Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LDY7

Protein Details
Accession A0A135LDY7    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-336HGKGKVSPPKQQPRKKSPPPAVLHydrophilic
586-610PETEDQRADRKRKELKRSLEAKSKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-331KSQHGKGKVSPPKQQPRKKSP
372-478APPPKAREPPKAPKGGLGKIGGKSKKEIERQPSPSPPPPQVQEAPKVSKGGLGKIGGKSKKETERQPSPSPPQPPSPPAQVREAPKRPKGGLGVIGGKKKAPKEPSP
511-528KAKRPGKLGMIGGKTKAK
594-618DRKRKELKRSLEAKSKAPAKKKRRF
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto_nucl 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPSKWQRLQLSQQGLPPLLFQYTWTRQGYEIHITDLTYIWSERLSNKAIAKRAEEDATTIDPGEDPEQLNVLLEKIGEALQKGNGSVILSSGTQTDSLEIMITTKLPAPLKPLKWSLRLSKEPLSSLTINLLLPLLREEAEWESRQRSLLNQIRQKDYVLGKLFDKMETIGVDLGSVFPSAAGSRMSRKAITRSEAAKFVKGIAPFEEQAWLAETGVSDGPGLATNLLQEISQSGDAHDLDTLTQSGGEWWHQLARRSETSAIDASIEEEVPDEEDRGEPIETKHIDEGGDSTASSDVDEFQRQETPPRLKSQHGKGKVSPPKQQPRKKSPPPAVLPSEEDEATASDSEYESEPAPRQRHIPSVSGSPEPAAPPPKAREPPKAPKGGLGKIGGKSKKEIERQPSPSPPPPQVQEAPKVSKGGLGKIGGKSKKETERQPSPSPPQPPSPPAQVREAPKRPKGGLGVIGGKKKAPKEPSPSPAPSPPAQTRDSLKSQEPSVSPEETPAPAAVKAKRPGKLGMIGGKTKAKASEPARDASPPPSSDTVISHEKAAPAKLKADRQVPIKESSPLPTLAAEKGPSAPPTEPETEDQRADRKRKELKRSLEAKSKAPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.45
3 0.37
4 0.29
5 0.23
6 0.19
7 0.18
8 0.23
9 0.27
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.35
14 0.39
15 0.42
16 0.41
17 0.36
18 0.32
19 0.31
20 0.29
21 0.29
22 0.25
23 0.21
24 0.14
25 0.13
26 0.11
27 0.11
28 0.13
29 0.15
30 0.19
31 0.22
32 0.26
33 0.32
34 0.38
35 0.43
36 0.45
37 0.46
38 0.45
39 0.46
40 0.43
41 0.37
42 0.32
43 0.29
44 0.28
45 0.24
46 0.21
47 0.17
48 0.14
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.13
58 0.11
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.1
92 0.14
93 0.15
94 0.16
95 0.22
96 0.31
97 0.34
98 0.39
99 0.45
100 0.46
101 0.51
102 0.57
103 0.58
104 0.59
105 0.62
106 0.61
107 0.6
108 0.58
109 0.53
110 0.49
111 0.45
112 0.37
113 0.31
114 0.28
115 0.22
116 0.19
117 0.17
118 0.16
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.13
127 0.17
128 0.19
129 0.2
130 0.21
131 0.22
132 0.23
133 0.21
134 0.2
135 0.26
136 0.33
137 0.4
138 0.44
139 0.48
140 0.52
141 0.52
142 0.51
143 0.46
144 0.41
145 0.39
146 0.36
147 0.33
148 0.29
149 0.32
150 0.32
151 0.26
152 0.25
153 0.18
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.13
172 0.17
173 0.19
174 0.21
175 0.23
176 0.29
177 0.32
178 0.35
179 0.35
180 0.35
181 0.36
182 0.41
183 0.4
184 0.35
185 0.3
186 0.29
187 0.27
188 0.23
189 0.22
190 0.18
191 0.2
192 0.18
193 0.18
194 0.18
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.1
239 0.13
240 0.17
241 0.2
242 0.24
243 0.25
244 0.27
245 0.29
246 0.26
247 0.26
248 0.22
249 0.19
250 0.15
251 0.13
252 0.11
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.12
290 0.12
291 0.16
292 0.21
293 0.26
294 0.27
295 0.32
296 0.34
297 0.35
298 0.42
299 0.48
300 0.5
301 0.51
302 0.52
303 0.49
304 0.57
305 0.61
306 0.6
307 0.58
308 0.59
309 0.63
310 0.7
311 0.74
312 0.74
313 0.76
314 0.82
315 0.82
316 0.83
317 0.81
318 0.8
319 0.77
320 0.74
321 0.66
322 0.57
323 0.5
324 0.42
325 0.35
326 0.26
327 0.21
328 0.15
329 0.12
330 0.11
331 0.09
332 0.07
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.11
341 0.17
342 0.18
343 0.18
344 0.22
345 0.23
346 0.29
347 0.3
348 0.31
349 0.27
350 0.3
351 0.32
352 0.29
353 0.27
354 0.2
355 0.19
356 0.16
357 0.17
358 0.16
359 0.14
360 0.17
361 0.21
362 0.27
363 0.34
364 0.37
365 0.44
366 0.5
367 0.59
368 0.64
369 0.66
370 0.59
371 0.58
372 0.59
373 0.53
374 0.48
375 0.41
376 0.37
377 0.34
378 0.41
379 0.38
380 0.33
381 0.33
382 0.35
383 0.4
384 0.43
385 0.46
386 0.47
387 0.54
388 0.59
389 0.63
390 0.63
391 0.62
392 0.62
393 0.59
394 0.55
395 0.5
396 0.46
397 0.45
398 0.44
399 0.42
400 0.42
401 0.43
402 0.44
403 0.41
404 0.39
405 0.34
406 0.32
407 0.29
408 0.25
409 0.23
410 0.2
411 0.22
412 0.25
413 0.33
414 0.32
415 0.33
416 0.33
417 0.37
418 0.43
419 0.46
420 0.51
421 0.53
422 0.6
423 0.65
424 0.69
425 0.69
426 0.67
427 0.68
428 0.66
429 0.6
430 0.57
431 0.55
432 0.52
433 0.48
434 0.51
435 0.49
436 0.46
437 0.49
438 0.47
439 0.49
440 0.55
441 0.6
442 0.59
443 0.59
444 0.62
445 0.56
446 0.55
447 0.52
448 0.45
449 0.41
450 0.37
451 0.4
452 0.39
453 0.41
454 0.37
455 0.35
456 0.35
457 0.34
458 0.37
459 0.36
460 0.4
461 0.46
462 0.54
463 0.59
464 0.63
465 0.64
466 0.61
467 0.59
468 0.56
469 0.49
470 0.48
471 0.47
472 0.44
473 0.42
474 0.41
475 0.41
476 0.42
477 0.45
478 0.42
479 0.4
480 0.38
481 0.38
482 0.4
483 0.36
484 0.34
485 0.33
486 0.31
487 0.27
488 0.26
489 0.27
490 0.22
491 0.22
492 0.18
493 0.16
494 0.15
495 0.2
496 0.23
497 0.28
498 0.36
499 0.41
500 0.44
501 0.46
502 0.47
503 0.47
504 0.48
505 0.45
506 0.45
507 0.44
508 0.42
509 0.42
510 0.43
511 0.39
512 0.35
513 0.33
514 0.28
515 0.31
516 0.33
517 0.4
518 0.39
519 0.41
520 0.41
521 0.42
522 0.41
523 0.38
524 0.39
525 0.3
526 0.32
527 0.31
528 0.3
529 0.29
530 0.29
531 0.3
532 0.3
533 0.3
534 0.28
535 0.27
536 0.29
537 0.3
538 0.32
539 0.32
540 0.28
541 0.34
542 0.38
543 0.43
544 0.46
545 0.5
546 0.51
547 0.53
548 0.58
549 0.55
550 0.54
551 0.49
552 0.47
553 0.43
554 0.42
555 0.38
556 0.31
557 0.29
558 0.26
559 0.26
560 0.24
561 0.25
562 0.21
563 0.2
564 0.22
565 0.24
566 0.23
567 0.24
568 0.23
569 0.23
570 0.29
571 0.31
572 0.31
573 0.32
574 0.38
575 0.38
576 0.4
577 0.4
578 0.43
579 0.48
580 0.54
581 0.56
582 0.59
583 0.66
584 0.72
585 0.8
586 0.81
587 0.81
588 0.84
589 0.86
590 0.85
591 0.84
592 0.78
593 0.72
594 0.71
595 0.71
596 0.68
597 0.7
598 0.72