Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BTS9

Protein Details
Accession Q6BTS9    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-96KERDIKAEAKRAKKTRQKKDLNEDLESBasic
331-354KPMSAEKKRKLRISKAKAHTKPSIHydrophilic
420-453AGIKGLKSNRDRKIKKPRIRDRSTKFKNERDSMAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-88KAEAKRAKKTRQKK
336-350EKKRKLRISKAKAHT
421-450GIKGLKSNRDRKIKKPRIRDRSTKFKNERD
457-462KNGPKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034777  Nop12_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG dha:DEHA2C16170g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12669  RRM1_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MSTFSSIFGSSGDNANVDKSIDSLFKASKGPVSRQYSDRARTVINIPADAATEESGADQSESIEETEEDKERDIKAEAKRAKKTRQKKDLNEDLESKYYNKLLKEQDEEAPKVEKDEKVESGSGSDSDSDDEEDQSGETKSKRAKTVDLKENELEKAERTVFVGNVNASVVGSKPMYKKFKKLFSQYGKIQSIRFRSISFDDAVPRKVAFAKKKLHSSRDTLNAYVVFAEKEPSLKCVPKLNATEFEHAHLRVDHVAHPAPKDNKRTIFVGNLDFEEKEETLWRYFNSKTDNDVESVRVIRDAKTNVGKGFALVQFKDTLSVNKSLLLNDKPMSAEKKRKLRISKAKAHTKPSILSPNHIDNSKKAYASNKSKMSAKLSDQQRTKLGRAQTVLNKSDRATAGKSRNIIEGQRASKGDSIAGIKGLKSNRDRKIKKPRIRDRSTKFKNERDSMASELKNGPKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.13
6 0.11
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.17
11 0.18
12 0.2
13 0.22
14 0.23
15 0.26
16 0.3
17 0.35
18 0.41
19 0.48
20 0.5
21 0.51
22 0.58
23 0.61
24 0.6
25 0.58
26 0.51
27 0.44
28 0.43
29 0.43
30 0.41
31 0.34
32 0.29
33 0.26
34 0.24
35 0.23
36 0.2
37 0.18
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.14
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.2
58 0.19
59 0.21
60 0.21
61 0.25
62 0.29
63 0.38
64 0.44
65 0.5
66 0.59
67 0.65
68 0.73
69 0.76
70 0.81
71 0.82
72 0.85
73 0.87
74 0.87
75 0.9
76 0.9
77 0.85
78 0.79
79 0.72
80 0.65
81 0.57
82 0.49
83 0.39
84 0.31
85 0.3
86 0.28
87 0.25
88 0.29
89 0.32
90 0.37
91 0.4
92 0.41
93 0.43
94 0.46
95 0.45
96 0.4
97 0.37
98 0.32
99 0.3
100 0.31
101 0.27
102 0.25
103 0.28
104 0.29
105 0.28
106 0.29
107 0.26
108 0.23
109 0.22
110 0.18
111 0.14
112 0.12
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.15
127 0.2
128 0.25
129 0.31
130 0.32
131 0.4
132 0.47
133 0.57
134 0.61
135 0.59
136 0.58
137 0.55
138 0.55
139 0.47
140 0.39
141 0.29
142 0.21
143 0.21
144 0.17
145 0.15
146 0.14
147 0.15
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.1
161 0.13
162 0.21
163 0.3
164 0.32
165 0.41
166 0.47
167 0.56
168 0.6
169 0.64
170 0.67
171 0.66
172 0.71
173 0.67
174 0.69
175 0.63
176 0.57
177 0.52
178 0.47
179 0.43
180 0.39
181 0.35
182 0.27
183 0.26
184 0.27
185 0.27
186 0.23
187 0.19
188 0.2
189 0.21
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.15
194 0.18
195 0.23
196 0.25
197 0.31
198 0.38
199 0.41
200 0.51
201 0.55
202 0.57
203 0.55
204 0.53
205 0.5
206 0.51
207 0.48
208 0.39
209 0.35
210 0.29
211 0.25
212 0.22
213 0.17
214 0.09
215 0.07
216 0.08
217 0.06
218 0.08
219 0.08
220 0.11
221 0.13
222 0.15
223 0.16
224 0.22
225 0.23
226 0.28
227 0.31
228 0.31
229 0.36
230 0.38
231 0.39
232 0.33
233 0.33
234 0.29
235 0.25
236 0.23
237 0.16
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.16
244 0.16
245 0.17
246 0.22
247 0.27
248 0.31
249 0.35
250 0.37
251 0.38
252 0.39
253 0.41
254 0.37
255 0.34
256 0.31
257 0.29
258 0.25
259 0.22
260 0.21
261 0.18
262 0.17
263 0.15
264 0.12
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.15
272 0.15
273 0.19
274 0.22
275 0.21
276 0.24
277 0.27
278 0.28
279 0.26
280 0.26
281 0.23
282 0.19
283 0.19
284 0.16
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.18
289 0.18
290 0.22
291 0.26
292 0.28
293 0.26
294 0.27
295 0.26
296 0.21
297 0.24
298 0.22
299 0.2
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.16
306 0.16
307 0.15
308 0.18
309 0.17
310 0.19
311 0.2
312 0.19
313 0.24
314 0.23
315 0.23
316 0.21
317 0.22
318 0.19
319 0.22
320 0.27
321 0.3
322 0.38
323 0.43
324 0.52
325 0.58
326 0.65
327 0.7
328 0.75
329 0.79
330 0.79
331 0.81
332 0.81
333 0.85
334 0.83
335 0.81
336 0.76
337 0.68
338 0.61
339 0.57
340 0.57
341 0.47
342 0.46
343 0.44
344 0.45
345 0.44
346 0.45
347 0.4
348 0.33
349 0.39
350 0.39
351 0.34
352 0.29
353 0.33
354 0.4
355 0.48
356 0.54
357 0.52
358 0.51
359 0.56
360 0.58
361 0.57
362 0.53
363 0.48
364 0.49
365 0.52
366 0.57
367 0.56
368 0.55
369 0.57
370 0.56
371 0.54
372 0.51
373 0.48
374 0.45
375 0.44
376 0.47
377 0.47
378 0.5
379 0.52
380 0.48
381 0.45
382 0.41
383 0.45
384 0.39
385 0.35
386 0.32
387 0.37
388 0.42
389 0.45
390 0.47
391 0.43
392 0.45
393 0.44
394 0.42
395 0.41
396 0.41
397 0.39
398 0.42
399 0.4
400 0.38
401 0.38
402 0.36
403 0.29
404 0.24
405 0.24
406 0.19
407 0.22
408 0.2
409 0.18
410 0.23
411 0.25
412 0.3
413 0.36
414 0.45
415 0.51
416 0.61
417 0.66
418 0.71
419 0.8
420 0.83
421 0.84
422 0.86
423 0.87
424 0.87
425 0.92
426 0.92
427 0.89
428 0.9
429 0.9
430 0.9
431 0.88
432 0.86
433 0.86
434 0.81
435 0.78
436 0.73
437 0.67
438 0.62
439 0.62
440 0.53
441 0.47
442 0.48