Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135LIG4

Protein Details
Accession A0A135LIG4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
788-815APQHAAKPKRRATEHKTHKPNHHHTAETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
793-802AKPKRRATEH
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MLKPFRIRNLRVPAQHEPEQPADPRTASGVVQISATDYDDLASNHPRARLTYLDDDDDDETITVGSAFELSQRLEEPLDINTQLEAVRLSRNDIIPMHIFDIRRSNSVTELWKRFENSVPKQGSADGKNDTQPTSKAIVLEEQQQQEVPVPHTSSPSLSGDQPRPFMEAFEAELAEMLNAAESSESREPQPNSPPTEPSANTNSERSPHPVEILAAQVLDQLINGATMVQSEFRSKIPELQRQLHNAQRQFEETQKSLPKNVESSLRALLATVEAHLRTAFNNLPDGGRQMAEDAFQAGRPVAENAADGFRTMASELNEVGRTLFAAFESEFGRARSTASTSSTSEAPNPGPPGPAFNTAASNESMAPGNVYPQSSNTHPSETATNEKSTASPGQSNPSYTVQAGVTPIQSHHDRQPIPAQPVHWAPPTWPAPLWNPFHTYNAPPPPCPPLPSVAMPNFTHFTHGRPAPPPPPPPAFNTPFCVRQNSQVKPRESKSSSATRSLFIGNVGFKVTDKMIQDVFAAKGFLVKVDLPLDTASGRHAGFGYVNFPSEYPAFAAMEALQGAVIDGHSINLEPMHHPPIESVRPAKVSPNVGTTAHDTQSKSPQADMSGVNNSPSERNSTTLGAFVPSLAAKPQKRLSQPSSSENRRKSVSFVDLTQNDSSQAQAESSALLDSPSDDPAFSARFPSLLPETSAQHNDPLSGQGVSNTESHFPPVSQWEAQLLANRQERRGTEPITGALHIQSPNNPKHGEELSTPILPSHPTPKGFGQSASGASEAVRPVRGLNAPQHAAKPKRRATEHKTHKPNHHHTAETSRHNSLKHSASMRRLGDRSQGSAEMDTWARLSRRERNGASSHEQIPGSFPVEDTTRVDLSRTLDASVPGSNDEAIERCVSSLIDMGYGAGQEGGRSRMAVYAAMVDGVLMDAIDMIEEERQIYERRPSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.72
3 0.66
4 0.61
5 0.57
6 0.55
7 0.51
8 0.45
9 0.4
10 0.34
11 0.3
12 0.28
13 0.25
14 0.2
15 0.23
16 0.23
17 0.2
18 0.19
19 0.18
20 0.17
21 0.16
22 0.17
23 0.13
24 0.1
25 0.1
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.19
30 0.21
31 0.24
32 0.27
33 0.27
34 0.28
35 0.31
36 0.32
37 0.33
38 0.39
39 0.39
40 0.4
41 0.39
42 0.39
43 0.35
44 0.32
45 0.25
46 0.16
47 0.13
48 0.1
49 0.09
50 0.07
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.07
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.1
74 0.14
75 0.14
76 0.18
77 0.22
78 0.23
79 0.26
80 0.26
81 0.29
82 0.27
83 0.28
84 0.27
85 0.26
86 0.26
87 0.25
88 0.33
89 0.31
90 0.3
91 0.31
92 0.29
93 0.28
94 0.32
95 0.38
96 0.38
97 0.41
98 0.42
99 0.44
100 0.45
101 0.45
102 0.48
103 0.5
104 0.48
105 0.53
106 0.52
107 0.49
108 0.48
109 0.49
110 0.49
111 0.42
112 0.39
113 0.33
114 0.33
115 0.36
116 0.38
117 0.36
118 0.31
119 0.29
120 0.29
121 0.28
122 0.27
123 0.23
124 0.22
125 0.24
126 0.23
127 0.29
128 0.31
129 0.29
130 0.29
131 0.28
132 0.27
133 0.28
134 0.29
135 0.24
136 0.22
137 0.23
138 0.23
139 0.25
140 0.26
141 0.22
142 0.23
143 0.24
144 0.22
145 0.24
146 0.3
147 0.35
148 0.37
149 0.38
150 0.36
151 0.35
152 0.33
153 0.3
154 0.25
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.07
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.1
171 0.13
172 0.14
173 0.17
174 0.24
175 0.27
176 0.32
177 0.41
178 0.41
179 0.46
180 0.47
181 0.47
182 0.43
183 0.48
184 0.43
185 0.39
186 0.38
187 0.36
188 0.35
189 0.35
190 0.33
191 0.29
192 0.31
193 0.32
194 0.32
195 0.28
196 0.28
197 0.26
198 0.25
199 0.24
200 0.23
201 0.17
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.16
222 0.16
223 0.24
224 0.31
225 0.38
226 0.42
227 0.48
228 0.52
229 0.54
230 0.58
231 0.57
232 0.56
233 0.52
234 0.49
235 0.44
236 0.43
237 0.39
238 0.4
239 0.39
240 0.32
241 0.35
242 0.39
243 0.38
244 0.38
245 0.38
246 0.36
247 0.32
248 0.34
249 0.33
250 0.28
251 0.3
252 0.28
253 0.25
254 0.23
255 0.2
256 0.18
257 0.12
258 0.11
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.12
267 0.13
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.12
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.13
326 0.15
327 0.18
328 0.17
329 0.19
330 0.2
331 0.19
332 0.18
333 0.19
334 0.17
335 0.16
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.21
344 0.19
345 0.21
346 0.19
347 0.21
348 0.17
349 0.15
350 0.12
351 0.11
352 0.1
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.13
362 0.13
363 0.18
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.19
368 0.2
369 0.2
370 0.24
371 0.22
372 0.21
373 0.2
374 0.2
375 0.19
376 0.19
377 0.19
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.21
382 0.22
383 0.23
384 0.23
385 0.23
386 0.22
387 0.18
388 0.19
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.11
397 0.12
398 0.14
399 0.18
400 0.23
401 0.23
402 0.25
403 0.32
404 0.34
405 0.36
406 0.35
407 0.31
408 0.27
409 0.29
410 0.29
411 0.23
412 0.19
413 0.16
414 0.22
415 0.23
416 0.22
417 0.2
418 0.19
419 0.21
420 0.28
421 0.3
422 0.24
423 0.27
424 0.27
425 0.29
426 0.29
427 0.27
428 0.27
429 0.32
430 0.32
431 0.28
432 0.29
433 0.32
434 0.31
435 0.31
436 0.26
437 0.2
438 0.22
439 0.23
440 0.26
441 0.22
442 0.25
443 0.22
444 0.24
445 0.22
446 0.19
447 0.21
448 0.17
449 0.17
450 0.19
451 0.21
452 0.21
453 0.21
454 0.24
455 0.25
456 0.3
457 0.31
458 0.31
459 0.33
460 0.32
461 0.36
462 0.39
463 0.39
464 0.35
465 0.37
466 0.34
467 0.37
468 0.36
469 0.36
470 0.3
471 0.34
472 0.41
473 0.41
474 0.47
475 0.49
476 0.51
477 0.51
478 0.53
479 0.53
480 0.47
481 0.46
482 0.42
483 0.43
484 0.42
485 0.43
486 0.41
487 0.33
488 0.32
489 0.3
490 0.25
491 0.16
492 0.16
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.09
509 0.09
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.1
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.1
538 0.09
539 0.1
540 0.08
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.06
546 0.07
547 0.06
548 0.05
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.05
562 0.06
563 0.09
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.13
568 0.18
569 0.19
570 0.21
571 0.2
572 0.19
573 0.22
574 0.22
575 0.25
576 0.23
577 0.25
578 0.24
579 0.25
580 0.24
581 0.23
582 0.24
583 0.25
584 0.24
585 0.21
586 0.23
587 0.21
588 0.22
589 0.29
590 0.31
591 0.27
592 0.25
593 0.24
594 0.22
595 0.24
596 0.23
597 0.18
598 0.18
599 0.18
600 0.18
601 0.17
602 0.17
603 0.15
604 0.15
605 0.18
606 0.15
607 0.17
608 0.18
609 0.19
610 0.19
611 0.18
612 0.18
613 0.13
614 0.12
615 0.1
616 0.09
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.15
621 0.15
622 0.21
623 0.26
624 0.32
625 0.36
626 0.44
627 0.47
628 0.5
629 0.53
630 0.56
631 0.6
632 0.63
633 0.67
634 0.63
635 0.61
636 0.54
637 0.51
638 0.46
639 0.42
640 0.39
641 0.33
642 0.32
643 0.35
644 0.34
645 0.36
646 0.34
647 0.28
648 0.23
649 0.21
650 0.19
651 0.12
652 0.12
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.07
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.09
668 0.11
669 0.12
670 0.11
671 0.12
672 0.1
673 0.1
674 0.1
675 0.14
676 0.15
677 0.14
678 0.16
679 0.16
680 0.19
681 0.22
682 0.25
683 0.22
684 0.22
685 0.21
686 0.2
687 0.18
688 0.18
689 0.15
690 0.13
691 0.12
692 0.11
693 0.12
694 0.13
695 0.14
696 0.13
697 0.14
698 0.14
699 0.16
700 0.15
701 0.14
702 0.14
703 0.17
704 0.2
705 0.19
706 0.19
707 0.18
708 0.19
709 0.2
710 0.23
711 0.22
712 0.25
713 0.31
714 0.32
715 0.32
716 0.35
717 0.35
718 0.37
719 0.4
720 0.36
721 0.32
722 0.32
723 0.33
724 0.31
725 0.3
726 0.23
727 0.18
728 0.19
729 0.17
730 0.16
731 0.2
732 0.25
733 0.28
734 0.32
735 0.32
736 0.29
737 0.33
738 0.34
739 0.31
740 0.26
741 0.29
742 0.28
743 0.28
744 0.27
745 0.22
746 0.21
747 0.19
748 0.2
749 0.21
750 0.23
751 0.24
752 0.27
753 0.31
754 0.36
755 0.36
756 0.34
757 0.3
758 0.27
759 0.27
760 0.25
761 0.21
762 0.16
763 0.15
764 0.17
765 0.15
766 0.14
767 0.13
768 0.12
769 0.12
770 0.16
771 0.18
772 0.19
773 0.24
774 0.3
775 0.32
776 0.33
777 0.38
778 0.43
779 0.49
780 0.54
781 0.58
782 0.58
783 0.65
784 0.7
785 0.75
786 0.75
787 0.78
788 0.8
789 0.81
790 0.84
791 0.83
792 0.86
793 0.87
794 0.87
795 0.86
796 0.8
797 0.73
798 0.66
799 0.68
800 0.66
801 0.64
802 0.59
803 0.54
804 0.52
805 0.49
806 0.49
807 0.45
808 0.43
809 0.4
810 0.43
811 0.44
812 0.48
813 0.55
814 0.55
815 0.56
816 0.52
817 0.48
818 0.5
819 0.46
820 0.43
821 0.38
822 0.37
823 0.32
824 0.31
825 0.29
826 0.23
827 0.21
828 0.18
829 0.16
830 0.18
831 0.17
832 0.21
833 0.27
834 0.34
835 0.42
836 0.51
837 0.52
838 0.56
839 0.6
840 0.62
841 0.62
842 0.58
843 0.51
844 0.47
845 0.44
846 0.37
847 0.35
848 0.31
849 0.27
850 0.22
851 0.19
852 0.17
853 0.19
854 0.21
855 0.21
856 0.22
857 0.22
858 0.22
859 0.22
860 0.23
861 0.24
862 0.28
863 0.25
864 0.22
865 0.22
866 0.23
867 0.24
868 0.23
869 0.2
870 0.16
871 0.16
872 0.15
873 0.13
874 0.14
875 0.14
876 0.14
877 0.14
878 0.13
879 0.12
880 0.13
881 0.13
882 0.12
883 0.13
884 0.12
885 0.11
886 0.1
887 0.1
888 0.1
889 0.1
890 0.09
891 0.08
892 0.07
893 0.07
894 0.1
895 0.12
896 0.12
897 0.12
898 0.13
899 0.14
900 0.15
901 0.15
902 0.14
903 0.14
904 0.14
905 0.13
906 0.12
907 0.09
908 0.08
909 0.08
910 0.06
911 0.03
912 0.03
913 0.03
914 0.03
915 0.03
916 0.04
917 0.04
918 0.05
919 0.06
920 0.07
921 0.08
922 0.11
923 0.13
924 0.17