FuNGI

A0A135LCD3

Protein Details

Accession

A0A135LCD3

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
447-467	EEPAAAKKDKKQKKLVEEVED	Acidic
484-503	EDEAPKKKSKSKKTDIEAMA	Hydrophilic
528-573	GNPTSISKKDLKKSKKDAKKATKDEGKKRKRSEDDDEKKKKKSKGE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
489-496	KKKSKSKK
535-573	KKDLKKSKKDAKKATKDEGKKRKRSEDDDEKKKKKSKGE

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito_nucl 10.333, cyto 8.5, cyto_mito 7.166, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045056 Nop56/Nop58 IPR012974 NOP58/56_N IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0030515 F:snoRNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF08156 NOP5NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MTLFILTETSAGYALLKAKDKKLLKRDDIAEEASTAEGVSNLLKLKSFQKFDSAASALEEAASVMEGKVTPALASLLDGIKDEKKVSLAVADTKLGNSISKLPGLDIQLIADSSTNDVFRAIREHLTTLIPGLAPSDMSTMSLGLSHSLARHKLKFSPDKIDTMIVQAISLLDDLDKELNTYAMRVKEWYGWHFPELAKILNDNIAYAKLVLKMGMRSNWESADLAEILPEEIEGAVKAAADRSMGTEISQDDLENIQALAEQVVGFYEYRAQLASYLTSRMNAIAPNLTALVGDLVGARLIAHAGSLTSLSKSPASTIQILGAEKALFRALKTKHDTPKYGLIYHASLIGQATGRNKGKMARILAAKASLGIRVDSLAEWGEDATEEDKAALGNEARFNLERKLAGMEGKPMKPRGVAIAPTGAAEKFDLKEARKYNPDADALASEEPAAAKKDKKQKKLVEEVEDEEMADADSDEAEDSESEDEAPKKKSKSKKTDIEAMAAKAGLSVKRYERKLERGEITFDKDGNPTSISKKDLKKSKKDAKKATKDEGKKRKRSEDDDEKKKKKSKGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.18
3	0.25
4	0.29
5	0.33
6	0.42
7	0.49
8	0.57
9	0.62
10	0.68
11	0.68
12	0.72
13	0.73
14	0.71
15	0.68
16	0.61
17	0.52
18	0.41
19	0.35
20	0.27
21	0.21
22	0.14
23	0.1
24	0.07
25	0.06
26	0.07
27	0.08
28	0.1
29	0.11
30	0.12
31	0.14
32	0.22
33	0.29
34	0.33
35	0.32
36	0.37
37	0.39
38	0.4
39	0.44
40	0.37
41	0.3
42	0.27
43	0.27
44	0.19
45	0.17
46	0.15
47	0.08
48	0.07
49	0.07
50	0.05
51	0.04
52	0.06
53	0.06
54	0.06
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.08
60	0.07
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.12
67	0.14
68	0.16
69	0.16
70	0.15
71	0.15
72	0.16
73	0.16
74	0.16
75	0.16
76	0.2
77	0.21
78	0.21
79	0.2
80	0.2
81	0.21
82	0.18
83	0.16
84	0.13
85	0.17
86	0.17
87	0.18
88	0.18
89	0.18
90	0.21
91	0.23
92	0.23
93	0.17
94	0.16
95	0.15
96	0.14
97	0.14
98	0.1
99	0.08
100	0.08
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.1
105	0.1
106	0.1
107	0.14
108	0.15
109	0.16
110	0.18
111	0.19
112	0.2
113	0.2
114	0.2
115	0.16
116	0.15
117	0.12
118	0.1
119	0.1
120	0.08
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.09
135	0.12
136	0.18
137	0.22
138	0.26
139	0.27
140	0.32
141	0.4
142	0.47
143	0.48
144	0.53
145	0.5
146	0.49
147	0.48
148	0.45
149	0.36
150	0.3
151	0.27
152	0.17
153	0.15
154	0.12
155	0.1
156	0.08
157	0.08
158	0.05
159	0.04
160	0.04
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.09
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.15
174	0.18
175	0.21
176	0.24
177	0.26
178	0.26
179	0.27
180	0.28
181	0.27
182	0.26
183	0.25
184	0.22
185	0.17
186	0.16
187	0.16
188	0.16
189	0.16
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.14
202	0.16
203	0.18
204	0.18
205	0.2
206	0.19
207	0.19
208	0.17
209	0.15
210	0.14
211	0.11
212	0.09
213	0.08
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.09
263	0.07
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.02
290	0.02
291	0.02
292	0.02
293	0.03
294	0.03
295	0.04
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.1
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.12
311	0.1
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.07
316	0.07
317	0.14
318	0.15
319	0.22
320	0.29
321	0.36
322	0.42
323	0.47
324	0.5
325	0.46
326	0.54
327	0.49
328	0.43
329	0.37
330	0.31
331	0.27
332	0.24
333	0.22
334	0.13
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.16
342	0.17
343	0.18
344	0.19
345	0.22
346	0.26
347	0.29
348	0.3
349	0.28
350	0.29
351	0.3
352	0.3
353	0.27
354	0.22
355	0.18
356	0.16
357	0.12
358	0.1
359	0.09
360	0.08
361	0.07
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.09
382	0.11
383	0.11
384	0.13
385	0.14
386	0.16
387	0.17
388	0.18
389	0.16
390	0.15
391	0.17
392	0.16
393	0.18
394	0.17
395	0.23
396	0.27
397	0.3
398	0.33
399	0.32
400	0.32
401	0.3
402	0.3
403	0.28
404	0.26
405	0.25
406	0.22
407	0.23
408	0.22
409	0.22
410	0.22
411	0.16
412	0.12
413	0.11
414	0.12
415	0.09
416	0.14
417	0.18
418	0.19
419	0.27
420	0.3
421	0.36
422	0.4
423	0.42
424	0.41
425	0.42
426	0.41
427	0.34
428	0.32
429	0.27
430	0.23
431	0.2
432	0.17
433	0.12
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.11
438	0.12
439	0.16
440	0.24
441	0.35
442	0.43
443	0.52
444	0.61
445	0.67
446	0.73
447	0.81
448	0.8
449	0.78
450	0.73
451	0.67
452	0.6
453	0.51
454	0.41
455	0.3
456	0.23
457	0.15
458	0.11
459	0.08
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.11
472	0.14
473	0.17
474	0.22
475	0.27
476	0.32
477	0.41
478	0.5
479	0.58
480	0.66
481	0.73
482	0.78
483	0.79
484	0.84
485	0.78
486	0.75
487	0.68
488	0.58
489	0.49
490	0.39
491	0.31
492	0.23
493	0.23
494	0.17
495	0.15
496	0.19
497	0.26
498	0.34
499	0.37
500	0.44
501	0.49
502	0.57
503	0.62
504	0.66
505	0.64
506	0.6
507	0.64
508	0.59
509	0.58
510	0.51
511	0.44
512	0.38
513	0.33
514	0.32
515	0.28
516	0.26
517	0.22
518	0.24
519	0.28
520	0.31
521	0.38
522	0.44
523	0.51
524	0.59
525	0.66
526	0.72
527	0.78
528	0.84
529	0.87
530	0.89
531	0.91
532	0.92
533	0.93
534	0.91
535	0.9
536	0.9
537	0.89
538	0.9
539	0.9
540	0.89
541	0.88
542	0.89
543	0.89
544	0.89
545	0.87
546	0.87
547	0.87
548	0.87
549	0.88
550	0.9
551	0.87
552	0.86
553	0.87

A0A135LCD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer