Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LMS3

Protein Details
Accession A0A135LMS3    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-397DTSKPTATKTGGKKKRKSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-205KRVKK
328-332KKRKS
342-345KKTK
387-395TGGKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MGSSTTQLTSKVTSGSPYQLDKPQALKASTALLKHIKSTQQEHEKTSTKKTLIGDDDSDDEDGATKNEAIWLVLTTKQHVVDKNRLKPGKISIPHSLNTSPSLSICLITADPQRGVKDIIADPSFPQGLSSRIEKVIGFSKLKARYQSFESRRQLFAEHDVFLADDRIAMRLVQTLGKIFYKSSKRPIPIRIAEIEKVDGKRVKKDPKVPNSSSKEEKHASFASPLIVAKEIERTLNCASVQLAPSTTAAVRVGSSKFTPEQLSENIAAVVNGLTEKFVSKGWRNIKALHIKGANTMALPIWLADELWVEDANVLEAAPETEAIKDSKKRKSVGDSKLLEEKKTKKTKSTEDEEEAASAAARKEKLQQLKAQALEDGDTSKPTATKTGGKKKRKSTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.27
3 0.29
4 0.31
5 0.34
6 0.37
7 0.4
8 0.41
9 0.41
10 0.42
11 0.43
12 0.4
13 0.37
14 0.32
15 0.35
16 0.35
17 0.32
18 0.32
19 0.32
20 0.31
21 0.33
22 0.38
23 0.36
24 0.39
25 0.45
26 0.49
27 0.54
28 0.57
29 0.59
30 0.61
31 0.63
32 0.61
33 0.63
34 0.61
35 0.51
36 0.52
37 0.5
38 0.5
39 0.47
40 0.48
41 0.41
42 0.35
43 0.36
44 0.33
45 0.31
46 0.22
47 0.17
48 0.14
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.14
61 0.15
62 0.16
63 0.18
64 0.21
65 0.24
66 0.29
67 0.33
68 0.4
69 0.49
70 0.55
71 0.62
72 0.62
73 0.6
74 0.58
75 0.59
76 0.59
77 0.55
78 0.52
79 0.5
80 0.51
81 0.51
82 0.51
83 0.44
84 0.35
85 0.33
86 0.29
87 0.21
88 0.17
89 0.19
90 0.15
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.1
95 0.13
96 0.16
97 0.15
98 0.16
99 0.18
100 0.19
101 0.18
102 0.2
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.21
107 0.2
108 0.2
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.15
113 0.15
114 0.11
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.16
122 0.17
123 0.21
124 0.23
125 0.22
126 0.21
127 0.28
128 0.32
129 0.35
130 0.39
131 0.35
132 0.33
133 0.38
134 0.47
135 0.46
136 0.5
137 0.54
138 0.52
139 0.51
140 0.48
141 0.44
142 0.35
143 0.36
144 0.28
145 0.23
146 0.19
147 0.18
148 0.17
149 0.15
150 0.14
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.1
167 0.16
168 0.22
169 0.25
170 0.32
171 0.37
172 0.4
173 0.45
174 0.5
175 0.52
176 0.48
177 0.48
178 0.43
179 0.4
180 0.37
181 0.32
182 0.28
183 0.23
184 0.2
185 0.2
186 0.21
187 0.19
188 0.25
189 0.31
190 0.39
191 0.42
192 0.52
193 0.58
194 0.64
195 0.72
196 0.69
197 0.71
198 0.69
199 0.68
200 0.64
201 0.56
202 0.52
203 0.46
204 0.43
205 0.38
206 0.33
207 0.29
208 0.23
209 0.22
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.14
222 0.14
223 0.16
224 0.16
225 0.13
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.18
249 0.18
250 0.21
251 0.19
252 0.18
253 0.17
254 0.15
255 0.13
256 0.1
257 0.09
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.08
266 0.13
267 0.17
268 0.25
269 0.32
270 0.4
271 0.42
272 0.44
273 0.51
274 0.55
275 0.53
276 0.51
277 0.47
278 0.39
279 0.39
280 0.38
281 0.31
282 0.21
283 0.2
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.08
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.05
308 0.06
309 0.08
310 0.1
311 0.15
312 0.22
313 0.3
314 0.38
315 0.44
316 0.47
317 0.51
318 0.6
319 0.65
320 0.66
321 0.69
322 0.64
323 0.61
324 0.68
325 0.63
326 0.56
327 0.53
328 0.52
329 0.53
330 0.6
331 0.6
332 0.59
333 0.66
334 0.74
335 0.75
336 0.76
337 0.74
338 0.69
339 0.68
340 0.6
341 0.52
342 0.42
343 0.33
344 0.24
345 0.17
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.24
351 0.32
352 0.41
353 0.45
354 0.51
355 0.54
356 0.61
357 0.63
358 0.56
359 0.49
360 0.41
361 0.36
362 0.3
363 0.24
364 0.17
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.2
371 0.22
372 0.3
373 0.39
374 0.5
375 0.58
376 0.67
377 0.76