Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4ZMJ6

Protein Details
Accession E4ZMJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
621-647QEDIEKQMPRKVKKRRKLDDDSFEEYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
630-637RKVKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.833, cyto 9, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MEATRGPPRVKNKAAAPIQISAEQLLREAVDRQDEKLKAPTQRFADLEELHEHQGRKRKEFEDYVRRNRINMNNWMRYAQWELEQKEFRRARSVFERALDVDSTSVALWLRYIEAEMKNRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEETLGNIDGARSVFERWMQWEPEEAAWSSYIKLEKRHGEFERARAIFERFTVVHPEPKNWIKWAKFEEENGTSDLVRDVYGTAVETLGDDFMDEKLFMAYAKFEARLKELERARAIYRFALDRMPRSKSLNLHKAFTTFEKQYGDRDGIEDVILSKRRVHYEEQIKETAKNYDAWIDFARLEETSGNTDRVRDVYERAIAQIPPTQEKRHWRRYIYLWLFYAVFEETVSRDIDRTRQIYQECIRLLPHKRFTFAKVWLMFAHFEVRQGQLTTARKLLGQSIGMCPKDKLFKGYIELEMKLFEFNRCRQLYTKYIEWNGANCQTWIKFAELERGLDDLDRTRAIFELAVDEPQLDMPELLWKAYIDFEEAEGEYDRTRALYERLLSKTDHVKVWTSWAQFELSVPDEEDQDTPAANTDDEQDRPISAAAKSRARDIFKRAHARLKEKDLKEDRVALLTAWRSFEAIHGSPQDQEDIEKQMPRKVKKRRKLDDDSFEEYVDYVFPADDESAAKLAKLMANAQKWKMEQAKKAAAKEEEEGGGDGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.6
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.22
18 0.23
19 0.26
20 0.34
21 0.34
22 0.36
23 0.42
24 0.45
25 0.45
26 0.49
27 0.53
28 0.49
29 0.54
30 0.52
31 0.47
32 0.48
33 0.41
34 0.39
35 0.36
36 0.34
37 0.31
38 0.35
39 0.33
40 0.31
41 0.39
42 0.42
43 0.44
44 0.49
45 0.49
46 0.53
47 0.61
48 0.66
49 0.68
50 0.72
51 0.76
52 0.79
53 0.77
54 0.71
55 0.7
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.62
62 0.61
63 0.53
64 0.47
65 0.44
66 0.36
67 0.32
68 0.33
69 0.35
70 0.41
71 0.48
72 0.46
73 0.52
74 0.53
75 0.49
76 0.5
77 0.48
78 0.47
79 0.49
80 0.55
81 0.49
82 0.47
83 0.49
84 0.41
85 0.43
86 0.36
87 0.27
88 0.2
89 0.16
90 0.14
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.12
101 0.17
102 0.24
103 0.28
104 0.32
105 0.37
106 0.37
107 0.44
108 0.46
109 0.46
110 0.46
111 0.48
112 0.47
113 0.46
114 0.49
115 0.42
116 0.36
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.19
138 0.18
139 0.17
140 0.15
141 0.12
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.1
150 0.12
151 0.13
152 0.16
153 0.21
154 0.22
155 0.21
156 0.24
157 0.24
158 0.24
159 0.24
160 0.21
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.14
166 0.17
167 0.16
168 0.2
169 0.26
170 0.33
171 0.36
172 0.44
173 0.44
174 0.49
175 0.5
176 0.51
177 0.55
178 0.47
179 0.44
180 0.38
181 0.38
182 0.29
183 0.26
184 0.25
185 0.16
186 0.18
187 0.23
188 0.23
189 0.28
190 0.28
191 0.29
192 0.32
193 0.35
194 0.36
195 0.34
196 0.39
197 0.34
198 0.4
199 0.42
200 0.42
201 0.4
202 0.4
203 0.41
204 0.36
205 0.36
206 0.31
207 0.27
208 0.21
209 0.19
210 0.17
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.17
243 0.19
244 0.25
245 0.26
246 0.3
247 0.3
248 0.32
249 0.31
250 0.3
251 0.29
252 0.23
253 0.22
254 0.18
255 0.18
256 0.21
257 0.21
258 0.24
259 0.27
260 0.29
261 0.3
262 0.32
263 0.35
264 0.36
265 0.44
266 0.48
267 0.45
268 0.44
269 0.42
270 0.39
271 0.37
272 0.34
273 0.29
274 0.21
275 0.22
276 0.22
277 0.22
278 0.23
279 0.24
280 0.22
281 0.17
282 0.17
283 0.15
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.08
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.16
293 0.18
294 0.21
295 0.23
296 0.28
297 0.36
298 0.41
299 0.43
300 0.45
301 0.43
302 0.42
303 0.39
304 0.33
305 0.24
306 0.2
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.17
312 0.16
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.14
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.15
332 0.14
333 0.15
334 0.16
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.16
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.51
347 0.49
348 0.52
349 0.55
350 0.62
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.36
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.12
369 0.15
370 0.18
371 0.18
372 0.22
373 0.22
374 0.28
375 0.29
376 0.31
377 0.27
378 0.25
379 0.25
380 0.27
381 0.32
382 0.33
383 0.39
384 0.35
385 0.37
386 0.38
387 0.41
388 0.41
389 0.39
390 0.39
391 0.31
392 0.32
393 0.3
394 0.3
395 0.26
396 0.2
397 0.2
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.17
406 0.2
407 0.21
408 0.21
409 0.2
410 0.19
411 0.19
412 0.21
413 0.16
414 0.14
415 0.14
416 0.17
417 0.22
418 0.22
419 0.22
420 0.21
421 0.21
422 0.25
423 0.24
424 0.24
425 0.21
426 0.22
427 0.25
428 0.28
429 0.3
430 0.27
431 0.27
432 0.23
433 0.21
434 0.2
435 0.17
436 0.15
437 0.13
438 0.15
439 0.18
440 0.26
441 0.27
442 0.29
443 0.3
444 0.35
445 0.39
446 0.39
447 0.41
448 0.37
449 0.38
450 0.39
451 0.37
452 0.34
453 0.31
454 0.3
455 0.25
456 0.21
457 0.21
458 0.18
459 0.19
460 0.19
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.23
465 0.22
466 0.23
467 0.21
468 0.2
469 0.19
470 0.17
471 0.17
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.11
507 0.12
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.14
516 0.18
517 0.24
518 0.27
519 0.28
520 0.28
521 0.31
522 0.36
523 0.35
524 0.34
525 0.3
526 0.3
527 0.29
528 0.36
529 0.37
530 0.31
531 0.28
532 0.27
533 0.26
534 0.23
535 0.23
536 0.19
537 0.15
538 0.15
539 0.15
540 0.14
541 0.14
542 0.15
543 0.15
544 0.13
545 0.11
546 0.1
547 0.09
548 0.11
549 0.11
550 0.09
551 0.09
552 0.12
553 0.15
554 0.16
555 0.18
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.17
560 0.16
561 0.13
562 0.2
563 0.24
564 0.3
565 0.31
566 0.36
567 0.41
568 0.45
569 0.48
570 0.48
571 0.52
572 0.55
573 0.64
574 0.62
575 0.65
576 0.67
577 0.71
578 0.71
579 0.73
580 0.73
581 0.65
582 0.72
583 0.7
584 0.69
585 0.64
586 0.63
587 0.53
588 0.46
589 0.44
590 0.33
591 0.32
592 0.29
593 0.26
594 0.22
595 0.21
596 0.19
597 0.18
598 0.21
599 0.22
600 0.19
601 0.22
602 0.23
603 0.24
604 0.26
605 0.26
606 0.26
607 0.19
608 0.21
609 0.19
610 0.22
611 0.24
612 0.27
613 0.28
614 0.33
615 0.41
616 0.47
617 0.55
618 0.6
619 0.68
620 0.73
621 0.82
622 0.87
623 0.89
624 0.9
625 0.91
626 0.9
627 0.87
628 0.84
629 0.74
630 0.63
631 0.53
632 0.42
633 0.32
634 0.22
635 0.15
636 0.08
637 0.06
638 0.06
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.09
643 0.11
644 0.13
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.14
649 0.15
650 0.16
651 0.21
652 0.26
653 0.34
654 0.4
655 0.43
656 0.45
657 0.44
658 0.51
659 0.54
660 0.55
661 0.54
662 0.58
663 0.65
664 0.66
665 0.69
666 0.68
667 0.62
668 0.57
669 0.52
670 0.47
671 0.38
672 0.33