701 0.14
702 0.14
703 0.16
704 0.15
705 0.17
706 0.18
707 0.17
708 0.15
709 0.14
710 0.14
711 0.16
712 0.17
713 0.15
714 0.14
715 0.13
716 0.11
717 0.11
718 0.1
719 0.06
720 0.05
721 0.07
722 0.08
723 0.09
724 0.1
725 0.11
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.1
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.11
734 0.1
735 0.12
736 0.15
737 0.2
738 0.22
739 0.22
740 0.24
741 0.25
742 0.26
743 0.31
744 0.3
745 0.25
746 0.24
747 0.24
748 0.23
749 0.21
750 0.19
751 0.13
752 0.17
753 0.17
754 0.16
755 0.17
756 0.16
757 0.16
758 0.17
759 0.19
760 0.14
761 0.17
762 0.17
763 0.18
764 0.18
765 0.16
766 0.2
767 0.19
768 0.21
769 0.22
770 0.27
771 0.31
772 0.4
773 0.48
774 0.48
775 0.53
776 0.53
777 0.5
778 0.45
779 0.4
780 0.31
781 0.24
782 0.18
783 0.12
784 0.09
785 0.08
786 0.07
787 0.08
788 0.06
789 0.04
790 0.04
791 0.06
792 0.06
793 0.06
794 0.12
795 0.17
796 0.18
797 0.19
798 0.19
799 0.18
800 0.2
801 0.22
802 0.17
803 0.12
804 0.12
805 0.15
806 0.14
807 0.13
808 0.12
809 0.11
810 0.1
811 0.11
812 0.11
813 0.07
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.09
818 0.09
819 0.09
820 0.1
821 0.14
822 0.18
823 0.22
824 0.24
825 0.24
826 0.31
827 0.37
828 0.43
829 0.49
830 0.52
831 0.49
832 0.51
833 0.56
834 0.56
835 0.57
836 0.5
837 0.42
838 0.39
839 0.41
840 0.39
841 0.34
842 0.28
843 0.22
844 0.27
845 0.27
846 0.26
847 0.29
848 0.27
849 0.29
850 0.32
851 0.32
852 0.27
853 0.3
854 0.34
855 0.34
856 0.41
857 0.4
858 0.42
859 0.44
860 0.49
861 0.48
862 0.45
863 0.39
864 0.35
865 0.34
866 0.29
867 0.31
868 0.27
869 0.25
870 0.23
871 0.24
872 0.24
873 0.24
874 0.24
875 0.23
876 0.27
877 0.27
878 0.32
879 0.34
880 0.38
881 0.4
882 0.43
883 0.45
884 0.46
885 0.5
886 0.45
887 0.46
888 0.41
889 0.39
890 0.39
891 0.36
892 0.39
893 0.36
894 0.4
895 0.37
896 0.39
897 0.38
898 0.35
899 0.34
900 0.26
901 0.25
902 0.21
903 0.23
904 0.2
905 0.18
906 0.17
907 0.16
908 0.14
909 0.13
910 0.11
911 0.08
912 0.08
913 0.08
914 0.1
915 0.12
916 0.13
917 0.14
918 0.15
919 0.18
920 0.18
921 0.18
922 0.18
923 0.16
924 0.18
925 0.18
926 0.17
927 0.17
928 0.22
929 0.26
930 0.31
931 0.36
932 0.37
933 0.39
934 0.4
935 0.44
936 0.45
937 0.49
938 0.49
939 0.5
940 0.52
941 0.55
942 0.54
943 0.54
944 0.58
945 0.57
946 0.52
947 0.49
948 0.52
949 0.57
950 0.59
951 0.59
952 0.54
953 0.52
954 0.51
955 0.5
956 0.43
957 0.37
958 0.37
959 0.37
960 0.38
961 0.4
962 0.45
963 0.44
964 0.49
965 0.47
966 0.44
967 0.4
968 0.4
969 0.35
970 0.31
971 0.35
972 0.35
973 0.38
974 0.37
975 0.34
976 0.28
977 0.3
978 0.3
979 0.29
980 0.27
981 0.23
982 0.23
983 0.29
984 0.3
985 0.28
986 0.29
987 0.26
988 0.24
989 0.32
990 0.39
991 0.39
992 0.45
993 0.48
994 0.47
995 0.49
996 0.51
997 0.52
998 0.52
999 0.53
1000 0.53
1001 0.58
1002 0.63
1003 0.61
1004 0.63
1005 0.58
1006 0.57
1007 0.57
1008 0.52
1009 0.45
1010 0.38
1011 0.4