FuNGI

A0A135LLC1

Protein Details

Accession

A0A135LLC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
341-360	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
451-474	NTSGQAKRHGAKHKRGKNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
345-350	RRKKRK
457-468	KRHGAKHKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKQWIDKKNASTFQLFHRSQNDPLIHDTSADDRFLYQVGGPAPAPAPAPSSVKTSKKPLPNLSDLQSEYGDSARKNEGEAANYGVYYDDSNYDYMQHLRELGSGTGDAYFVEAKTEKSKGRAGRGMKLEDALRQVSLVDKDTYQSASAGPSLYGSQYGDMRSTASSYVRKPTYQDQQNVPDAIAGFKPDMDPRLREALEALEDEAFVEDGDDDGIFDQLTANAEEIDEGDWEDSLFDDVEDEGWESDATEKAPVQPDSTKAERSFDDDLPEGPAKPPMDPSEMPEPDKPAPDMEPTDQSWMSEFAKFKKDAKAGNAPTPAAPTIAASQTMASTVFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTAGHRLLDDRFDKVEQLYSLDEEDEYDDNMSMISGMTGATGMTGMSTASSQAPSLVDGNGDAVHSRSTFNNVMDDFLSSWDPNTSGQAKRHGAKHKRGKNGNEAIGIRMLDEVRSGLGPARIRGKGKVSGTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.6
3	0.6
4	0.53
5	0.49
6	0.49
7	0.49
8	0.48
9	0.54
10	0.48
11	0.4
12	0.44
13	0.42
14	0.35
15	0.32
16	0.3
17	0.26
18	0.26
19	0.23
20	0.19
21	0.15
22	0.16
23	0.16
24	0.15
25	0.11
26	0.13
27	0.13
28	0.15
29	0.15
30	0.16
31	0.16
32	0.16
33	0.16
34	0.13
35	0.15
36	0.15
37	0.19
38	0.19
39	0.25
40	0.31
41	0.37
42	0.41
43	0.47
44	0.52
45	0.57
46	0.64
47	0.67
48	0.67
49	0.68
50	0.68
51	0.63
52	0.62
53	0.54
54	0.48
55	0.39
56	0.31
57	0.25
58	0.22
59	0.21
60	0.15
61	0.18
62	0.2
63	0.19
64	0.2
65	0.26
66	0.26
67	0.25
68	0.26
69	0.27
70	0.23
71	0.22
72	0.21
73	0.15
74	0.13
75	0.12
76	0.11
77	0.09
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.12
82	0.13
83	0.15
84	0.15
85	0.14
86	0.14
87	0.14
88	0.15
89	0.16
90	0.14
91	0.13
92	0.12
93	0.12
94	0.11
95	0.1
96	0.08
97	0.07
98	0.08
99	0.06
100	0.09
101	0.09
102	0.11
103	0.15
104	0.19
105	0.2
106	0.23
107	0.3
108	0.33
109	0.4
110	0.45
111	0.45
112	0.49
113	0.53
114	0.52
115	0.46
116	0.44
117	0.37
118	0.32
119	0.31
120	0.24
121	0.18
122	0.15
123	0.14
124	0.15
125	0.15
126	0.15
127	0.13
128	0.13
129	0.14
130	0.15
131	0.16
132	0.13
133	0.12
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.08
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.11
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.13
154	0.16
155	0.17
156	0.25
157	0.26
158	0.26
159	0.28
160	0.34
161	0.4
162	0.45
163	0.48
164	0.46
165	0.5
166	0.52
167	0.49
168	0.42
169	0.33
170	0.26
171	0.21
172	0.16
173	0.11
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.16
182	0.22
183	0.22
184	0.21
185	0.2
186	0.18
187	0.17
188	0.16
189	0.14
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.06
195	0.04
196	0.04
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.04
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.08
241	0.11
242	0.12
243	0.13
244	0.14
245	0.16
246	0.21
247	0.23
248	0.24
249	0.21
250	0.23
251	0.21
252	0.25
253	0.26
254	0.22
255	0.22
256	0.19
257	0.19
258	0.2
259	0.2
260	0.16
261	0.13
262	0.15
263	0.14
264	0.13
265	0.15
266	0.14
267	0.19
268	0.19
269	0.22
270	0.28
271	0.29
272	0.31
273	0.3
274	0.32
275	0.28
276	0.29
277	0.26
278	0.18
279	0.17
280	0.17
281	0.19
282	0.17
283	0.19
284	0.18
285	0.21
286	0.2
287	0.18
288	0.17
289	0.17
290	0.16
291	0.17
292	0.17
293	0.17
294	0.23
295	0.25
296	0.27
297	0.32
298	0.35
299	0.34
300	0.39
301	0.45
302	0.43
303	0.47
304	0.46
305	0.39
306	0.35
307	0.34
308	0.28
309	0.19
310	0.15
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.1
328	0.12
329	0.18
330	0.26
331	0.36
332	0.43
333	0.47
334	0.57
335	0.63
336	0.71
337	0.76
338	0.78
339	0.78
340	0.8
341	0.81
342	0.72
343	0.64
344	0.54
345	0.43
346	0.35
347	0.25
348	0.17
349	0.13
350	0.12
351	0.1
352	0.11
353	0.11
354	0.1
355	0.11
356	0.14
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.16
361	0.18
362	0.24
363	0.23
364	0.22
365	0.22
366	0.22
367	0.23
368	0.21
369	0.22
370	0.17
371	0.18
372	0.16
373	0.15
374	0.15
375	0.14
376	0.13
377	0.1
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.03
392	0.04
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.09
407	0.09
408	0.1
409	0.11
410	0.1
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.1
420	0.11
421	0.11
422	0.17
423	0.2
424	0.21
425	0.25
426	0.24
427	0.25
428	0.24
429	0.25
430	0.19
431	0.18
432	0.19
433	0.14
434	0.15
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.19
439	0.22
440	0.25
441	0.3
442	0.38
443	0.43
444	0.48
445	0.55
446	0.6
447	0.65
448	0.7
449	0.76
450	0.76
451	0.81
452	0.84
453	0.84
454	0.84
455	0.83
456	0.78
457	0.74
458	0.66
459	0.58
460	0.52
461	0.44
462	0.34
463	0.27
464	0.21
465	0.14
466	0.14
467	0.12
468	0.1
469	0.11
470	0.11
471	0.12
472	0.17
473	0.2
474	0.23
475	0.3
476	0.34
477	0.37
478	0.41
479	0.44
480	0.46

A0A135LLC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer