Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LGB6

Protein Details
Accession A0A135LGB6    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-169LAQTNKNRKKIEKDRARRLAEEHydrophilic
313-337DISEVKIKKPKKKKAKATKRGTFMEBasic
569-588RETETERRARQQRERDRTSGBasic
657-678KGSGKMKTEKRLKKIEDEKKLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-115KRKRDEKNAA
155-162RKKIEKDR
318-332KIKKPKKKKAKATKR
395-402AAFKKRKK
661-670KMKTEKRLKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MPPLDKMITRSLGATASRFSPSSLSFLSSPLSPHIVKMASDLSIEQNNKIRVTLGLKPLPVPGAGPEFREDDSESGEEEDPASTIETRPAESYDNWKKVQDAAEAKRKRDEKNAAIKRARDIAQRNLQLQGTTLGEVNGEELDTKAFLAQTNKNRKKIEKDRARRLAEELEERERLAAAEYTAADLAGIKVGHSAGAFEGGEDHILTLKDAAVDDDEEDDELENLDLVEKERTEEKLELKKKKPVYDPTAENQGILSQYDEEIEGKKRKRFTLDAQGSTEEREAKRQEVSNQLRKNIISLDFEPEVPASDYMDISEVKIKKPKKKKAKATKRGTFMEDDEIAPVTDSNDAQGSSAMDIDSKAGVPVPARRKPINEDVSFVDDDDLQASLALQRRAAFKKRKKISPEELAKQLREEETQTPMEIESPDGEDEEPGLVIDETSEFVSNLHKPTLLAQEEKPTRAVAKVRESPEGEAEAEIEGEGVEIDMDRYADIDDEEELAARIKRDQESTTEPQQLTVTGLEEESSLDQGLAATLSMLKSRGLVKDNDGGQKNALMRDRQRFLAEKLNRETETERRARQQRERDRTSGKLERMSAREREEHARWENKHRDQQEARHMAEVFNSQYKPDVQLRYVDEFGRNMNQKEAFKQLSHQFHGKGSGKMKTEKRLKKIEDEKKLESMSTLDGSQNNPMNTVMDTAARKNRQAGVRMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.21
3 0.2
4 0.22
5 0.21
6 0.21
7 0.21
8 0.21
9 0.24
10 0.23
11 0.24
12 0.22
13 0.23
14 0.23
15 0.21
16 0.21
17 0.19
18 0.23
19 0.19
20 0.2
21 0.23
22 0.23
23 0.22
24 0.24
25 0.23
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.19
30 0.24
31 0.25
32 0.26
33 0.31
34 0.33
35 0.33
36 0.32
37 0.29
38 0.26
39 0.3
40 0.34
41 0.36
42 0.37
43 0.37
44 0.38
45 0.39
46 0.36
47 0.31
48 0.24
49 0.18
50 0.22
51 0.22
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.25
56 0.26
57 0.25
58 0.18
59 0.21
60 0.2
61 0.18
62 0.19
63 0.19
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.18
76 0.19
77 0.21
78 0.22
79 0.32
80 0.36
81 0.41
82 0.42
83 0.41
84 0.4
85 0.42
86 0.44
87 0.42
88 0.41
89 0.43
90 0.52
91 0.56
92 0.57
93 0.61
94 0.62
95 0.58
96 0.59
97 0.6
98 0.6
99 0.66
100 0.73
101 0.75
102 0.75
103 0.73
104 0.67
105 0.64
106 0.58
107 0.55
108 0.51
109 0.51
110 0.55
111 0.57
112 0.54
113 0.51
114 0.48
115 0.4
116 0.35
117 0.28
118 0.2
119 0.16
120 0.15
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.09
135 0.14
136 0.22
137 0.31
138 0.43
139 0.51
140 0.58
141 0.62
142 0.66
143 0.72
144 0.75
145 0.76
146 0.76
147 0.79
148 0.82
149 0.87
150 0.85
151 0.76
152 0.69
153 0.64
154 0.57
155 0.53
156 0.47
157 0.41
158 0.38
159 0.36
160 0.32
161 0.25
162 0.21
163 0.16
164 0.13
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.05
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.11
219 0.12
220 0.15
221 0.18
222 0.23
223 0.32
224 0.4
225 0.48
226 0.51
227 0.57
228 0.59
229 0.63
230 0.65
231 0.64
232 0.64
233 0.62
234 0.62
235 0.58
236 0.61
237 0.54
238 0.46
239 0.36
240 0.3
241 0.23
242 0.18
243 0.15
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.14
251 0.21
252 0.25
253 0.29
254 0.33
255 0.35
256 0.41
257 0.44
258 0.45
259 0.5
260 0.53
261 0.52
262 0.5
263 0.49
264 0.44
265 0.39
266 0.33
267 0.26
268 0.19
269 0.21
270 0.21
271 0.2
272 0.24
273 0.25
274 0.27
275 0.34
276 0.41
277 0.45
278 0.46
279 0.47
280 0.46
281 0.43
282 0.4
283 0.32
284 0.27
285 0.21
286 0.19
287 0.21
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.16
292 0.15
293 0.12
294 0.11
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.21
306 0.26
307 0.34
308 0.45
309 0.55
310 0.6
311 0.7
312 0.79
313 0.84
314 0.9
315 0.92
316 0.92
317 0.89
318 0.84
319 0.77
320 0.68
321 0.59
322 0.49
323 0.41
324 0.32
325 0.24
326 0.18
327 0.15
328 0.13
329 0.1
330 0.09
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.06
352 0.12
353 0.19
354 0.24
355 0.28
356 0.3
357 0.32
358 0.36
359 0.45
360 0.46
361 0.39
362 0.37
363 0.34
364 0.37
365 0.34
366 0.29
367 0.2
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.08
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.06
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.12
380 0.17
381 0.22
382 0.3
383 0.38
384 0.43
385 0.53
386 0.6
387 0.65
388 0.67
389 0.72
390 0.72
391 0.72
392 0.72
393 0.66
394 0.67
395 0.63
396 0.56
397 0.48
398 0.41
399 0.32
400 0.25
401 0.23
402 0.17
403 0.18
404 0.18
405 0.18
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.12
410 0.11
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.04
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.05
430 0.06
431 0.09
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.15
438 0.22
439 0.21
440 0.22
441 0.21
442 0.3
443 0.32
444 0.33
445 0.3
446 0.24
447 0.22
448 0.23
449 0.26
450 0.23
451 0.29
452 0.35
453 0.37
454 0.41
455 0.41
456 0.39
457 0.37
458 0.33
459 0.25
460 0.18
461 0.16
462 0.11
463 0.1
464 0.08
465 0.06
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.03
470 0.02
471 0.02
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.1
490 0.13
491 0.16
492 0.18
493 0.2
494 0.23
495 0.3
496 0.35
497 0.39
498 0.42
499 0.4
500 0.38
501 0.37
502 0.32
503 0.26
504 0.21
505 0.16
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.06
518 0.05
519 0.04
520 0.03
521 0.04
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.09
527 0.12
528 0.16
529 0.18
530 0.2
531 0.23
532 0.29
533 0.33
534 0.38
535 0.37
536 0.34
537 0.32
538 0.34
539 0.32
540 0.3
541 0.3
542 0.28
543 0.33
544 0.4
545 0.42
546 0.41
547 0.43
548 0.42
549 0.42
550 0.46
551 0.46
552 0.45
553 0.47
554 0.51
555 0.47
556 0.47
557 0.47
558 0.44
559 0.47
560 0.46
561 0.45
562 0.48
563 0.56
564 0.62
565 0.68
566 0.72
567 0.74
568 0.78
569 0.81
570 0.79
571 0.77
572 0.73
573 0.73
574 0.7
575 0.63
576 0.58
577 0.56
578 0.55
579 0.54
580 0.55
581 0.51
582 0.47
583 0.48
584 0.46
585 0.49
586 0.46
587 0.48
588 0.51
589 0.54
590 0.53
591 0.59
592 0.64
593 0.66
594 0.72
595 0.66
596 0.68
597 0.67
598 0.71
599 0.72
600 0.69
601 0.62
602 0.57
603 0.55
604 0.46
605 0.41
606 0.36
607 0.29
608 0.27
609 0.26
610 0.22
611 0.24
612 0.25
613 0.28
614 0.31
615 0.33
616 0.28
617 0.35
618 0.39
619 0.42
620 0.42
621 0.39
622 0.34
623 0.31
624 0.32
625 0.35
626 0.35
627 0.31
628 0.35
629 0.38
630 0.38
631 0.41
632 0.46
633 0.41
634 0.37
635 0.43
636 0.46
637 0.48
638 0.51
639 0.53
640 0.47
641 0.45
642 0.54
643 0.51
644 0.48
645 0.46
646 0.47
647 0.47
648 0.54
649 0.58
650 0.59
651 0.66
652 0.68
653 0.71
654 0.75
655 0.75
656 0.77
657 0.81
658 0.81
659 0.82
660 0.8
661 0.76
662 0.72
663 0.68
664 0.58
665 0.48
666 0.4
667 0.32
668 0.27
669 0.23
670 0.2
671 0.21
672 0.22
673 0.28
674 0.32
675 0.28
676 0.27
677 0.26
678 0.25
679 0.23
680 0.24
681 0.18
682 0.18
683 0.21
684 0.26
685 0.35
686 0.37
687 0.39
688 0.42
689 0.48
690 0.49