Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HDA3

Protein Details
Accession A0A139HDA3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-212RALYSEKKVKRPRGQKEVKNSRGHFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-203KVKRPRGQK
Subcellular Location(s) cyto 15, pero 7, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036148  MmgE/PrpD_sf  
IPR042183  MmgE/PrpD_sf_1  
IPR042188  MmgE/PrpD_sf_2  
IPR005656  MmgE_PrpD  
IPR045337  MmgE_PrpD_C  
IPR045336  MmgE_PrpD_N  
Gene Ontology GO:0016829  F:lyase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF03972  MmgE_PrpD  
PF19305  MmgE_PrpD_C  
Amino Acid Sequences MHAPKEGAEHKPKTGFFDLPSELRNQIYELAAQDDQAMTRRRKFIIAGCSEIPAFANSCRQIRKEYLAFWIEDRILEIHLNLPLREAEIEKALHCWMSTIGRAVIPFCKSFLLGGIRIRLDPDQFEAHQAFNPNMVTVPGAFQTWHSGPFIETETGWREKRLADEIVSILRAKGEKPYLTADEMESVRALYSEKKVKRPRGQKEVKNSRGHFVGWVKNCARHANDDAATVEVTKALAQFVATAKREQLTRELREKVKEVLIDYIGVAVGGVAHADSTEPIYNAVKAFQGSGSGSSTAIARGSPGLLPQYAALLNAAFAHSLDFDDTYADGTLHAGVTALSAAMTQAELLGSEAPMDDFILAVCVGYEINCRLGRELGFEAYHRGFHNTSTAGIFGAVGAIAVLKRLSVDRVEMAFGLAGSKAGGSMQYLENGSWNKRLHPGFAVHDAFMCVSLAEAGVVGATRILEGKYGFLQAYSPKADKDLHRLVSGLGSEWIWLKSSLKPFPACRMTHTFIEMAGNIGAARKVSAGAIKAIKIKLPPTNLLLVGDPTPNKIHPTNHIDAQFSVYFQVANALLYGSNTGIQAYQKLKDPDIIALCSKTTVATDPALTVFAGWLQVEWSDGHIDEVQMHDALGEVQHPFTRDKVDEKFLSLVEPIFGATRARQVISTIDDLEKHSVCALFSLVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.49
3 0.41
4 0.44
5 0.43
6 0.38
7 0.39
8 0.35
9 0.32
10 0.29
11 0.27
12 0.22
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.17
17 0.2
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.16
22 0.16
23 0.2
24 0.26
25 0.27
26 0.34
27 0.39
28 0.4
29 0.42
30 0.46
31 0.47
32 0.5
33 0.49
34 0.48
35 0.44
36 0.44
37 0.41
38 0.37
39 0.3
40 0.21
41 0.18
42 0.14
43 0.21
44 0.22
45 0.28
46 0.33
47 0.34
48 0.39
49 0.42
50 0.49
51 0.46
52 0.45
53 0.47
54 0.45
55 0.44
56 0.39
57 0.38
58 0.3
59 0.25
60 0.25
61 0.18
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.16
72 0.17
73 0.16
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.16
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.12
84 0.14
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.21
92 0.21
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.2
99 0.2
100 0.21
101 0.23
102 0.26
103 0.26
104 0.26
105 0.28
106 0.25
107 0.22
108 0.2
109 0.21
110 0.21
111 0.2
112 0.25
113 0.24
114 0.23
115 0.24
116 0.24
117 0.21
118 0.19
119 0.19
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.11
124 0.09
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.19
138 0.14
139 0.13
140 0.15
141 0.19
142 0.24
143 0.24
144 0.23
145 0.22
146 0.22
147 0.26
148 0.27
149 0.25
150 0.21
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.22
155 0.19
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.11
160 0.15
161 0.19
162 0.19
163 0.21
164 0.26
165 0.26
166 0.27
167 0.28
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.19
172 0.15
173 0.13
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.15
179 0.24
180 0.29
181 0.38
182 0.48
183 0.57
184 0.66
185 0.74
186 0.77
187 0.79
188 0.85
189 0.83
190 0.85
191 0.86
192 0.85
193 0.84
194 0.76
195 0.68
196 0.6
197 0.53
198 0.46
199 0.41
200 0.4
201 0.33
202 0.38
203 0.36
204 0.38
205 0.4
206 0.39
207 0.35
208 0.32
209 0.32
210 0.31
211 0.31
212 0.28
213 0.27
214 0.23
215 0.21
216 0.17
217 0.14
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.18
232 0.19
233 0.18
234 0.25
235 0.27
236 0.31
237 0.37
238 0.43
239 0.44
240 0.46
241 0.47
242 0.41
243 0.36
244 0.32
245 0.26
246 0.23
247 0.2
248 0.17
249 0.15
250 0.12
251 0.09
252 0.07
253 0.06
254 0.03
255 0.03
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.03
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.02
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.05
354 0.04
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.14
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.15
367 0.14
368 0.16
369 0.13
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.16
374 0.13
375 0.14
376 0.12
377 0.12
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.05
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.03
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.12
418 0.14
419 0.15
420 0.19
421 0.19
422 0.2
423 0.26
424 0.27
425 0.26
426 0.27
427 0.29
428 0.26
429 0.32
430 0.31
431 0.25
432 0.24
433 0.22
434 0.19
435 0.16
436 0.13
437 0.06
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.1
460 0.11
461 0.15
462 0.17
463 0.16
464 0.15
465 0.18
466 0.22
467 0.23
468 0.3
469 0.34
470 0.33
471 0.32
472 0.33
473 0.3
474 0.29
475 0.26
476 0.18
477 0.11
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.15
486 0.22
487 0.25
488 0.29
489 0.33
490 0.34
491 0.42
492 0.48
493 0.43
494 0.43
495 0.47
496 0.46
497 0.43
498 0.43
499 0.35
500 0.28
501 0.29
502 0.23
503 0.16
504 0.12
505 0.1
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.06
510 0.07
511 0.05
512 0.06
513 0.07
514 0.09
515 0.09
516 0.14
517 0.16
518 0.17
519 0.22
520 0.22
521 0.24
522 0.24
523 0.27
524 0.28
525 0.3
526 0.31
527 0.29
528 0.32
529 0.3
530 0.29
531 0.26
532 0.22
533 0.19
534 0.2
535 0.17
536 0.16
537 0.18
538 0.18
539 0.22
540 0.24
541 0.25
542 0.3
543 0.38
544 0.4
545 0.43
546 0.45
547 0.42
548 0.39
549 0.41
550 0.33
551 0.25
552 0.21
553 0.16
554 0.13
555 0.11
556 0.14
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.14
571 0.17
572 0.19
573 0.24
574 0.27
575 0.28
576 0.31
577 0.32
578 0.33
579 0.33
580 0.34
581 0.29
582 0.27
583 0.26
584 0.23
585 0.21
586 0.15
587 0.13
588 0.13
589 0.14
590 0.14
591 0.15
592 0.15
593 0.16
594 0.16
595 0.14
596 0.12
597 0.09
598 0.08
599 0.08
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.1
609 0.12
610 0.12
611 0.13
612 0.12
613 0.14
614 0.14
615 0.12
616 0.12
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.08
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.11
625 0.13
626 0.15
627 0.16
628 0.22
629 0.23
630 0.29
631 0.33
632 0.4
633 0.39
634 0.41
635 0.42
636 0.36
637 0.35
638 0.3
639 0.24
640 0.17
641 0.15
642 0.12
643 0.11
644 0.11
645 0.12
646 0.12
647 0.18
648 0.2
649 0.2
650 0.2
651 0.21
652 0.24
653 0.26
654 0.28
655 0.25
656 0.24
657 0.25
658 0.27
659 0.31
660 0.27
661 0.24
662 0.23
663 0.21
664 0.19
665 0.19