Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LGW1

Protein Details
Accession A0A135LGW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22YALESKKRKFHRVLESISKPHydrophilic
425-444AKIRRVRQVLTAKSPKRKAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
417-442KKADREWWAKIRRVRQVLTAKSPKRK
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 9.5, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYALESKKRKFHRVLESISKPLTSDSAPKTAPAAPTTVQDRISANLSIKKVRLASADPSELTAVRNSIQKISRPAHRIASANKRPTFVPWDRERFLERLETFRRVDRWTSKPSPINEVQWAKRGWICTDVMRVTCVSDCGGAVVVKLPDEIDELDGFNTEKVEERKEVRARLVDEYAKMLSSAHGESCPWRNKSCDATIQHLPLTNCDTALSGLHKRYTNISQMGDKLPADDIVHTPEGLDLDASIKGLPEEWFKEAEKPTGSSTEETQPTIVDNQDSTETHTPVNRAALALAFLGWDTASDGAAGLVGCGACFRRLGLWMYKPKDNGDVTVYTSLDVADEHMEYCPWIDKVAQSGTGRPNEKLAELRAGWQIVAEAVKVKHRRRLRTMGSTDTLRTDPGVPTETPGDEENTEAKKKADREWWAKIRRVRQVLTAKSPKRKAVLPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.8
3 0.8
4 0.78
5 0.74
6 0.67
7 0.58
8 0.47
9 0.39
10 0.33
11 0.25
12 0.27
13 0.26
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.34
18 0.35
19 0.36
20 0.29
21 0.28
22 0.23
23 0.27
24 0.31
25 0.32
26 0.29
27 0.27
28 0.27
29 0.26
30 0.28
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.29
35 0.32
36 0.31
37 0.34
38 0.32
39 0.32
40 0.32
41 0.3
42 0.33
43 0.35
44 0.37
45 0.33
46 0.33
47 0.31
48 0.28
49 0.25
50 0.2
51 0.15
52 0.14
53 0.19
54 0.19
55 0.24
56 0.27
57 0.31
58 0.38
59 0.41
60 0.47
61 0.48
62 0.5
63 0.5
64 0.5
65 0.5
66 0.5
67 0.57
68 0.58
69 0.62
70 0.61
71 0.56
72 0.52
73 0.52
74 0.53
75 0.48
76 0.48
77 0.48
78 0.53
79 0.53
80 0.55
81 0.54
82 0.47
83 0.43
84 0.42
85 0.35
86 0.35
87 0.38
88 0.4
89 0.38
90 0.41
91 0.42
92 0.37
93 0.43
94 0.43
95 0.45
96 0.49
97 0.53
98 0.56
99 0.59
100 0.57
101 0.58
102 0.54
103 0.52
104 0.51
105 0.52
106 0.46
107 0.46
108 0.44
109 0.38
110 0.36
111 0.34
112 0.27
113 0.24
114 0.24
115 0.2
116 0.25
117 0.25
118 0.23
119 0.22
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.1
149 0.11
150 0.14
151 0.17
152 0.2
153 0.28
154 0.33
155 0.35
156 0.34
157 0.37
158 0.36
159 0.36
160 0.37
161 0.3
162 0.26
163 0.25
164 0.22
165 0.18
166 0.15
167 0.12
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.18
176 0.24
177 0.25
178 0.26
179 0.27
180 0.3
181 0.35
182 0.36
183 0.36
184 0.32
185 0.35
186 0.37
187 0.36
188 0.33
189 0.32
190 0.28
191 0.22
192 0.23
193 0.18
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.19
206 0.22
207 0.23
208 0.23
209 0.23
210 0.22
211 0.23
212 0.24
213 0.22
214 0.19
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.1
240 0.11
241 0.13
242 0.14
243 0.19
244 0.19
245 0.21
246 0.2
247 0.2
248 0.2
249 0.21
250 0.21
251 0.17
252 0.19
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.2
257 0.17
258 0.17
259 0.17
260 0.15
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.15
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.2
271 0.19
272 0.19
273 0.2
274 0.15
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.1
305 0.14
306 0.19
307 0.27
308 0.35
309 0.39
310 0.43
311 0.43
312 0.42
313 0.45
314 0.4
315 0.33
316 0.29
317 0.26
318 0.25
319 0.26
320 0.25
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.15
340 0.17
341 0.22
342 0.2
343 0.26
344 0.31
345 0.38
346 0.39
347 0.35
348 0.37
349 0.32
350 0.34
351 0.32
352 0.28
353 0.27
354 0.25
355 0.28
356 0.28
357 0.27
358 0.24
359 0.21
360 0.18
361 0.13
362 0.13
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.21
367 0.29
368 0.33
369 0.41
370 0.49
371 0.58
372 0.62
373 0.72
374 0.73
375 0.75
376 0.77
377 0.75
378 0.71
379 0.65
380 0.58
381 0.51
382 0.42
383 0.32
384 0.28
385 0.23
386 0.2
387 0.2
388 0.23
389 0.19
390 0.21
391 0.24
392 0.22
393 0.22
394 0.22
395 0.22
396 0.18
397 0.2
398 0.23
399 0.26
400 0.28
401 0.27
402 0.27
403 0.31
404 0.34
405 0.4
406 0.43
407 0.48
408 0.54
409 0.63
410 0.71
411 0.73
412 0.78
413 0.78
414 0.77
415 0.78
416 0.77
417 0.69
418 0.69
419 0.71
420 0.71
421 0.73
422 0.75
423 0.74
424 0.76
425 0.8
426 0.77
427 0.71