Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LTP3

Protein Details
Accession A0A135LTP3    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-115VAPVKTDKKAEKKPAAKKSKKEEAEBasic
405-428APTDDTPKKAKKGKKTETPKEAATHydrophilic
443-463AKAPATKAKGTKKATKTKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-77KRVSKRKAAPVAADSPAKKTKKVEAKPAEATKEATPKSILKKNEKATKSKAEKTAAPAKTNVEPTRQVKPRKR
97-135DKKAEKKPAAKKSKKEEAEVAPALKKAAAKKAAPKTKKP
198-212PNTKKAERKLAKQLR
312-350RRFKVTPWNRIEKKRLARGKTREQWSKSIETEQKKREAK
411-463PKKAKKGKKTETPKEAATESPAPKSSAAKSPVAKAPATKAKGTKKATKTKSKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKRVSKRKAAPVAADSPAKKTKKVEAKPAEATKEATPKSILKKNEKATKSKAEKTAAPAKTNVEPTRQVKPRKRAADFLTDEETEEPVAPVKTDKKAEKKPAAKKSKKEEAEVAPALKKAAAKKAAPKTKKPEPVVESEEEDAEVDVSPSDESEAENEGDDDQTEALIKGFESSGDEDESDGEGYKEGEPIPKAPNTKKAERKLAKQLRKDGPPEEPGTVYIGRIPHGFYEHQMKAYFSQFGEITKLRLSRNRFTGRSKHYAFIEFSSTTVAKIVADTMDNYLMYGHIVKCKYVPKEQLHPEIWKGANRRFKVTPWNRIEKKRLARGKTREQWSKSIETEQKKREAKNNKLKALGYELDLPKLKSVDDVPIQEAPKAVEAAEATETSEPAVEEPAKAIEAPAPTDDTPKKAKKGKKTETPKEAATESPAPKSSAAKSPVAKAPATKAKGTKKATKTKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.69
3 0.63
4 0.6
5 0.51
6 0.48
7 0.51
8 0.47
9 0.45
10 0.44
11 0.49
12 0.54
13 0.6
14 0.65
15 0.65
16 0.71
17 0.76
18 0.78
19 0.73
20 0.64
21 0.59
22 0.54
23 0.53
24 0.46
25 0.39
26 0.36
27 0.37
28 0.44
29 0.48
30 0.51
31 0.52
32 0.6
33 0.68
34 0.74
35 0.74
36 0.73
37 0.74
38 0.76
39 0.75
40 0.74
41 0.73
42 0.68
43 0.66
44 0.66
45 0.68
46 0.62
47 0.56
48 0.5
49 0.46
50 0.47
51 0.51
52 0.46
53 0.41
54 0.44
55 0.45
56 0.53
57 0.57
58 0.62
59 0.63
60 0.7
61 0.75
62 0.77
63 0.78
64 0.75
65 0.73
66 0.73
67 0.67
68 0.61
69 0.56
70 0.46
71 0.43
72 0.35
73 0.31
74 0.2
75 0.17
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.13
81 0.17
82 0.22
83 0.29
84 0.37
85 0.44
86 0.53
87 0.63
88 0.69
89 0.74
90 0.79
91 0.83
92 0.87
93 0.85
94 0.85
95 0.84
96 0.85
97 0.79
98 0.73
99 0.7
100 0.64
101 0.63
102 0.57
103 0.5
104 0.41
105 0.38
106 0.33
107 0.28
108 0.25
109 0.2
110 0.25
111 0.28
112 0.3
113 0.39
114 0.48
115 0.57
116 0.6
117 0.65
118 0.66
119 0.69
120 0.76
121 0.7
122 0.69
123 0.63
124 0.64
125 0.61
126 0.55
127 0.48
128 0.39
129 0.35
130 0.26
131 0.22
132 0.15
133 0.1
134 0.08
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.16
182 0.18
183 0.22
184 0.24
185 0.33
186 0.36
187 0.44
188 0.5
189 0.54
190 0.61
191 0.62
192 0.65
193 0.67
194 0.71
195 0.71
196 0.68
197 0.71
198 0.67
199 0.67
200 0.64
201 0.55
202 0.5
203 0.46
204 0.42
205 0.33
206 0.27
207 0.22
208 0.22
209 0.19
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.17
221 0.17
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.2
227 0.2
228 0.12
229 0.13
230 0.11
231 0.12
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.17
237 0.16
238 0.22
239 0.27
240 0.28
241 0.37
242 0.43
243 0.44
244 0.46
245 0.54
246 0.55
247 0.58
248 0.55
249 0.49
250 0.44
251 0.45
252 0.4
253 0.33
254 0.3
255 0.21
256 0.19
257 0.19
258 0.17
259 0.14
260 0.13
261 0.11
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.08
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.16
281 0.22
282 0.26
283 0.3
284 0.38
285 0.38
286 0.47
287 0.53
288 0.57
289 0.55
290 0.53
291 0.48
292 0.46
293 0.42
294 0.37
295 0.36
296 0.35
297 0.41
298 0.4
299 0.44
300 0.4
301 0.41
302 0.48
303 0.52
304 0.55
305 0.54
306 0.63
307 0.65
308 0.7
309 0.75
310 0.73
311 0.73
312 0.72
313 0.73
314 0.69
315 0.72
316 0.74
317 0.77
318 0.77
319 0.77
320 0.77
321 0.72
322 0.72
323 0.68
324 0.64
325 0.55
326 0.55
327 0.54
328 0.53
329 0.58
330 0.56
331 0.61
332 0.61
333 0.64
334 0.64
335 0.67
336 0.7
337 0.72
338 0.76
339 0.72
340 0.71
341 0.67
342 0.6
343 0.56
344 0.47
345 0.38
346 0.36
347 0.32
348 0.32
349 0.33
350 0.31
351 0.26
352 0.25
353 0.22
354 0.16
355 0.17
356 0.19
357 0.22
358 0.24
359 0.25
360 0.29
361 0.3
362 0.28
363 0.27
364 0.22
365 0.19
366 0.18
367 0.14
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.1
377 0.11
378 0.09
379 0.07
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.17
393 0.17
394 0.25
395 0.27
396 0.28
397 0.36
398 0.41
399 0.48
400 0.53
401 0.61
402 0.65
403 0.74
404 0.79
405 0.81
406 0.85
407 0.87
408 0.89
409 0.86
410 0.78
411 0.72
412 0.63
413 0.54
414 0.49
415 0.47
416 0.4
417 0.4
418 0.38
419 0.35
420 0.35
421 0.38
422 0.36
423 0.36
424 0.38
425 0.39
426 0.4
427 0.45
428 0.5
429 0.49
430 0.46
431 0.4
432 0.45
433 0.48
434 0.49
435 0.48
436 0.51
437 0.57
438 0.65
439 0.7
440 0.71
441 0.71
442 0.78
443 0.82